260 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_0448 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_0448  hypothetical protein  100 
 
 		 319 aa  638    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4199  hypothetical protein  57.48 
 
 		 340 aa  354  1e-96  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3692  hypothetical protein  52.06 
 
 		 314 aa  298  1e-79  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.349516  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4740  protein of unknown function DUF45  55.09 
 
 		 318 aa  287  2e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.677282  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4173  hypothetical protein  50.32 
 
 		 303 aa  281  1e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.282875 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0547  protein of unknown function DUF45  48.4 
 
 		 306 aa  268  1e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0531  hypothetical protein  48.73 
 
 		 306 aa  266  2.9999999999999995e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.10161 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2166  hypothetical protein  54.18 
 
 		 310 aa  265  8.999999999999999e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.221845  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0212  hypothetical protein  52.76 
 
 		 321 aa  256  4e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0964391 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3377  hypothetical protein  46.2 
 
 		 320 aa  241  7.999999999999999e-63  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.577966 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1292  hypothetical protein  48.39 
 
 		 308 aa  230  2e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.232025 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4016  hypothetical protein  46.47 
 
 		 300 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00585617  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0581  hypothetical protein  47.21 
 
 		 295 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0683  protein of unknown function DUF45  45.06 
 
 		 300 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.436167  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0877  hypothetical protein  46.78 
 
 		 292 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0215  hypothetical protein  46.78 
 
 		 292 aa  216  4e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.585984  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0713  hypothetical protein  46.78 
 
 		 292 aa  216  4e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0698  hypothetical protein  46.78 
 
 		 292 aa  216  4e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2731  hypothetical protein  46.78 
 
 		 292 aa  216  4e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.896479  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2427  hypothetical protein  46.78 
 
 		 292 aa  216  4e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.656656  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2347  hypothetical protein  46.78 
 
 		 292 aa  216  4e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0402  hypothetical protein  46.78 
 
 		 285 aa  216  5e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.450593  normal  0.256851 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0594  hypothetical protein  45.73 
 
 		 301 aa  212  7e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2622  hypothetical protein  45.34 
 
 		 285 aa  209  4e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.276697  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2757  hypothetical protein  45.34 
 
 		 303 aa  209  5e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.328108  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6032  hypothetical protein  45.53 
 
 		 316 aa  209  6e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2732  hypothetical protein  45.53 
 
 		 295 aa  208  1e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2093  hypothetical protein  45.11 
 
 		 295 aa  207  2e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.786818  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2705  hypothetical protein  45.11 
 
 		 295 aa  207  2e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.319747  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0443  hypothetical protein  44.05 
 
 		 292 aa  206  3e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.618297 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0521  hypothetical protein  47.66 
 
 		 288 aa  206  5e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0129218 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0397  protein of unknown function DUF45  43.78 
 
 		 292 aa  199  6e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.119001  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0504  hypothetical protein  45.95 
 
 		 286 aa  199  7e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.22693  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0412  protein of unknown function DUF45  43.78 
 
 		 292 aa  199  7.999999999999999e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.505198  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0547  hypothetical protein  41.1 
 
 		 218 aa  157  3e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.825313  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0641  hypothetical protein  36.36 
 
 		 236 aa  143  4e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2307  protein of unknown function DUF45  32.63 
 
 		 244 aa  139  4.999999999999999e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2107  hypothetical protein  34.16 
 
 		 240 aa  136  5e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3538  hypothetical protein  34.16 
 
 		 239 aa  133  5e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.739224  normal  0.0386409 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0542  hypothetical protein  30 
 
 		 243 aa  124  2e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2889  hypothetical protein  30.86 
 
 		 261 aa  121  9.999999999999999e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.653746  normal  0.363578 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2744  hypothetical protein  31.3 
 
 		 252 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0373  protein of unknown function DUF45  32.5 
 
 		 242 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1181  protein of unknown function DUF45  34.23 
 
 		 242 aa  117  3e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0151  hypothetical protein  31.35 
 
 		 240 aa  116  5e-25  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0100  protein of unknown function DUF45  34.36 
 
 		 241 aa  115  1.0000000000000001e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1312  hypothetical protein  28.88 
 
 		 234 aa  112  6e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0220  hypothetical protein  29.2 
 
 		 240 aa  105  7e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2794  protein of unknown function DUF45  30.64 
 
 		 242 aa  105  8e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0182535  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1824  hypothetical protein  28.7 
 
 		 224 aa  105  9e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1789  hypothetical protein  29.36 
 
 		 238 aa  105  9e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4297  hypothetical protein  27.98 
 
 		 251 aa  104  2e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0899  hypothetical protein  31.84 
 
 		 254 aa  103  3e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000145532 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04470  predicted metal-dependent hydrolase  27.03 
 
 		 241 aa  102  9e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2393  hypothetical protein  28.76 
 
 		 244 aa  102  9e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_159  hypothetical protein  29.13 
 
 		 240 aa  101  2e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.363835  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2910  hypothetical protein  27.16 
 
 		 237 aa  101  2e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0379  hypothetical protein  27.93 
 
 		 237 aa  99.4  8e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0593  hypothetical protein  29.36 
 
 		 260 aa  97.8  2e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0332404  normal  0.0318611 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0604  protein of unknown function DUF45  29.36 
 
 		 241 aa  97.4  3e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.068795 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1084  protein of unknown function DUF45  35.63 
 
 		 221 aa  97.1  3e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0015  hypothetical protein  31.4 
 
 		 247 aa  97.4  3e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000114472  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4036  hypothetical protein  28.11 
 
 		 234 aa  96.7  5e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0843  hypothetical protein  29.34 
 
 		 246 aa  96.3  6e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.335069  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0791  hypothetical protein  29.34 
 
 		 246 aa  96.3  6e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.371001  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0568  protein of unknown function DUF45  28.94 
 
 		 241 aa  95.5  1e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.237402 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0303  hypothetical protein  30 
 
 		 266 aa  95.5  1e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.037787 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2344  hypothetical protein  31.02 
 
 		 217 aa  95.1  1e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.394808 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3354  hypothetical protein  31.09 
 
 		 265 aa  95.5  1e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0036  protein of unknown function DUF45  29.19 
 
 		 262 aa  95.5  1e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0431  hypothetical protein  25.22 
 
 		 235 aa  94  3e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00811962  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3493  hypothetical protein  27.64 
 
 		 244 aa  92.4  8e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.718444  normal  0.055231 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0309  zinc metalloprotease  24.78 
 
 		 235 aa  91.7  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.122687  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4279  protein of unknown function DUF45  27.71 
 
 		 252 aa  92  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3952  protein of unknown function DUF45  27.71 
 
 		 252 aa  92  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2274  protein of unknown function DUF45  31.69 
 
 		 243 aa  91.3  2e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0369  hypothetical protein  25.22 
 
 		 235 aa  91.7  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3789  hypothetical protein  31.17 
 
 		 235 aa  91.7  2e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0800  hypothetical protein  22.65 
 
 		 237 aa  90.5  3e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0356506  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2595  hypothetical protein  24.02 
 
 		 238 aa  90.9  3e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.23171  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1069  hypothetical protein  26.91 
 
 		 223 aa  90.1  4e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.262175  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0322  hypothetical protein  24.78 
 
 		 235 aa  89.7  6e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000118894  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2484  hypothetical protein  26.53 
 
 		 245 aa  89.7  6e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.186682  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0056  protein of unknown function DUF45  27.78 
 
 		 238 aa  89.7  6e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0337  hypothetical protein  24.78 
 
 		 235 aa  89.7  6e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000389941  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0384  zinc metalloprotease  24.78 
 
 		 235 aa  89.4  7e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0625718  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0431  hypothetical protein  24.35 
 
 		 235 aa  89.4  9e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0870  protein of unknown function DUF45  26.91 
 
 		 224 aa  88.6  1e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0260023  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0306  zinc metalloprotease  24.78 
 
 		 235 aa  88.2  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0503  hypothetical protein  24.66 
 
 		 224 aa  87.8  2e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1102  zinc metalloprotease  24.87 
 
 		 243 aa  88.2  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00846989  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1772  hypothetical protein  30.7 
 
 		 232 aa  88.2  2e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.236777  normal  0.415522 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2959  protein of unknown function DUF45  24.77 
 
 		 227 aa  88.2  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3143  protein of unknown function DUF45  24.77 
 
 		 227 aa  87.4  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0570436  normal  0.976092 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3548  hypothetical protein  30.43 
 
 		 242 aa  87.4  3e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.405363  normal  0.224983 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0317  hypothetical protein  24.89 
 
 		 235 aa  87  3e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0727  protein of unknown function DUF45  22.84 
 
 		 223 aa  87  4e-16  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1763  protein of unknown function DUF45  29.36 
 
 		 246 aa  86.7  5e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0010  hypothetical protein  27.19 
 
 		 270 aa  86.3  7e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000896967 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05618  hypothetical protein  27.06 
 
 		 226 aa  85.9  9e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>