276 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_3548 on replicon NC_008043
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008043  TM1040_3548  hypothetical protein  100 
 
 		 242 aa  491  9.999999999999999e-139  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.405363  normal  0.224983 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1114  hypothetical protein  38.75 
 
 		 254 aa  184  1.0000000000000001e-45  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0156  hypothetical protein  39.04 
 
 		 270 aa  182  6e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06805  hypothetical protein  36.82 
 
 		 258 aa  174  9.999999999999999e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2542  protein of unknown function DUF45  33.91 
 
 		 242 aa  135  4e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.65103  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1894  hypothetical protein  34.48 
 
 		 242 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.470997  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2595  hypothetical protein  27.98 
 
 		 238 aa  123  3e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.23171  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2484  hypothetical protein  33.96 
 
 		 245 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.186682  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0800  hypothetical protein  27.71 
 
 		 237 aa  118  6e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0356506  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04470  predicted metal-dependent hydrolase  30.87 
 
 		 241 aa  117  1.9999999999999998e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2889  hypothetical protein  32.77 
 
 		 261 aa  115  3.9999999999999997e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.653746  normal  0.363578 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2794  protein of unknown function DUF45  34.21 
 
 		 242 aa  114  1.0000000000000001e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0182535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2343  hypothetical protein  33.76 
 
 		 238 aa  114  1.0000000000000001e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.781257  normal  0.0217963 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05618  hypothetical protein  28.5 
 
 		 226 aa  109  4.0000000000000004e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0843  hypothetical protein  30 
 
 		 246 aa  108  7.000000000000001e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.335069  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0791  hypothetical protein  30 
 
 		 246 aa  108  7.000000000000001e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.371001  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1824  hypothetical protein  29.81 
 
 		 224 aa  107  1e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1789  hypothetical protein  33.18 
 
 		 238 aa  107  2e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1843  protein of unknown function DUF45  28.27 
 
 		 254 aa  107  2e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.224767 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0083  hypothetical protein  29.03 
 
 		 222 aa  106  4e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  decreased coverage  0.000843512  decreased coverage  0.0000753316 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1819  hypothetical protein  27.31 
 
 		 222 aa  106  4e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0984  zinc metalloprotease  29.38 
 
 		 221 aa  105  7e-22  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0505  hypothetical protein  32.18 
 
 		 233 aa  104  1e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.722938 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2959  protein of unknown function DUF45  29.06 
 
 		 227 aa  103  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2255  zinc metalloprotease  30.38 
 
 		 227 aa  103  2e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2393  hypothetical protein  37.3 
 
 		 244 aa  103  2e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0947  hypothetical protein  31.43 
 
 		 245 aa  103  3e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000214537 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1098  hypothetical protein  27.78 
 
 		 222 aa  103  3e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0949  hypothetical protein  28.83 
 
 		 219 aa  102  5e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0658473  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0056  protein of unknown function DUF45  33.02 
 
 		 238 aa  102  6e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3143  protein of unknown function DUF45  28.63 
 
 		 227 aa  102  6e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0570436  normal  0.976092 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2910  hypothetical protein  32.87 
 
 		 237 aa  102  7e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0617  hypothetical protein  30 
 
 		 222 aa  102  8e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.236846  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1102  zinc metalloprotease  29.6 
 
 		 243 aa  101  9e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00846989  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0542  hypothetical protein  27.85 
 
 		 243 aa  101  1e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3789  hypothetical protein  36 
 
 		 235 aa  100  1e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0870  protein of unknown function DUF45  29.85 
 
 		 224 aa  100  2e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0260023  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0373  protein of unknown function DUF45  30.94 
 
 		 242 aa  100  3e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4036  hypothetical protein  30.8 
 
 		 234 aa  99.4  5e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0503  hypothetical protein  27.59 
 
 		 224 aa  99.4  5e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0379  hypothetical protein  35.18 
 
 		 237 aa  98.6  9e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0397  protein of unknown function DUF45  31.17 
 
 		 292 aa  97.4  2e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.119001  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1069  hypothetical protein  28.71 
 
 		 223 aa  97.1  2e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.262175  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0412  protein of unknown function DUF45  31.17 
 
 		 292 aa  97.4  2e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.505198  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1164  hypothetical protein  37.3 
 
 		 141 aa  95.9  4e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0906  protein of unknown function DUF45  32.72 
 
 		 244 aa  96.3  4e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.876537  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0760  hypothetical protein  32.72 
 
 		 244 aa  96.3  4e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2307  protein of unknown function DUF45  28.04 
 
 		 244 aa  95.9  5e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1312  hypothetical protein  28.26 
 
 		 234 aa  95.5  7e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2744  hypothetical protein  28.7 
 
 		 252 aa  94  2e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0365  hypothetical protein  29.19 
 
 		 232 aa  93.6  3e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0669057  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0431  hypothetical protein  25 
 
 		 235 aa  93.6  3e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00811962  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0309  zinc metalloprotease  24.54 
 
 		 235 aa  93.6  3e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.122687  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0369  hypothetical protein  24.54 
 
 		 235 aa  93.2  3e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0401  hypothetical protein  27.31 
 
 		 233 aa  93.6  3e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0504  hypothetical protein  29.18 
 
 		 286 aa  92.8  4e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.22693  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0322  hypothetical protein  24.07 
 
 		 235 aa  92.4  6e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000118894  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0337  hypothetical protein  24.07 
 
 		 235 aa  92.4  6e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000389941  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0431  hypothetical protein  25 
 
 		 235 aa  92  8e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0317  hypothetical protein  26.27 
 
 		 235 aa  92  8e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0015  hypothetical protein  31.92 
 
 		 247 aa  91.7  9e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000114472  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0306  zinc metalloprotease  25 
 
 		 235 aa  90.9  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0384  zinc metalloprotease  24.54 
 
 		 235 aa  91.3  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0625718  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0443  hypothetical protein  28.94 
 
 		 292 aa  91.7  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.618297 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0521  hypothetical protein  29.13 
 
 		 288 aa  90.5  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0129218 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2166  hypothetical protein  32.29 
 
 		 310 aa  90.5  2e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.221845  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0899  hypothetical protein  27.72 
 
 		 254 aa  89.4  4e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000145532 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0406  hypothetical protein  29.49 
 
 		 257 aa  88.6  7e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.317112  normal  0.0115722 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4297  hypothetical protein  24.7 
 
 		 251 aa  88.6  9e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0071  protein of unknown function DUF45  27.86 
 
 		 223 aa  88.6  9e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0860  hypothetical protein  32.54 
 
 		 238 aa  88.2  1e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0568  hypothetical protein  27.23 
 
 		 235 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000566322 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0641  hypothetical protein  29.61 
 
 		 236 aa  88.2  1e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4010  hypothetical protein  28.74 
 
 		 253 aa  87  2e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.836815 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4173  hypothetical protein  30.77 
 
 		 303 aa  86.7  3e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.282875 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2347  hypothetical protein  27.93 
 
 		 292 aa  86.3  4e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0215  hypothetical protein  27.93 
 
 		 292 aa  86.3  4e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.585984  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2427  hypothetical protein  27.93 
 
 		 292 aa  86.3  4e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.656656  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0713  hypothetical protein  27.93 
 
 		 292 aa  86.3  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0698  hypothetical protein  27.93 
 
 		 292 aa  86.3  4e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2731  hypothetical protein  27.93 
 
 		 292 aa  86.3  4e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.896479  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0581  hypothetical protein  26.7 
 
 		 295 aa  85.9  5e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0431  protein of unknown function DUF45  30.04 
 
 		 239 aa  85.9  6e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1858  protein of unknown function DUF45  25.36 
 
 		 226 aa  85.9  6e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000912457  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0877  hypothetical protein  28.3 
 
 		 292 aa  85.5  7e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0448  hypothetical protein  28.86 
 
 		 319 aa  85.5  8e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0594  hypothetical protein  28.08 
 
 		 301 aa  85.1  9e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1763  protein of unknown function DUF45  25.11 
 
 		 246 aa  84.7  0.000000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0683  protein of unknown function DUF45  28.96 
 
 		 300 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.436167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0100  hypothetical protein  31.79 
 
 		 231 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.58057  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0459  hypothetical protein  25.57 
 
 		 235 aa  83.6  0.000000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0435  hypothetical protein  25.33 
 
 		 235 aa  83.6  0.000000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4016  hypothetical protein  28.09 
 
 		 300 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00585617  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_159  hypothetical protein  25.26 
 
 		 240 aa  82.8  0.000000000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.363835  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2093  hypothetical protein  29.13 
 
 		 295 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.786818  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2705  hypothetical protein  29.13 
 
 		 295 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.319747  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2198  hypothetical protein  31.07 
 
 		 247 aa  82.4  0.000000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.403347  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2675  hypothetical protein  30.05 
 
 		 243 aa  82.8  0.000000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.49786 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2928  hypothetical protein  30 
 
 		 219 aa  82.8  0.000000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2732  hypothetical protein  28.64 
 
 		 295 aa  81.6  0.000000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>