260 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_4036 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_4036  hypothetical protein  100 
 
 
234 aa  483  1e-135  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0568  hypothetical protein  57.45 
 
 
235 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000566322 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05618  hypothetical protein  53.07 
 
 
226 aa  249  3e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0505  hypothetical protein  39.22 
 
 
233 aa  174  9e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.722938 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0100  hypothetical protein  35.9 
 
 
231 aa  166  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.58057  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0503  hypothetical protein  37.22 
 
 
224 aa  166  2.9999999999999998e-40  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2307  protein of unknown function DUF45  34.8 
 
 
244 aa  164  6.9999999999999995e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2595  hypothetical protein  35.19 
 
 
238 aa  164  1.0000000000000001e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.23171  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0379  hypothetical protein  37.83 
 
 
237 aa  163  3e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2393  hypothetical protein  37.61 
 
 
244 aa  161  8.000000000000001e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0542  hypothetical protein  34.2 
 
 
243 aa  158  5e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1824  hypothetical protein  35.96 
 
 
224 aa  156  3e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0870  protein of unknown function DUF45  35.09 
 
 
224 aa  154  8e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0260023  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04470  predicted metal-dependent hydrolase  34.78 
 
 
241 aa  154  8e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1789  hypothetical protein  38.91 
 
 
238 aa  153  2e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2910  hypothetical protein  34.82 
 
 
237 aa  148  6e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0800  hypothetical protein  35.93 
 
 
237 aa  148  7e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0356506  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3143  protein of unknown function DUF45  34.06 
 
 
227 aa  148  8e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0570436  normal  0.976092 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2959  protein of unknown function DUF45  34.06 
 
 
227 aa  148  8e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4010  hypothetical protein  35.44 
 
 
253 aa  145  4.0000000000000006e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.836815 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1069  hypothetical protein  34.53 
 
 
223 aa  143  2e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.262175  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0071  protein of unknown function DUF45  33.94 
 
 
223 aa  142  5e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1843  protein of unknown function DUF45  30.08 
 
 
254 aa  141  9e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.224767 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3789  hypothetical protein  36.17 
 
 
235 aa  141  9e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2794  protein of unknown function DUF45  34.63 
 
 
242 aa  137  1e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0182535  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1102  zinc metalloprotease  31.91 
 
 
243 aa  135  5e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00846989  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0899  hypothetical protein  32.41 
 
 
254 aa  133  3e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  hitchhiker  0.000145532 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1312  hypothetical protein  32.92 
 
 
234 aa  132  5e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2255  zinc metalloprotease  33.19 
 
 
227 aa  128  8.000000000000001e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0431  hypothetical protein  28.57 
 
 
235 aa  126  3e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00811962  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0056  protein of unknown function DUF45  35.05 
 
 
238 aa  126  3e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0309  zinc metalloprotease  28.57 
 
 
235 aa  125  7e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.122687  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0431  hypothetical protein  28.57 
 
 
235 aa  125  7e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0384  zinc metalloprotease  28.12 
 
 
235 aa  125  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0625718  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0306  zinc metalloprotease  28.57 
 
 
235 aa  124  1e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0317  hypothetical protein  28.57 
 
 
235 aa  124  1e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0322  hypothetical protein  28.12 
 
 
235 aa  123  2e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000118894  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2484  hypothetical protein  33.77 
 
 
245 aa  124  2e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.186682  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0337  hypothetical protein  28.12 
 
 
235 aa  123  2e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000389941  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0369  hypothetical protein  28.12 
 
 
235 aa  123  2e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0100  protein of unknown function DUF45  32.46 
 
 
241 aa  122  7e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0843  hypothetical protein  28.99 
 
 
246 aa  117  9.999999999999999e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.335069  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0791  hypothetical protein  28.99 
 
 
246 aa  117  9.999999999999999e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.371001  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4297  hypothetical protein  27.02 
 
 
251 aa  112  4.0000000000000004e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0397  protein of unknown function DUF45  29.55 
 
 
292 aa  112  4.0000000000000004e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.119001  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0412  protein of unknown function DUF45  29.55 
 
 
292 aa  112  5e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.505198  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2889  hypothetical protein  30.92 
 
 
261 aa  112  5e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.653746  normal  0.363578 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0402  hypothetical protein  29.57 
 
 
285 aa  111  9e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.450593  normal  0.256851 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2744  hypothetical protein  29.44 
 
 
252 aa  109  3e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0581  hypothetical protein  28.38 
 
 
295 aa  107  2e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2107  hypothetical protein  28.57 
 
 
240 aa  106  2e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1894  hypothetical protein  31.86 
 
 
242 aa  106  3e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.470997  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0521  hypothetical protein  27.23 
 
 
288 aa  106  3e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0129218 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0036  protein of unknown function DUF45  29.76 
 
 
262 aa  106  4e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0373  protein of unknown function DUF45  28.75 
 
 
242 aa  105  5e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0594  hypothetical protein  28.76 
 
 
301 aa  105  8e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0215  hypothetical protein  28 
 
 
292 aa  104  1e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.585984  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0713  hypothetical protein  28 
 
 
292 aa  104  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0877  hypothetical protein  28 
 
 
292 aa  104  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0698  hypothetical protein  28 
 
 
292 aa  104  1e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2731  hypothetical protein  28 
 
 
292 aa  104  1e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.896479  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2427  hypothetical protein  28 
 
 
292 aa  104  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.656656  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2347  hypothetical protein  28 
 
 
292 aa  104  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6032  hypothetical protein  27.88 
 
 
316 aa  103  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2343  hypothetical protein  30.32 
 
 
238 aa  102  3e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.781257  normal  0.0217963 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2732  hypothetical protein  27.88 
 
 
295 aa  103  3e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0683  protein of unknown function DUF45  28.07 
 
 
300 aa  103  3e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.436167  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2093  hypothetical protein  27.88 
 
 
295 aa  102  4e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.786818  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2757  hypothetical protein  27.43 
 
 
303 aa  102  4e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.328108  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2705  hypothetical protein  27.88 
 
 
295 aa  102  4e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.319747  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2622  hypothetical protein  27.03 
 
 
285 aa  101  8e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.276697  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2274  protein of unknown function DUF45  31.48 
 
 
243 aa  101  9e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4016  hypothetical protein  27.59 
 
 
300 aa  101  9e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00585617  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3548  hypothetical protein  30.36 
 
 
242 aa  101  9e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.405363  normal  0.224983 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0504  hypothetical protein  26.99 
 
 
286 aa  100  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.22693  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0617  hypothetical protein  27.52 
 
 
222 aa  100  2e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.236846  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1114  hypothetical protein  30.7 
 
 
254 aa  99.8  3e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0448  hypothetical protein  27.85 
 
 
319 aa  100  3e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2542  protein of unknown function DUF45  29.02 
 
 
242 aa  99.8  4e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.65103  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1707  hypothetical protein  25.86 
 
 
239 aa  99  6e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.182955  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1084  protein of unknown function DUF45  32.97 
 
 
221 aa  98.6  8e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0402  hypothetical protein  26.92 
 
 
245 aa  98.2  1e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.95027  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0443  hypothetical protein  25.76 
 
 
292 aa  97.8  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.618297 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2552  hypothetical protein  24.12 
 
 
217 aa  97.4  2e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000141461  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0083  hypothetical protein  27.7 
 
 
222 aa  96.3  4e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  decreased coverage  0.000843512  decreased coverage  0.0000753316 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1292  hypothetical protein  27.19 
 
 
308 aa  95.5  6e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.232025 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1951  hypothetical protein  29.24 
 
 
481 aa  95.1  7e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3538  hypothetical protein  28.96 
 
 
239 aa  93.6  2e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.739224  normal  0.0386409 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06805  hypothetical protein  27.31 
 
 
258 aa  94  2e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0010  hypothetical protein  26.84 
 
 
270 aa  94  2e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000896967 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2986  conserved hypothetical protein DUF45  29.07 
 
 
230 aa  93.6  3e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0413  hypothetical protein  24.35 
 
 
249 aa  92.8  4e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0984  zinc metalloprotease  23.85 
 
 
221 aa  92.8  4e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1098  hypothetical protein  28.44 
 
 
222 aa  92.4  5e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0406  hypothetical protein  24.78 
 
 
257 aa  92  7e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.317112  normal  0.0115722 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4740  protein of unknown function DUF45  24.77 
 
 
318 aa  90.5  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.677282  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4199  hypothetical protein  27.38 
 
 
340 aa  90.1  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0324  protein of unknown function DUF45  33.82 
 
 
263 aa  90.1  3e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00482569 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3493  hypothetical protein  29.83 
 
 
244 aa  89.7  3e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.718444  normal  0.055231 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3952  protein of unknown function DUF45  27.95 
 
 
252 aa  90.1  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>