265 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_1260 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_1260  hypothetical protein  100 
 
 		 256 aa  511  1e-144  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.017504 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0324  protein of unknown function DUF45  60.32 
 
 		 263 aa  279  3e-74  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00482569 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0604  protein of unknown function DUF45  54.98 
 
 		 241 aa  261  1e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.068795 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3493  hypothetical protein  56.52 
 
 		 244 aa  259  2e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.718444  normal  0.055231 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0568  protein of unknown function DUF45  55.38 
 
 		 241 aa  259  3e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.237402 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0593  hypothetical protein  54.58 
 
 		 260 aa  258  5.0000000000000005e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0332404  normal  0.0318611 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0064  hypothetical protein  50.6 
 
 		 278 aa  237  1e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0579  protein of unknown function DUF45  50.2 
 
 		 249 aa  237  2e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.452313  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0125  hypothetical protein  49.8 
 
 		 256 aa  236  3e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.84591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0355  hypothetical protein  50.6 
 
 		 279 aa  229  3e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0131  hypothetical protein  48.61 
 
 		 278 aa  220  1.9999999999999999e-56  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.249542 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0228  hypothetical protein  48.61 
 
 		 278 aa  219  3e-56  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.31038  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1837  protein of unknown function DUF45  53.11 
 
 		 247 aa  218  6e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.37826  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0303  hypothetical protein  52.4 
 
 		 266 aa  216  2.9999999999999998e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.037787 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7655  putative metal-dependent hydrolase  54 
 
 		 198 aa  215  5e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.995327  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4887  hypothetical protein  52.28 
 
 		 243 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.334239  normal  0.0174826 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0010  hypothetical protein  42.63 
 
 		 270 aa  191  1e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000896967 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3354  hypothetical protein  45.89 
 
 		 265 aa  188  8e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0668  hypothetical protein  39.37 
 
 		 251 aa  187  2e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2113  hypothetical protein  41.05 
 
 		 253 aa  176  3e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.301869  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2029  hypothetical protein  41.05 
 
 		 255 aa  176  3e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.611915  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0807  hypothetical protein  41.05 
 
 		 253 aa  171  2e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0018  hypothetical protein  39.3 
 
 		 254 aa  165  5.9999999999999996e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4279  protein of unknown function DUF45  39.41 
 
 		 252 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3952  protein of unknown function DUF45  37.7 
 
 		 252 aa  157  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3235  hypothetical protein  39.22 
 
 		 251 aa  156  2e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0982  zinc metallopeptidase-like protein  41.99 
 
 		 228 aa  152  4e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2642  hypothetical protein  41.99 
 
 		 228 aa  152  4e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0508  hypothetical protein  41.7 
 
 		 233 aa  149  6e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.139012 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0430  hypothetical protein  40.1 
 
 		 241 aa  144  1e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0839  hypothetical protein  37.89 
 
 		 237 aa  142  5e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.243328 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1800  protein of unknown function DUF45  39.34 
 
 		 240 aa  138  7e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.322708  normal  0.410252 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3676  hypothetical protein  40 
 
 		 227 aa  137  2e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2986  conserved hypothetical protein DUF45  39.38 
 
 		 230 aa  131  1.0000000000000001e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1339  hypothetical protein  34.26 
 
 		 243 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0094  hypothetical protein  39.39 
 
 		 228 aa  124  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2307  protein of unknown function DUF45  27.85 
 
 		 244 aa  112  5e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0036  protein of unknown function DUF45  28.33 
 
 		 262 aa  106  3e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2977  hypothetical protein  33.62 
 
 		 227 aa  105  9e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0331949 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1707  hypothetical protein  39.82 
 
 		 239 aa  104  1e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.182955  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2855  hypothetical protein  31.58 
 
 		 252 aa  104  1e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0641  hypothetical protein  42.86 
 
 		 236 aa  104  1e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0100  protein of unknown function DUF45  29.66 
 
 		 241 aa  103  2e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1763  protein of unknown function DUF45  48.89 
 
 		 246 aa  100  2e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1824  hypothetical protein  43.69 
 
 		 224 aa  100  3e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0503  hypothetical protein  40.5 
 
 		 224 aa  100  3e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0402  hypothetical protein  33.33 
 
 		 245 aa  99.8  4e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.95027  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2255  zinc metalloprotease  29.74 
 
 		 227 aa  99  6e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0542  hypothetical protein  33.06 
 
 		 243 aa  98.6  8e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4654  hypothetical protein  33.07 
 
 		 239 aa  98.2  1e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.791009  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2744  hypothetical protein  41.9 
 
 		 252 aa  97.1  2e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4297  hypothetical protein  25.73 
 
 		 251 aa  97.1  2e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0431  hypothetical protein  35.64 
 
 		 235 aa  96.7  3e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00811962  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0306  zinc metalloprotease  35.64 
 
 		 235 aa  96.7  3e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1312  hypothetical protein  44.44 
 
 		 234 aa  97.1  3e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0384  zinc metalloprotease  35.64 
 
 		 235 aa  96.7  3e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0625718  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3363  hypothetical protein  31.91 
 
 		 249 aa  97.1  3e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.211491 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0317  hypothetical protein  35.64 
 
 		 235 aa  96.3  4e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0431  hypothetical protein  35.64 
 
 		 235 aa  96.7  4e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2344  hypothetical protein  43.64 
 
 		 217 aa  95.9  5e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.394808 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0309  zinc metalloprotease  34.65 
 
 		 235 aa  94.7  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.122687  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0056  protein of unknown function DUF45  41.44 
 
 		 238 aa  94.7  1e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1069  hypothetical protein  41.67 
 
 		 223 aa  94.4  2e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.262175  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1084  protein of unknown function DUF45  39.66 
 
 		 221 aa  94  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1480  hypothetical protein  32.34 
 
 		 268 aa  94  2e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0379  hypothetical protein  29.13 
 
 		 237 aa  93.6  3e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0322  hypothetical protein  34.65 
 
 		 235 aa  93.6  3e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000118894  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2910  hypothetical protein  39.22 
 
 		 237 aa  93.6  3e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0337  hypothetical protein  34.65 
 
 		 235 aa  93.6  3e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000389941  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0369  hypothetical protein  34.65 
 
 		 235 aa  93.6  3e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04470  predicted metal-dependent hydrolase  38 
 
 		 241 aa  92.8  4e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0870  protein of unknown function DUF45  50.63 
 
 		 224 aa  92.8  5e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0260023  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1102  zinc metalloprotease  32.04 
 
 		 243 aa  92  7e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00846989  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0071  protein of unknown function DUF45  46.43 
 
 		 223 aa  92.4  7e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0151  hypothetical protein  25.4 
 
 		 240 aa  91.7  1e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0413  hypothetical protein  42.05 
 
 		 249 aa  91.3  1e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0373  protein of unknown function DUF45  26.38 
 
 		 242 aa  91.3  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2889  hypothetical protein  39.42 
 
 		 261 aa  90.5  2e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.653746  normal  0.363578 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1843  protein of unknown function DUF45  36.22 
 
 		 254 aa  90.5  2e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.224767 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0504  hypothetical protein  34.21 
 
 		 286 aa  90.1  3e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.22693  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1789  hypothetical protein  36.79 
 
 		 238 aa  90.1  3e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2393  hypothetical protein  39.58 
 
 		 244 aa  89.4  5e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0594  hypothetical protein  39.13 
 
 		 301 aa  89  7e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_159  hypothetical protein  27.31 
 
 		 240 aa  88.6  9e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.363835  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0899  hypothetical protein  42.45 
 
 		 254 aa  87.4  2e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000145532 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0220  hypothetical protein  25.76 
 
 		 240 aa  87.4  2e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6032  hypothetical protein  39.13 
 
 		 316 aa  87.4  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4740  protein of unknown function DUF45  41.38 
 
 		 318 aa  87  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.677282  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2732  hypothetical protein  39.13 
 
 		 295 aa  87.4  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0443  hypothetical protein  35.77 
 
 		 292 aa  87.4  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.618297 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05618  hypothetical protein  45.65 
 
 		 226 aa  87.4  2e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2093  hypothetical protein  39.13 
 
 		 295 aa  87.4  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.786818  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2705  hypothetical protein  39.13 
 
 		 295 aa  87.4  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.319747  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3789  hypothetical protein  33.61 
 
 		 235 aa  87.4  2e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0568  hypothetical protein  38.54 
 
 		 235 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000566322 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2818  hypothetical protein  32.71 
 
 		 240 aa  86.7  3e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.608131  normal  0.17098 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2757  hypothetical protein  39.13 
 
 		 303 aa  87  3e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.328108  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4016  hypothetical protein  36.03 
 
 		 300 aa  86.3  4e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00585617  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2166  hypothetical protein  43.93 
 
 		 310 aa  86.3  4e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.221845  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0877  hypothetical protein  38.81 
 
 		 292 aa  86.3  5e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>