276 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_0212 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_0212  hypothetical protein  100 
 
 		 321 aa  634    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0964391 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3377  hypothetical protein  56.67 
 
 		 320 aa  320  9.999999999999999e-87  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.577966 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4199  hypothetical protein  46.55 
 
 		 340 aa  270  2.9999999999999997e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2166  hypothetical protein  55.25 
 
 		 310 aa  265  8e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.221845  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4740  protein of unknown function DUF45  50.52 
 
 		 318 aa  258  6e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.677282  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0448  hypothetical protein  47.59 
 
 		 319 aa  257  2e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3692  hypothetical protein  52.31 
 
 		 314 aa  256  4e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.349516  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4173  hypothetical protein  47.92 
 
 		 303 aa  256  4e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.282875 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0547  protein of unknown function DUF45  47.48 
 
 		 306 aa  249  4e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0531  hypothetical protein  46.35 
 
 		 306 aa  246  4e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.10161 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0594  hypothetical protein  48.16 
 
 		 301 aa  231  2e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0504  hypothetical protein  41.56 
 
 		 286 aa  228  7e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.22693  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2732  hypothetical protein  47.35 
 
 		 295 aa  224  1e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6032  hypothetical protein  46.94 
 
 		 316 aa  224  2e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2622  hypothetical protein  46.94 
 
 		 285 aa  224  2e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.276697  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2757  hypothetical protein  46.94 
 
 		 303 aa  224  2e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.328108  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2093  hypothetical protein  46.94 
 
 		 295 aa  223  4e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.786818  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2705  hypothetical protein  46.94 
 
 		 295 aa  223  4e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.319747  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0397  protein of unknown function DUF45  46.64 
 
 		 292 aa  221  9.999999999999999e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.119001  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0412  protein of unknown function DUF45  46.64 
 
 		 292 aa  221  9.999999999999999e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.505198  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0443  hypothetical protein  40.31 
 
 		 292 aa  221  9.999999999999999e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.618297 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0402  hypothetical protein  47.15 
 
 		 285 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.450593  normal  0.256851 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0877  hypothetical protein  45.71 
 
 		 292 aa  220  3e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2347  hypothetical protein  45.71 
 
 		 292 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0698  hypothetical protein  45.71 
 
 		 292 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0215  hypothetical protein  45.71 
 
 		 292 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.585984  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2427  hypothetical protein  45.71 
 
 		 292 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.656656  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2731  hypothetical protein  45.71 
 
 		 292 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.896479  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0713  hypothetical protein  45.71 
 
 		 292 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0581  hypothetical protein  45.31 
 
 		 295 aa  219  5e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4016  hypothetical protein  41.85 
 
 		 300 aa  217  2e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00585617  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0683  protein of unknown function DUF45  45.08 
 
 		 300 aa  217  2e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.436167  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0521  hypothetical protein  44.28 
 
 		 288 aa  216  2.9999999999999998e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0129218 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1292  hypothetical protein  47.06 
 
 		 308 aa  205  9e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.232025 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0641  hypothetical protein  41.77 
 
 		 236 aa  150  2e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2107  hypothetical protein  38.62 
 
 		 240 aa  149  6e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0542  hypothetical protein  35.22 
 
 		 243 aa  148  1.0000000000000001e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0547  hypothetical protein  38.7 
 
 		 218 aa  140  3e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.825313  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3538  hypothetical protein  37.5 
 
 		 239 aa  140  3.9999999999999997e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.739224  normal  0.0386409 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2307  protein of unknown function DUF45  33.2 
 
 		 244 aa  134  3e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2889  hypothetical protein  34.01 
 
 		 261 aa  130  3e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.653746  normal  0.363578 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04470  predicted metal-dependent hydrolase  27.76 
 
 		 241 aa  120  3e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2744  hypothetical protein  32.24 
 
 		 252 aa  117  3.9999999999999997e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05618  hypothetical protein  31.93 
 
 		 226 aa  113  6e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0373  protein of unknown function DUF45  30.49 
 
 		 242 aa  110  3e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1181  protein of unknown function DUF45  36.84 
 
 		 242 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0151  hypothetical protein  29.15 
 
 		 240 aa  108  1e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1824  hypothetical protein  29.66 
 
 		 224 aa  108  1e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0100  protein of unknown function DUF45  30.25 
 
 		 241 aa  108  1e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2910  hypothetical protein  30.2 
 
 		 237 aa  107  4e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0843  hypothetical protein  30.93 
 
 		 246 aa  105  8e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.335069  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0791  hypothetical protein  30.93 
 
 		 246 aa  105  8e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.371001  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4297  hypothetical protein  28.27 
 
 		 251 aa  105  9e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1069  hypothetical protein  30.6 
 
 		 223 aa  104  2e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.262175  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0899  hypothetical protein  33.46 
 
 		 254 aa  104  2e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000145532 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2794  protein of unknown function DUF45  31.69 
 
 		 242 aa  102  7e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0182535  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_159  hypothetical protein  27.94 
 
 		 240 aa  102  9e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.363835  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1312  hypothetical protein  27.16 
 
 		 234 aa  101  2e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2484  hypothetical protein  27.8 
 
 		 245 aa  101  2e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.186682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0503  hypothetical protein  28.94 
 
 		 224 aa  100  3e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0668  hypothetical protein  28.26 
 
 		 251 aa  99.8  5e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2393  hypothetical protein  28.45 
 
 		 244 aa  99.4  8e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0071  protein of unknown function DUF45  29.24 
 
 		 223 aa  99  9e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2344  hypothetical protein  32.17 
 
 		 217 aa  99  1e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.394808 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0220  hypothetical protein  27.94 
 
 		 240 aa  99  1e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1102  zinc metalloprotease  44.09 
 
 		 243 aa  99  1e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00846989  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0800  hypothetical protein  24.59 
 
 		 237 aa  98.6  1e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0356506  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2595  hypothetical protein  23.27 
 
 		 238 aa  98.6  1e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.23171  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0379  hypothetical protein  28.07 
 
 		 237 aa  97.8  2e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3354  hypothetical protein  33.33 
 
 		 265 aa  98.2  2e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1789  hypothetical protein  27.66 
 
 		 238 aa  97.4  3e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3789  hypothetical protein  28.63 
 
 		 235 aa  96.3  7e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0870  protein of unknown function DUF45  30.54 
 
 		 224 aa  94  3e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0260023  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0727  protein of unknown function DUF45  24.37 
 
 		 223 aa  94  3e-18  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3493  hypothetical protein  41.74 
 
 		 244 aa  92.8  6e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.718444  normal  0.055231 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0056  protein of unknown function DUF45  29.46 
 
 		 238 aa  92  1e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0036  protein of unknown function DUF45  27.93 
 
 		 262 aa  91.7  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0413  hypothetical protein  40.38 
 
 		 249 aa  90.9  2e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1763  protein of unknown function DUF45  28.69 
 
 		 246 aa  91.3  2e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0568  hypothetical protein  29.69 
 
 		 235 aa  90.9  3e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000566322 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0125  hypothetical protein  40.74 
 
 		 256 aa  90.9  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.84591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1707  hypothetical protein  26.81 
 
 		 239 aa  90.1  5e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.182955  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2274  protein of unknown function DUF45  30.96 
 
 		 243 aa  89.7  6e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2855  hypothetical protein  33.64 
 
 		 252 aa  89.7  6e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0579  protein of unknown function DUF45  39.81 
 
 		 249 aa  89.4  7e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.452313  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2113  hypothetical protein  28.73 
 
 		 253 aa  87.8  2e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.301869  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2029  hypothetical protein  28.73 
 
 		 255 aa  88.2  2e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.611915  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1084  protein of unknown function DUF45  33.33 
 
 		 221 aa  87.8  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0064  hypothetical protein  39.81 
 
 		 278 aa  87.8  2e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0094  hypothetical protein  48.84 
 
 		 228 aa  87.4  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1858  protein of unknown function DUF45  27.09 
 
 		 226 aa  87  4e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000912457  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0568  protein of unknown function DUF45  30.61 
 
 		 241 aa  86.7  5e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.237402 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2959  protein of unknown function DUF45  27.07 
 
 		 227 aa  86.7  5e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0508  hypothetical protein  31.71 
 
 		 233 aa  86.3  6e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.139012 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3143  protein of unknown function DUF45  26.64 
 
 		 227 aa  85.1  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0570436  normal  0.976092 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0807  hypothetical protein  27.23 
 
 		 253 aa  85.5  0.000000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0324  protein of unknown function DUF45  42.45 
 
 		 263 aa  84.7  0.000000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00482569 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2642  hypothetical protein  40.91 
 
 		 228 aa  85.1  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0309  zinc metalloprotease  24.58 
 
 		 235 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.122687  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0982  zinc metallopeptidase-like protein  40.91 
 
 		 228 aa  85.1  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>