263 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_0125 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_0125  hypothetical protein  100 
 
 		 256 aa  523  1e-148  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.84591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0064  hypothetical protein  96.88 
 
 		 278 aa  486  1e-136  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0579  protein of unknown function DUF45  92.71 
 
 		 249 aa  454  1e-127  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.452313  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0355  hypothetical protein  85.6 
 
 		 279 aa  434  1e-121  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0131  hypothetical protein  80.86 
 
 		 278 aa  403  1e-111  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.249542 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0228  hypothetical protein  80.86 
 
 		 278 aa  402  1e-111  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.31038  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7655  putative metal-dependent hydrolase  83.33 
 
 		 198 aa  339  2e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.995327  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0604  protein of unknown function DUF45  50.82 
 
 		 241 aa  242  3.9999999999999997e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.068795 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1260  hypothetical protein  49.8 
 
 		 256 aa  242  3.9999999999999997e-63  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.017504 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0593  hypothetical protein  50.82 
 
 		 260 aa  241  1e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0332404  normal  0.0318611 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0568  protein of unknown function DUF45  51.64 
 
 		 241 aa  240  1e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.237402 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0303  hypothetical protein  50.2 
 
 		 266 aa  238  5e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.037787 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3493  hypothetical protein  50.41 
 
 		 244 aa  234  7e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.718444  normal  0.055231 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0324  protein of unknown function DUF45  47.84 
 
 		 263 aa  231  7.000000000000001e-60  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00482569 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4887  hypothetical protein  48.97 
 
 		 243 aa  221  7e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.334239  normal  0.0174826 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1837  protein of unknown function DUF45  48.36 
 
 		 247 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.37826  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3952  protein of unknown function DUF45  40.68 
 
 		 252 aa  193  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4279  protein of unknown function DUF45  40.25 
 
 		 252 aa  192  3e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2029  hypothetical protein  40.4 
 
 		 255 aa  192  4e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.611915  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2113  hypothetical protein  40.4 
 
 		 253 aa  192  5e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.301869  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0018  hypothetical protein  41.1 
 
 		 254 aa  192  6e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0668  hypothetical protein  41.53 
 
 		 251 aa  190  2e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0807  hypothetical protein  42.47 
 
 		 253 aa  182  7e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3354  hypothetical protein  45.06 
 
 		 265 aa  182  7e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3235  hypothetical protein  41.04 
 
 		 251 aa  179  4e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0010  hypothetical protein  40.64 
 
 		 270 aa  178  1e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000896967 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0982  zinc metallopeptidase-like protein  41.45 
 
 		 228 aa  167  1e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2642  hypothetical protein  41.03 
 
 		 228 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1339  hypothetical protein  38.86 
 
 		 243 aa  161  7e-39  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2986  conserved hypothetical protein DUF45  42.37 
 
 		 230 aa  161  1e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0839  hypothetical protein  38.74 
 
 		 237 aa  151  1e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.243328 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0094  hypothetical protein  41.88 
 
 		 228 aa  149  4e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3676  hypothetical protein  39.81 
 
 		 227 aa  147  1.0000000000000001e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1800  protein of unknown function DUF45  40.78 
 
 		 240 aa  144  1e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.322708  normal  0.410252 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0508  hypothetical protein  40 
 
 		 233 aa  144  1e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.139012 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0430  hypothetical protein  36.14 
 
 		 241 aa  131  1.0000000000000001e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2744  hypothetical protein  29.41 
 
 		 252 aa  126  3e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2977  hypothetical protein  35.4 
 
 		 227 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0331949 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2818  hypothetical protein  34.69 
 
 		 240 aa  116  3.9999999999999997e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.608131  normal  0.17098 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0100  protein of unknown function DUF45  36.94 
 
 		 241 aa  116  3.9999999999999997e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1480  hypothetical protein  34.22 
 
 		 268 aa  114  1.0000000000000001e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1789  hypothetical protein  29.96 
 
 		 238 aa  113  3e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4654  hypothetical protein  33.92 
 
 		 239 aa  112  4.0000000000000004e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.791009  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0504  hypothetical protein  31.53 
 
 		 286 aa  108  7.000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.22693  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1763  protein of unknown function DUF45  29.18 
 
 		 246 aa  108  8.000000000000001e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0542  hypothetical protein  27.87 
 
 		 243 aa  108  9.000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0151  hypothetical protein  29.75 
 
 		 240 aa  107  1e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0413  hypothetical protein  29.84 
 
 		 249 aa  108  1e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0443  hypothetical protein  30.63 
 
 		 292 aa  106  3e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.618297 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2855  hypothetical protein  30 
 
 		 252 aa  106  4e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1824  hypothetical protein  30.04 
 
 		 224 aa  106  5e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2307  protein of unknown function DUF45  28.05 
 
 		 244 aa  105  7e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4016  hypothetical protein  31.68 
 
 		 300 aa  105  7e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00585617  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1181  protein of unknown function DUF45  33.67 
 
 		 242 aa  105  9e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0641  hypothetical protein  35.85 
 
 		 236 aa  104  1e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0036  protein of unknown function DUF45  26.76 
 
 		 262 aa  103  4e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0683  protein of unknown function DUF45  31.19 
 
 		 300 aa  103  4e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.436167  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0060  protein of unknown function DUF45  31.05 
 
 		 259 aa  102  5e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0071  protein of unknown function DUF45  29.11 
 
 		 223 aa  102  5e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1951  hypothetical protein  27.8 
 
 		 481 aa  102  6e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2107  hypothetical protein  33.17 
 
 		 240 aa  102  6e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0373  protein of unknown function DUF45  26.1 
 
 		 242 aa  101  1e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0402  hypothetical protein  33.19 
 
 		 245 aa  100  2e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.95027  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4297  hypothetical protein  33.87 
 
 		 251 aa  100  2e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2959  protein of unknown function DUF45  39.81 
 
 		 227 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_159  hypothetical protein  30.61 
 
 		 240 aa  100  3e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.363835  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0220  hypothetical protein  29.86 
 
 		 240 aa  100  3e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0521  hypothetical protein  29.49 
 
 		 288 aa  99.4  5e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0129218 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3143  protein of unknown function DUF45  38.89 
 
 		 227 aa  99  6e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0570436  normal  0.976092 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0402  hypothetical protein  29.6 
 
 		 285 aa  98.6  9e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.450593  normal  0.256851 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0397  protein of unknown function DUF45  29.22 
 
 		 292 aa  98.6  1e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.119001  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1707  hypothetical protein  26.84 
 
 		 239 aa  98.2  1e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.182955  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2255  zinc metalloprotease  30.54 
 
 		 227 aa  97.8  1e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0412  protein of unknown function DUF45  29.22 
 
 		 292 aa  98.2  1e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.505198  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1312  hypothetical protein  33.33 
 
 		 234 aa  97.1  2e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2393  hypothetical protein  27.16 
 
 		 244 aa  97.4  2e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04470  predicted metal-dependent hydrolase  27.69 
 
 		 241 aa  97.1  3e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2910  hypothetical protein  27.16 
 
 		 237 aa  97.1  3e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3789  hypothetical protein  31.28 
 
 		 235 aa  96.3  4e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0547  hypothetical protein  29.82 
 
 		 218 aa  96.3  5e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.825313  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0503  hypothetical protein  28.18 
 
 		 224 aa  95.9  5e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0594  hypothetical protein  30.36 
 
 		 301 aa  95.1  9e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3538  hypothetical protein  29.47 
 
 		 239 aa  94.7  1e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.739224  normal  0.0386409 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2093  hypothetical protein  30.63 
 
 		 295 aa  94.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.786818  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2705  hypothetical protein  30.63 
 
 		 295 aa  94.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.319747  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3377  hypothetical protein  43.27 
 
 		 320 aa  94.4  2e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.577966 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6032  hypothetical protein  37.19 
 
 		 316 aa  93.6  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1843  protein of unknown function DUF45  32.79 
 
 		 254 aa  93.6  3e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.224767 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0870  protein of unknown function DUF45  27.93 
 
 		 224 aa  93.6  3e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0260023  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2732  hypothetical protein  37.19 
 
 		 295 aa  93.2  3e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2757  hypothetical protein  37.19 
 
 		 303 aa  92.8  4e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.328108  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1102  zinc metalloprotease  37 
 
 		 243 aa  92.4  6e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00846989  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2622  hypothetical protein  30.18 
 
 		 285 aa  92.4  7e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.276697  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1084  protein of unknown function DUF45  32.76 
 
 		 221 aa  92.4  7e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2595  hypothetical protein  24.89 
 
 		 238 aa  92  7e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.23171  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0877  hypothetical protein  28.18 
 
 		 292 aa  91.3  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0698  hypothetical protein  28.18 
 
 		 292 aa  91.3  1e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0713  hypothetical protein  28.18 
 
 		 292 aa  91.3  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2731  hypothetical protein  28.18 
 
 		 292 aa  91.3  1e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.896479  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2347  hypothetical protein  28.18 
 
 		 292 aa  91.3  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>