278 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2744 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_2744  hypothetical protein  100 
 
 
252 aa  513  1.0000000000000001e-145  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0036  protein of unknown function DUF45  44.87 
 
 
262 aa  203  3e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0373  protein of unknown function DUF45  40.08 
 
 
242 aa  178  7e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2307  protein of unknown function DUF45  40.09 
 
 
244 aa  174  1.9999999999999998e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0402  hypothetical protein  36.02 
 
 
285 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.450593  normal  0.256851 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_159  hypothetical protein  34.91 
 
 
240 aa  150  1e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.363835  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0581  hypothetical protein  34.6 
 
 
295 aa  149  3e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4016  hypothetical protein  34.62 
 
 
300 aa  149  6e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00585617  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0594  hypothetical protein  33.33 
 
 
301 aa  148  7e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0877  hypothetical protein  33.76 
 
 
292 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0215  hypothetical protein  33.76 
 
 
292 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.585984  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2427  hypothetical protein  33.76 
 
 
292 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.656656  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0698  hypothetical protein  33.76 
 
 
292 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0713  hypothetical protein  33.76 
 
 
292 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0683  protein of unknown function DUF45  34.62 
 
 
300 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.436167  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04470  predicted metal-dependent hydrolase  33.89 
 
 
241 aa  147  2.0000000000000003e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2731  hypothetical protein  33.76 
 
 
292 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.896479  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2347  hypothetical protein  33.76 
 
 
292 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0151  hypothetical protein  34.05 
 
 
240 aa  146  3e-34  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0220  hypothetical protein  35.22 
 
 
240 aa  144  1e-33  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0521  hypothetical protein  34.82 
 
 
288 aa  144  1e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0129218 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0379  hypothetical protein  36.65 
 
 
237 aa  144  1e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0839  hypothetical protein  33.2 
 
 
237 aa  144  1e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.243328 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0412  protein of unknown function DUF45  35.77 
 
 
292 aa  143  2e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.505198  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2794  protein of unknown function DUF45  31.25 
 
 
242 aa  144  2e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0182535  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2093  hypothetical protein  35.59 
 
 
295 aa  143  2e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.786818  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2705  hypothetical protein  35.59 
 
 
295 aa  143  2e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.319747  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0397  protein of unknown function DUF45  35.77 
 
 
292 aa  144  2e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.119001  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0100  protein of unknown function DUF45  35.04 
 
 
241 aa  143  3e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3538  hypothetical protein  35.04 
 
 
239 aa  142  4e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.739224  normal  0.0386409 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0542  hypothetical protein  32.79 
 
 
243 aa  142  4e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6032  hypothetical protein  35.17 
 
 
316 aa  141  8e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2732  hypothetical protein  35.17 
 
 
295 aa  141  8e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2757  hypothetical protein  33.06 
 
 
303 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.328108  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2622  hypothetical protein  32.66 
 
 
285 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.276697  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0443  hypothetical protein  31.97 
 
 
292 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.618297 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0018  hypothetical protein  32.78 
 
 
254 aa  139  3.9999999999999997e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0899  hypothetical protein  37.33 
 
 
254 aa  137  2e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  hitchhiker  0.000145532 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2889  hypothetical protein  34 
 
 
261 aa  137  2e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.653746  normal  0.363578 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1312  hypothetical protein  35.48 
 
 
234 aa  136  3.0000000000000003e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05618  hypothetical protein  32.3 
 
 
226 aa  136  4e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0056  protein of unknown function DUF45  34.62 
 
 
238 aa  135  5e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3952  protein of unknown function DUF45  30.65 
 
 
252 aa  135  8e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2910  hypothetical protein  31.54 
 
 
237 aa  135  9e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1102  zinc metalloprotease  31.28 
 
 
243 aa  135  9e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00846989  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0504  hypothetical protein  32.4 
 
 
286 aa  134  9.999999999999999e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.22693  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3235  hypothetical protein  31.03 
 
 
251 aa  133  3e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0604  protein of unknown function DUF45  32.71 
 
 
241 aa  132  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.068795 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1789  hypothetical protein  34.09 
 
 
238 aa  132  6.999999999999999e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0593  hypothetical protein  32.71 
 
 
260 aa  132  6.999999999999999e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0332404  normal  0.0318611 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0800  hypothetical protein  32.26 
 
 
237 aa  131  9e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0356506  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0843  hypothetical protein  30 
 
 
246 aa  130  2.0000000000000002e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.335069  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4279  protein of unknown function DUF45  30.24 
 
 
252 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0791  hypothetical protein  30 
 
 
246 aa  130  2.0000000000000002e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.371001  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3676  hypothetical protein  30.4 
 
 
227 aa  130  2.0000000000000002e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR2113  hypothetical protein  32.92 
 
 
253 aa  130  3e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.301869  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2029  hypothetical protein  32.92 
 
 
255 aa  130  3e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.611915  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2393  hypothetical protein  32.59 
 
 
244 aa  129  5.0000000000000004e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3493  hypothetical protein  30.25 
 
 
244 aa  129  6e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.718444  normal  0.055231 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1824  hypothetical protein  34.1 
 
 
224 aa  128  9.000000000000001e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2595  hypothetical protein  28.27 
 
 
238 aa  127  1.0000000000000001e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.23171  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3789  hypothetical protein  36.65 
 
 
235 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1837  protein of unknown function DUF45  31.43 
 
 
247 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.37826  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4740  protein of unknown function DUF45  31.06 
 
 
318 aa  127  2.0000000000000002e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.677282  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1084  protein of unknown function DUF45  34.07 
 
 
221 aa  127  2.0000000000000002e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0982  zinc metallopeptidase-like protein  30.26 
 
 
228 aa  126  3e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2642  hypothetical protein  30.26 
 
 
228 aa  127  3e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0503  hypothetical protein  34.1 
 
 
224 aa  126  3e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0568  protein of unknown function DUF45  31.78 
 
 
241 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.237402 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3377  hypothetical protein  33.61 
 
 
320 aa  125  9e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.577966 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0064  hypothetical protein  32 
 
 
278 aa  125  9e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0303  hypothetical protein  29.09 
 
 
266 aa  123  2e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.037787 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4887  hypothetical protein  29.46 
 
 
243 aa  123  2e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.334239  normal  0.0174826 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0807  hypothetical protein  33.19 
 
 
253 aa  124  2e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1661  protein of unknown function DUF45  30.45 
 
 
244 aa  123  3e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.843742  normal  0.112904 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2986  conserved hypothetical protein DUF45  33.33 
 
 
230 aa  123  4e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0870  protein of unknown function DUF45  33.64 
 
 
224 aa  123  4e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0260023  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0125  hypothetical protein  31.5 
 
 
256 aa  122  5e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.84591  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1339  hypothetical protein  39.79 
 
 
243 aa  122  6e-27  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3354  hypothetical protein  28.88 
 
 
265 aa  122  7e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0547  hypothetical protein  33.33 
 
 
218 aa  122  8e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.825313  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1069  hypothetical protein  33.18 
 
 
223 aa  120  1.9999999999999998e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.262175  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0579  protein of unknown function DUF45  32 
 
 
249 aa  120  3e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.452313  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0071  protein of unknown function DUF45  38.41 
 
 
223 aa  119  3.9999999999999996e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0641  hypothetical protein  32.46 
 
 
236 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3692  hypothetical protein  31.93 
 
 
314 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.349516  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0010  hypothetical protein  28.17 
 
 
270 aa  119  6e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000896967 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0413  hypothetical protein  33.92 
 
 
249 aa  118  7e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0094  hypothetical protein  32.76 
 
 
228 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0212  hypothetical protein  31.84 
 
 
321 aa  117  1.9999999999999998e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0964391 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4297  hypothetical protein  37.67 
 
 
251 aa  116  3e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0508  hypothetical protein  31.14 
 
 
233 aa  117  3e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.139012 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2274  protein of unknown function DUF45  32.61 
 
 
243 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2959  protein of unknown function DUF45  28.32 
 
 
227 aa  115  5e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3143  protein of unknown function DUF45  28.32 
 
 
227 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0570436  normal  0.976092 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0668  hypothetical protein  30.04 
 
 
251 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1843  protein of unknown function DUF45  27.95 
 
 
254 aa  113  2.0000000000000002e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.224767 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1707  hypothetical protein  28.19 
 
 
239 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.182955  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0448  hypothetical protein  30.49 
 
 
319 aa  112  4.0000000000000004e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0369  hypothetical protein  28.18 
 
 
235 aa  112  5e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>