More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A0547 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007614  Nmul_A0547  hypothetical protein  100 
 
 
218 aa  448  1e-125  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.825313  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0581  hypothetical protein  43.18 
 
 
295 aa  171  6.999999999999999e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0402  hypothetical protein  42.92 
 
 
285 aa  171  6.999999999999999e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.450593  normal  0.256851 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0594  hypothetical protein  42.92 
 
 
301 aa  170  1e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0713  hypothetical protein  43.38 
 
 
292 aa  169  2e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2427  hypothetical protein  43.38 
 
 
292 aa  169  2e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.656656  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0215  hypothetical protein  43.38 
 
 
292 aa  169  2e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.585984  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2731  hypothetical protein  43.38 
 
 
292 aa  169  2e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.896479  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0877  hypothetical protein  43.38 
 
 
292 aa  169  2e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0698  hypothetical protein  43.38 
 
 
292 aa  169  2e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2347  hypothetical protein  43.38 
 
 
292 aa  169  2e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0683  protein of unknown function DUF45  44.95 
 
 
300 aa  168  5e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.436167  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3538  hypothetical protein  41.74 
 
 
239 aa  167  2e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.739224  normal  0.0386409 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4016  hypothetical protein  43.12 
 
 
300 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00585617  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6032  hypothetical protein  43.69 
 
 
316 aa  162  3e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2093  hypothetical protein  43.69 
 
 
295 aa  162  3e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.786818  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2757  hypothetical protein  43.44 
 
 
303 aa  162  3e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.328108  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2705  hypothetical protein  43.69 
 
 
295 aa  162  3e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.319747  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2732  hypothetical protein  43.69 
 
 
295 aa  162  3e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2622  hypothetical protein  42.99 
 
 
285 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.276697  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0547  protein of unknown function DUF45  42.08 
 
 
306 aa  161  6e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0443  hypothetical protein  40.37 
 
 
292 aa  161  9e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.618297 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0531  hypothetical protein  41.63 
 
 
306 aa  160  1e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.10161 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0521  hypothetical protein  40.83 
 
 
288 aa  159  4e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0129218 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2166  hypothetical protein  40.89 
 
 
310 aa  158  7e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.221845  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0641  hypothetical protein  40.38 
 
 
236 aa  157  9e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0504  hypothetical protein  39.45 
 
 
286 aa  156  2e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.22693  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0397  protein of unknown function DUF45  39.45 
 
 
292 aa  155  4e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.119001  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4740  protein of unknown function DUF45  40.09 
 
 
318 aa  155  4e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.677282  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0412  protein of unknown function DUF45  39.45 
 
 
292 aa  155  5.0000000000000005e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.505198  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0448  hypothetical protein  41.1 
 
 
319 aa  154  1e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4173  hypothetical protein  40.36 
 
 
303 aa  154  1e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.282875 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3377  hypothetical protein  42.22 
 
 
320 aa  153  2e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.577966 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1292  hypothetical protein  38.57 
 
 
308 aa  145  6e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.232025 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4199  hypothetical protein  37.82 
 
 
340 aa  144  8.000000000000001e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0212  hypothetical protein  38.7 
 
 
321 aa  140  1.9999999999999998e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0964391 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2307  protein of unknown function DUF45  34.93 
 
 
244 aa  140  1.9999999999999998e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04470  predicted metal-dependent hydrolase  33.49 
 
 
241 aa  137  1e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2107  hypothetical protein  32.87 
 
 
240 aa  129  2.0000000000000002e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3692  hypothetical protein  36.52 
 
 
314 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.349516  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2889  hypothetical protein  31.33 
 
 
261 aa  126  3e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.653746  normal  0.363578 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0373  protein of unknown function DUF45  34.68 
 
 
242 aa  124  8.000000000000001e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2744  hypothetical protein  33.33 
 
 
252 aa  122  6e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0843  hypothetical protein  29.36 
 
 
246 aa  120  1.9999999999999998e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.335069  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0791  hypothetical protein  29.36 
 
 
246 aa  120  1.9999999999999998e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.371001  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1312  hypothetical protein  29.86 
 
 
234 aa  118  6e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0151  hypothetical protein  34.13 
 
 
240 aa  118  9e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2274  protein of unknown function DUF45  33.79 
 
 
243 aa  118  9e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0056  protein of unknown function DUF45  32.88 
 
 
238 aa  117  9.999999999999999e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0899  hypothetical protein  30.73 
 
 
254 aa  117  9.999999999999999e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  hitchhiker  0.000145532 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1181  protein of unknown function DUF45  35.58 
 
 
242 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0503  hypothetical protein  30.77 
 
 
224 aa  116  1.9999999999999998e-25  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0542  hypothetical protein  30.04 
 
 
243 aa  116  1.9999999999999998e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1824  hypothetical protein  30.32 
 
 
224 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2910  hypothetical protein  30.14 
 
 
237 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4297  hypothetical protein  26.87 
 
 
251 aa  112  5e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0100  protein of unknown function DUF45  31.03 
 
 
241 aa  111  8.000000000000001e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0220  hypothetical protein  30.88 
 
 
240 aa  109  3e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3354  hypothetical protein  29.95 
 
 
265 aa  109  3e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_159  hypothetical protein  29.61 
 
 
240 aa  109  3e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.363835  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1069  hypothetical protein  31.05 
 
 
223 aa  108  5e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.262175  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0036  protein of unknown function DUF45  31.58 
 
 
262 aa  108  6e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0379  hypothetical protein  29.3 
 
 
237 aa  107  1e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05618  hypothetical protein  29.09 
 
 
226 aa  107  1e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1789  hypothetical protein  29.17 
 
 
238 aa  107  1e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0071  protein of unknown function DUF45  29.52 
 
 
223 aa  105  6e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2794  protein of unknown function DUF45  29.73 
 
 
242 aa  105  6e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0182535  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0593  hypothetical protein  30.88 
 
 
260 aa  104  8e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0332404  normal  0.0318611 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2344  hypothetical protein  44.26 
 
 
217 aa  104  1e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.394808 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0324  protein of unknown function DUF45  28.44 
 
 
263 aa  104  1e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00482569 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0800  hypothetical protein  26.61 
 
 
237 aa  103  1e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0356506  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1707  hypothetical protein  26.27 
 
 
239 aa  103  2e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.182955  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2484  hypothetical protein  29.19 
 
 
245 aa  102  3e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.186682  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1102  zinc metalloprotease  31.67 
 
 
243 aa  102  6e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00846989  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0604  protein of unknown function DUF45  30.7 
 
 
241 aa  102  7e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.068795 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1843  protein of unknown function DUF45  26.18 
 
 
254 aa  100  1e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.224767 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0303  hypothetical protein  29.36 
 
 
266 aa  100  1e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.037787 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4887  hypothetical protein  31.31 
 
 
243 aa  100  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.334239  normal  0.0174826 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0870  protein of unknown function DUF45  29.41 
 
 
224 aa  100  1e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0260023  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0431  hypothetical protein  24.64 
 
 
235 aa  100  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2393  hypothetical protein  27.06 
 
 
244 aa  100  2e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0568  protein of unknown function DUF45  28.44 
 
 
241 aa  99.8  3e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.237402 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0309  zinc metalloprotease  24.64 
 
 
235 aa  99.8  3e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.122687  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0413  hypothetical protein  43 
 
 
249 aa  99.8  3e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3493  hypothetical protein  31.34 
 
 
244 aa  98.2  8e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.718444  normal  0.055231 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0431  hypothetical protein  24.15 
 
 
235 aa  98.2  9e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00811962  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0322  hypothetical protein  23.67 
 
 
235 aa  97.1  2e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000118894  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0337  hypothetical protein  23.67 
 
 
235 aa  97.1  2e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000389941  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0317  hypothetical protein  23.19 
 
 
235 aa  96.3  3e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0369  hypothetical protein  23.67 
 
 
235 aa  96.3  3e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0015  hypothetical protein  29.15 
 
 
247 aa  96.3  3e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000114472  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0306  zinc metalloprotease  23.67 
 
 
235 aa  95.9  4e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0156  hypothetical protein  27.93 
 
 
270 aa  95.9  4e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0384  zinc metalloprotease  23.19 
 
 
235 aa  95.9  4e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0625718  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1951  hypothetical protein  29.36 
 
 
481 aa  95.9  4e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0064  hypothetical protein  28.77 
 
 
278 aa  95.1  6e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0579  protein of unknown function DUF45  27.83 
 
 
249 aa  94.7  1e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.452313  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7655  putative metal-dependent hydrolase  28.28 
 
 
198 aa  94.4  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.995327  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0083  hypothetical protein  26.11 
 
 
222 aa  94  1e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  decreased coverage  0.000843512  decreased coverage  0.0000753316 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1837  protein of unknown function DUF45  29.17 
 
 
247 aa  94.4  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.37826  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>