More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_0402 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010622  Bphy_0402  hypothetical protein  100 
 
 
285 aa  581  1.0000000000000001e-165  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.450593  normal  0.256851 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0683  protein of unknown function DUF45  77.67 
 
 
300 aa  470  1e-132  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.436167  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4016  hypothetical protein  77 
 
 
300 aa  467  1.0000000000000001e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00585617  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2732  hypothetical protein  70.37 
 
 
295 aa  412  1e-114  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2093  hypothetical protein  70.03 
 
 
295 aa  411  1e-114  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.786818  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2705  hypothetical protein  70.03 
 
 
295 aa  411  1e-114  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.319747  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6032  hypothetical protein  69.36 
 
 
316 aa  407  1e-113  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0215  hypothetical protein  70.55 
 
 
292 aa  404  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.585984  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2347  hypothetical protein  70.55 
 
 
292 aa  404  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0877  hypothetical protein  70.89 
 
 
292 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2427  hypothetical protein  70.55 
 
 
292 aa  404  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.656656  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0594  hypothetical protein  68.42 
 
 
301 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0581  hypothetical protein  69.15 
 
 
295 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2731  hypothetical protein  70.55 
 
 
292 aa  404  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.896479  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0698  hypothetical protein  70.55 
 
 
292 aa  404  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2757  hypothetical protein  66.34 
 
 
303 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.328108  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0713  hypothetical protein  70.55 
 
 
292 aa  404  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2622  hypothetical protein  75.41 
 
 
285 aa  393  1e-108  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.276697  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0521  hypothetical protein  67.06 
 
 
288 aa  348  4e-95  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0129218 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0397  protein of unknown function DUF45  60.76 
 
 
292 aa  347  1e-94  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.119001  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0412  protein of unknown function DUF45  61.11 
 
 
292 aa  347  1e-94  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.505198  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0443  hypothetical protein  57.64 
 
 
292 aa  347  1e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.618297 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0504  hypothetical protein  57.54 
 
 
286 aa  341  5.999999999999999e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.22693  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3377  hypothetical protein  48.98 
 
 
320 aa  236  2e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.577966 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4740  protein of unknown function DUF45  48.73 
 
 
318 aa  228  1e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.677282  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4199  hypothetical protein  45.24 
 
 
340 aa  222  6e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0212  hypothetical protein  47.15 
 
 
321 aa  220  1.9999999999999999e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0964391 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0448  hypothetical protein  46.78 
 
 
319 aa  214  9e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0547  protein of unknown function DUF45  42.81 
 
 
306 aa  214  9.999999999999999e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0531  hypothetical protein  42.45 
 
 
306 aa  212  4.9999999999999996e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.10161 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4173  hypothetical protein  43.88 
 
 
303 aa  208  7e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.282875 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3692  hypothetical protein  43.03 
 
 
314 aa  206  3e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.349516  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2166  hypothetical protein  45.87 
 
 
310 aa  204  1e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.221845  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0641  hypothetical protein  43.84 
 
 
236 aa  178  1e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1292  hypothetical protein  41.35 
 
 
308 aa  173  1.9999999999999998e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.232025 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0547  hypothetical protein  42.92 
 
 
218 aa  171  1e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.825313  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3538  hypothetical protein  40.74 
 
 
239 aa  160  3e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.739224  normal  0.0386409 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2307  protein of unknown function DUF45  36.29 
 
 
244 aa  152  5.9999999999999996e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2744  hypothetical protein  36.02 
 
 
252 aa  152  7e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2107  hypothetical protein  33.19 
 
 
240 aa  142  8e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2889  hypothetical protein  32.66 
 
 
261 aa  138  1e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.653746  normal  0.363578 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1181  protein of unknown function DUF45  37.38 
 
 
242 aa  135  9e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0542  hypothetical protein  31.95 
 
 
243 aa  134  9.999999999999999e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04470  predicted metal-dependent hydrolase  28.15 
 
 
241 aa  129  6e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0036  protein of unknown function DUF45  32.78 
 
 
262 aa  128  9.000000000000001e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0373  protein of unknown function DUF45  32.05 
 
 
242 aa  127  3e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4297  hypothetical protein  30.43 
 
 
251 aa  124  1e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4279  protein of unknown function DUF45  30.43 
 
 
252 aa  122  9e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0593  hypothetical protein  34.23 
 
 
260 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0332404  normal  0.0318611 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0604  protein of unknown function DUF45  34.23 
 
 
241 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.068795 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1789  hypothetical protein  31.53 
 
 
238 aa  120  3.9999999999999996e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0151  hypothetical protein  33.05 
 
 
240 aa  119  7e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2344  hypothetical protein  36.32 
 
 
217 aa  119  7.999999999999999e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.394808 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05618  hypothetical protein  31.56 
 
 
226 aa  119  7.999999999999999e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3952  protein of unknown function DUF45  29.41 
 
 
252 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3354  hypothetical protein  36.82 
 
 
265 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0379  hypothetical protein  28.7 
 
 
237 aa  117  3e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0220  hypothetical protein  32.76 
 
 
240 aa  116  3e-25  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1102  zinc metalloprotease  35.05 
 
 
243 aa  116  5e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00846989  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1824  hypothetical protein  33.18 
 
 
224 aa  115  6.9999999999999995e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_159  hypothetical protein  30.64 
 
 
240 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.363835  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3493  hypothetical protein  35.12 
 
 
244 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.718444  normal  0.055231 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0018  hypothetical protein  33.64 
 
 
254 aa  114  2.0000000000000002e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0568  protein of unknown function DUF45  33.78 
 
 
241 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.237402 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2910  hypothetical protein  25.65 
 
 
237 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0071  protein of unknown function DUF45  31.22 
 
 
223 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4036  hypothetical protein  29.57 
 
 
234 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0100  protein of unknown function DUF45  30.8 
 
 
241 aa  110  3e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2959  protein of unknown function DUF45  28.44 
 
 
227 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0899  hypothetical protein  35.29 
 
 
254 aa  109  5e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  hitchhiker  0.000145532 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3143  protein of unknown function DUF45  27.98 
 
 
227 aa  108  9.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0570436  normal  0.976092 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1763  protein of unknown function DUF45  33.48 
 
 
246 aa  108  1e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0508  hypothetical protein  34.1 
 
 
233 aa  108  1e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.139012 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2794  protein of unknown function DUF45  29.29 
 
 
242 aa  107  2e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0182535  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1312  hypothetical protein  30.22 
 
 
234 aa  107  2e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1069  hypothetical protein  32.57 
 
 
223 aa  106  4e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.262175  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0843  hypothetical protein  28.95 
 
 
246 aa  106  5e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.335069  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0791  hypothetical protein  28.95 
 
 
246 aa  106  5e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.371001  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1800  protein of unknown function DUF45  35.2 
 
 
240 aa  105  6e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.322708  normal  0.410252 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4887  hypothetical protein  35.6 
 
 
243 aa  105  1e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.334239  normal  0.0174826 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0303  hypothetical protein  33.98 
 
 
266 aa  105  1e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.037787 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0503  hypothetical protein  29.63 
 
 
224 aa  105  1e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0870  protein of unknown function DUF45  30.84 
 
 
224 aa  105  1e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0260023  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1837  protein of unknown function DUF45  34.29 
 
 
247 aa  104  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.37826  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0100  hypothetical protein  28.76 
 
 
231 aa  104  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.58057  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1707  hypothetical protein  30.67 
 
 
239 aa  103  4e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.182955  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3235  hypothetical protein  27.82 
 
 
251 aa  103  4e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0839  hypothetical protein  30.14 
 
 
237 aa  102  6e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.243328 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0413  hypothetical protein  29.39 
 
 
249 aa  102  6e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2255  zinc metalloprotease  31.53 
 
 
227 aa  102  9e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0568  hypothetical protein  26.36 
 
 
235 aa  100  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000566322 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2393  hypothetical protein  25.39 
 
 
244 aa  101  2e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0800  hypothetical protein  26.43 
 
 
237 aa  101  2e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0356506  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3789  hypothetical protein  28.11 
 
 
235 aa  100  2e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0668  hypothetical protein  27.98 
 
 
251 aa  99.4  6e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1339  hypothetical protein  30.66 
 
 
243 aa  98.6  9e-20  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0064  hypothetical protein  31.71 
 
 
278 aa  98.6  1e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2855  hypothetical protein  30.47 
 
 
252 aa  98.6  1e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2274  protein of unknown function DUF45  31.94 
 
 
243 aa  98.2  1e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2484  hypothetical protein  28.09 
 
 
245 aa  97.8  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.186682  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>