265 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_3692 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_3692  hypothetical protein  100 
 
 		 314 aa  634    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.349516  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4199  hypothetical protein  50.88 
 
 		 340 aa  315  5e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0448  hypothetical protein  51.11 
 
 		 319 aa  292  6e-78  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0547  protein of unknown function DUF45  53.67 
 
 		 306 aa  291  7e-78  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0531  hypothetical protein  53.33 
 
 		 306 aa  291  1e-77  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.10161 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4740  protein of unknown function DUF45  56.98 
 
 		 318 aa  286  2e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.677282  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2166  hypothetical protein  56.54 
 
 		 310 aa  286  4e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.221845  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4173  hypothetical protein  47.59 
 
 		 303 aa  273  4.0000000000000004e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.282875 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3377  hypothetical protein  52.29 
 
 		 320 aa  258  8e-68  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.577966 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0212  hypothetical protein  53.7 
 
 		 321 aa  252  5.000000000000001e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0964391 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4016  hypothetical protein  46.15 
 
 		 300 aa  207  2e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00585617  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0402  hypothetical protein  43.03 
 
 		 285 aa  206  4e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.450593  normal  0.256851 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0683  protein of unknown function DUF45  45.73 
 
 		 300 aa  204  1e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.436167  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1292  hypothetical protein  48.43 
 
 		 308 aa  202  5e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.232025 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0581  hypothetical protein  43.22 
 
 		 295 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0397  protein of unknown function DUF45  42.69 
 
 		 292 aa  199  6e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.119001  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0412  protein of unknown function DUF45  42.69 
 
 		 292 aa  199  7e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.505198  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0215  hypothetical protein  42.49 
 
 		 292 aa  194  2e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.585984  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0877  hypothetical protein  43.35 
 
 		 292 aa  194  2e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2427  hypothetical protein  42.49 
 
 		 292 aa  194  2e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.656656  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0713  hypothetical protein  42.49 
 
 		 292 aa  194  2e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2731  hypothetical protein  42.49 
 
 		 292 aa  194  2e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.896479  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0698  hypothetical protein  42.49 
 
 		 292 aa  194  2e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0594  hypothetical protein  43.22 
 
 		 301 aa  194  2e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2347  hypothetical protein  42.49 
 
 		 292 aa  194  2e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6032  hypothetical protein  43.22 
 
 		 316 aa  192  5e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2732  hypothetical protein  43.22 
 
 		 295 aa  192  6e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0521  hypothetical protein  42.69 
 
 		 288 aa  192  7e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0129218 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2757  hypothetical protein  42.8 
 
 		 303 aa  192  7e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.328108  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2622  hypothetical protein  42.8 
 
 		 285 aa  192  7e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.276697  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0443  hypothetical protein  39.08 
 
 		 292 aa  191  1e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.618297 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2093  hypothetical protein  42.8 
 
 		 295 aa  191  2e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.786818  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2705  hypothetical protein  42.8 
 
 		 295 aa  191  2e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.319747  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0504  hypothetical protein  39.65 
 
 		 286 aa  188  1e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.22693  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0641  hypothetical protein  37.71 
 
 		 236 aa  142  7e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2889  hypothetical protein  32.64 
 
 		 261 aa  130  4.0000000000000003e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.653746  normal  0.363578 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3538  hypothetical protein  33.98 
 
 		 239 aa  129  7.000000000000001e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.739224  normal  0.0386409 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0547  hypothetical protein  36.52 
 
 		 218 aa  129  9.000000000000001e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.825313  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2107  hypothetical protein  33.47 
 
 		 240 aa  122  9.999999999999999e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2307  protein of unknown function DUF45  29.71 
 
 		 244 aa  120  3.9999999999999996e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2744  hypothetical protein  31.93 
 
 		 252 aa  119  7.999999999999999e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04470  predicted metal-dependent hydrolase  28.39 
 
 		 241 aa  119  9.999999999999999e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0542  hypothetical protein  31.54 
 
 		 243 aa  118  9.999999999999999e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2910  hypothetical protein  30.89 
 
 		 237 aa  116  3.9999999999999997e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1181  protein of unknown function DUF45  35.87 
 
 		 242 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0373  protein of unknown function DUF45  29.13 
 
 		 242 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1789  hypothetical protein  31.49 
 
 		 238 aa  110  4.0000000000000004e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0151  hypothetical protein  30.91 
 
 		 240 aa  109  6e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0379  hypothetical protein  28.96 
 
 		 237 aa  107  3e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4297  hypothetical protein  28.22 
 
 		 251 aa  106  4e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1312  hypothetical protein  28.22 
 
 		 234 aa  106  4e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2344  hypothetical protein  32.44 
 
 		 217 aa  104  2e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.394808 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0100  protein of unknown function DUF45  32.29 
 
 		 241 aa  103  3e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0899  hypothetical protein  31.9 
 
 		 254 aa  101  2e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000145532 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0220  hypothetical protein  31.16 
 
 		 240 aa  100  3e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2393  hypothetical protein  27.78 
 
 		 244 aa  100  4e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_159  hypothetical protein  29.77 
 
 		 240 aa  99.8  6e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.363835  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1824  hypothetical protein  27.03 
 
 		 224 aa  99.8  6e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0800  hypothetical protein  24.48 
 
 		 237 aa  97.8  2e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0356506  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2794  protein of unknown function DUF45  29.54 
 
 		 242 aa  95.9  8e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0182535  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0056  protein of unknown function DUF45  29.15 
 
 		 238 aa  95.5  1e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05618  hypothetical protein  27.63 
 
 		 226 aa  94.7  2e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1084  protein of unknown function DUF45  36.22 
 
 		 221 aa  94.7  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3789  hypothetical protein  29.11 
 
 		 235 aa  93.6  4e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1102  zinc metalloprotease  28.22 
 
 		 243 aa  93.2  5e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00846989  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1843  protein of unknown function DUF45  26.83 
 
 		 254 aa  91.7  1e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.224767 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2484  hypothetical protein  24.51 
 
 		 245 aa  92  1e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.186682  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3354  hypothetical protein  31.96 
 
 		 265 aa  90.1  4e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0843  hypothetical protein  30.21 
 
 		 246 aa  89.7  6e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.335069  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0791  hypothetical protein  30.21 
 
 		 246 aa  89.7  6e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.371001  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1707  hypothetical protein  26.18 
 
 		 239 aa  89.4  7e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.182955  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1069  hypothetical protein  27.9 
 
 		 223 aa  89.4  8e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.262175  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0036  protein of unknown function DUF45  26.7 
 
 		 262 aa  89  1e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0568  hypothetical protein  29.78 
 
 		 235 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000566322 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0870  protein of unknown function DUF45  27.35 
 
 		 224 aa  88.2  2e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0260023  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0015  hypothetical protein  29.63 
 
 		 247 aa  88.2  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000114472  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4036  hypothetical protein  27.16 
 
 		 234 aa  87.4  3e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2274  protein of unknown function DUF45  29.06 
 
 		 243 aa  87.4  3e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2959  protein of unknown function DUF45  26.52 
 
 		 227 aa  85.9  8e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2255  zinc metalloprotease  28.15 
 
 		 227 aa  85.9  8e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0071  protein of unknown function DUF45  24.77 
 
 		 223 aa  85.9  9e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3143  protein of unknown function DUF45  26.52 
 
 		 227 aa  85.1  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0570436  normal  0.976092 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0503  hypothetical protein  24.78 
 
 		 224 aa  85.5  0.000000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4279  protein of unknown function DUF45  28 
 
 		 252 aa  84.7  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2595  hypothetical protein  22.18 
 
 		 238 aa  84  0.000000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.23171  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3952  protein of unknown function DUF45  28.76 
 
 		 252 aa  83.6  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06805  hypothetical protein  25.66 
 
 		 258 aa  83.6  0.000000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0604  protein of unknown function DUF45  28.97 
 
 		 241 aa  82.8  0.000000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.068795 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0568  protein of unknown function DUF45  29.77 
 
 		 241 aa  82  0.00000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.237402 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0668  hypothetical protein  26.98 
 
 		 251 aa  82  0.00000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0977  protein of unknown function DUF45  29.39 
 
 		 259 aa  80.9  0.00000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0593  hypothetical protein  28.5 
 
 		 260 aa  81.3  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0332404  normal  0.0318611 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0906  protein of unknown function DUF45  30.59 
 
 		 244 aa  80.5  0.00000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.876537  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0760  hypothetical protein  30.59 
 
 		 244 aa  80.5  0.00000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0982  zinc metallopeptidase-like protein  35.14 
 
 		 228 aa  80.1  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2642  hypothetical protein  36.64 
 
 		 228 aa  79.7  0.00000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1535  hypothetical protein  32.69 
 
 		 238 aa  79.7  0.00000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.714061 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3493  hypothetical protein  39.22 
 
 		 244 aa  79.7  0.00000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.718444  normal  0.055231 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0402  hypothetical protein  28.87 
 
 		 245 aa  78.2  0.0000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.95027  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3548  hypothetical protein  25.73 
 
 		 242 aa  79  0.0000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.405363  normal  0.224983 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>