257 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_0508 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008044  TM1040_0508  hypothetical protein  100 
 
 
233 aa  465  9.999999999999999e-131  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.139012 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2642  hypothetical protein  59.11 
 
 
228 aa  256  3e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0982  zinc metallopeptidase-like protein  59.11 
 
 
228 aa  254  7e-67  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2986  conserved hypothetical protein DUF45  52.61 
 
 
230 aa  225  5.0000000000000005e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0094  hypothetical protein  57.78 
 
 
228 aa  220  9.999999999999999e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0839  hypothetical protein  49.78 
 
 
237 aa  216  2.9999999999999998e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.243328 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3676  hypothetical protein  49.77 
 
 
227 aa  193  2e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0568  protein of unknown function DUF45  43.61 
 
 
241 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.237402 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0604  protein of unknown function DUF45  43.17 
 
 
241 aa  165  6.9999999999999995e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.068795 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0593  hypothetical protein  43.17 
 
 
260 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0332404  normal  0.0318611 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3493  hypothetical protein  41.63 
 
 
244 aa  157  1e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.718444  normal  0.055231 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3235  hypothetical protein  39.46 
 
 
251 aa  157  1e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3354  hypothetical protein  42.22 
 
 
265 aa  150  1e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4887  hypothetical protein  42.58 
 
 
243 aa  150  2e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.334239  normal  0.0174826 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1260  hypothetical protein  41.7 
 
 
256 aa  149  5e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.017504 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0324  protein of unknown function DUF45  41.78 
 
 
263 aa  146  3e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00482569 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0303  hypothetical protein  41.81 
 
 
266 aa  146  3e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.037787 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1837  protein of unknown function DUF45  40.67 
 
 
247 aa  143  2e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.37826  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0010  hypothetical protein  38.1 
 
 
270 aa  140  1.9999999999999998e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000896967 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2977  hypothetical protein  39.73 
 
 
227 aa  139  3e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0331949 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0064  hypothetical protein  41.06 
 
 
278 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0125  hypothetical protein  40.58 
 
 
256 aa  138  8.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.84591  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0131  hypothetical protein  40.09 
 
 
278 aa  137  1e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.249542 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0018  hypothetical protein  35.47 
 
 
254 aa  136  3.0000000000000003e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2113  hypothetical protein  34.55 
 
 
253 aa  136  4e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.301869  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2029  hypothetical protein  34.55 
 
 
255 aa  135  4e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.611915  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0228  hypothetical protein  39.62 
 
 
278 aa  135  4e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.31038  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0355  hypothetical protein  38.46 
 
 
279 aa  135  8e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0579  protein of unknown function DUF45  40.58 
 
 
249 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.452313  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3952  protein of unknown function DUF45  33.91 
 
 
252 aa  132  5e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7655  putative metal-dependent hydrolase  40.4 
 
 
198 aa  131  6.999999999999999e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.995327  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0668  hypothetical protein  34.36 
 
 
251 aa  130  1.0000000000000001e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1339  hypothetical protein  34.58 
 
 
243 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4279  protein of unknown function DUF45  33.04 
 
 
252 aa  129  4.0000000000000003e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0807  hypothetical protein  35.21 
 
 
253 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2818  hypothetical protein  39.5 
 
 
240 aa  125  4.0000000000000003e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.608131  normal  0.17098 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0594  hypothetical protein  39.8 
 
 
301 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2622  hypothetical protein  39.6 
 
 
285 aa  124  1e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.276697  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2093  hypothetical protein  38.71 
 
 
295 aa  123  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.786818  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2757  hypothetical protein  39.11 
 
 
303 aa  123  2e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.328108  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2705  hypothetical protein  38.71 
 
 
295 aa  123  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.319747  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1800  protein of unknown function DUF45  41.29 
 
 
240 aa  123  3e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.322708  normal  0.410252 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6032  hypothetical protein  38.61 
 
 
316 aa  123  3e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2732  hypothetical protein  38.61 
 
 
295 aa  123  3e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2744  hypothetical protein  31.14 
 
 
252 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4654  hypothetical protein  36.28 
 
 
239 aa  116  3e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.791009  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0443  hypothetical protein  36.2 
 
 
292 aa  116  3.9999999999999997e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.618297 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0430  hypothetical protein  36.63 
 
 
241 aa  115  6e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0504  hypothetical protein  34.84 
 
 
286 aa  113  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.22693  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4016  hypothetical protein  35.62 
 
 
300 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00585617  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0683  protein of unknown function DUF45  35.78 
 
 
300 aa  112  5e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.436167  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0581  hypothetical protein  35.96 
 
 
295 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0036  protein of unknown function DUF45  30.17 
 
 
262 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0215  hypothetical protein  35.96 
 
 
292 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.585984  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0877  hypothetical protein  35.96 
 
 
292 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0713  hypothetical protein  35.96 
 
 
292 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2427  hypothetical protein  35.96 
 
 
292 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.656656  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2731  hypothetical protein  35.96 
 
 
292 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.896479  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2347  hypothetical protein  35.96 
 
 
292 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0698  hypothetical protein  35.96 
 
 
292 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1707  hypothetical protein  27.51 
 
 
239 aa  109  3e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.182955  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1763  protein of unknown function DUF45  32.83 
 
 
246 aa  109  3e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0412  protein of unknown function DUF45  33.63 
 
 
292 aa  109  3e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.505198  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0397  protein of unknown function DUF45  33.63 
 
 
292 aa  109  3e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.119001  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0402  hypothetical protein  34.1 
 
 
285 aa  108  6e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.450593  normal  0.256851 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2855  hypothetical protein  31.34 
 
 
252 aa  105  8e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0521  hypothetical protein  34.21 
 
 
288 aa  104  1e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0129218 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0542  hypothetical protein  28.57 
 
 
243 aa  104  1e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1084  protein of unknown function DUF45  39.46 
 
 
221 aa  103  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1480  hypothetical protein  32 
 
 
268 aa  102  4e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04470  predicted metal-dependent hydrolase  26.81 
 
 
241 aa  102  7e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2107  hypothetical protein  35.84 
 
 
240 aa  102  7e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2307  protein of unknown function DUF45  28.63 
 
 
244 aa  102  7e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0220  hypothetical protein  31.02 
 
 
240 aa  101  1e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4297  hypothetical protein  28.09 
 
 
251 aa  100  1e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0379  hypothetical protein  29.33 
 
 
237 aa  100  1e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0151  hypothetical protein  30.09 
 
 
240 aa  100  2e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0413  hypothetical protein  28.44 
 
 
249 aa  100  2e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1312  hypothetical protein  28.99 
 
 
234 aa  100  3e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0100  protein of unknown function DUF45  30.04 
 
 
241 aa  100  3e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3363  hypothetical protein  32.16 
 
 
249 aa  99.4  4e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.211491 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1181  protein of unknown function DUF45  34.78 
 
 
242 aa  99.4  5e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1824  hypothetical protein  37.74 
 
 
224 aa  99  5e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0503  hypothetical protein  36.19 
 
 
224 aa  99  6e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0373  protein of unknown function DUF45  25.62 
 
 
242 aa  98.6  7e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3538  hypothetical protein  35.07 
 
 
239 aa  97.8  1e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.739224  normal  0.0386409 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0056  protein of unknown function DUF45  33.33 
 
 
238 aa  97.4  2e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0641  hypothetical protein  32.27 
 
 
236 aa  97.4  2e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0899  hypothetical protein  31.39 
 
 
254 aa  95.5  6e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  hitchhiker  0.000145532 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2889  hypothetical protein  29.51 
 
 
261 aa  95.5  6e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.653746  normal  0.363578 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3789  hypothetical protein  28.94 
 
 
235 aa  95.5  6e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1789  hypothetical protein  25.7 
 
 
238 aa  94.7  1e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_159  hypothetical protein  30.09 
 
 
240 aa  94.4  1e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.363835  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1102  zinc metalloprotease  38.68 
 
 
243 aa  94.4  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00846989  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1069  hypothetical protein  37.14 
 
 
223 aa  94  2e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.262175  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0547  hypothetical protein  30.7 
 
 
218 aa  93.2  3e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.825313  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0870  protein of unknown function DUF45  33.96 
 
 
224 aa  92.8  4e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0260023  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2910  hypothetical protein  28.17 
 
 
237 aa  91.7  8e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2928  hypothetical protein  29.59 
 
 
219 aa  90.1  3e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2293  hypothetical protein  37.41 
 
 
227 aa  90.1  3e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>