214 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_0760 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011761  AFE_0760  hypothetical protein  100 
 
 
244 aa  499  1e-140  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0906  protein of unknown function DUF45  100 
 
 
244 aa  499  1e-140  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.876537  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2675  hypothetical protein  47.68 
 
 
243 aa  234  9e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.49786 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2198  hypothetical protein  45.34 
 
 
247 aa  216  4e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.403347  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0860  hypothetical protein  45.89 
 
 
238 aa  209  3e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0947  hypothetical protein  41.6 
 
 
245 aa  201  9.999999999999999e-51  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  unclonable  0.0000214537 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0401  hypothetical protein  42.15 
 
 
233 aa  194  1e-48  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1774  zinc metalloprotease  41 
 
 
238 aa  185  7e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0543  peptidase S26A, signal peptidase I  39.39 
 
 
236 aa  184  1.0000000000000001e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00150578  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4620  protein of unknown function DUF45  40.57 
 
 
242 aa  182  3e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.212345 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0555  zinc metalloprotease  41.78 
 
 
239 aa  179  2.9999999999999997e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0652798  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0365  hypothetical protein  36.94 
 
 
232 aa  175  6e-43  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0669057  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0244  hypothetical protein  38.89 
 
 
253 aa  173  2.9999999999999996e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0431  protein of unknown function DUF45  39.58 
 
 
239 aa  167  1e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0459  hypothetical protein  34.6 
 
 
235 aa  163  2.0000000000000002e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0435  hypothetical protein  33.93 
 
 
235 aa  161  1e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0083  hypothetical protein  31.6 
 
 
222 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  decreased coverage  0.000843512  decreased coverage  0.0000753316 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1098  hypothetical protein  33.02 
 
 
222 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0949  hypothetical protein  31.96 
 
 
219 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0658473  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0617  hypothetical protein  33.33 
 
 
222 aa  129  6e-29  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.236846  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1819  hypothetical protein  31.92 
 
 
222 aa  128  9.000000000000001e-29  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1858  protein of unknown function DUF45  32.74 
 
 
226 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000912457  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0977  protein of unknown function DUF45  31.98 
 
 
259 aa  125  7e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0984  zinc metalloprotease  28.64 
 
 
221 aa  116  3e-25  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1591  protein of unknown function DUF45  39.72 
 
 
153 aa  112  7.000000000000001e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.961397  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2082  hypothetical protein  31.92 
 
 
222 aa  109  4.0000000000000004e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1114  hypothetical protein  30.93 
 
 
254 aa  109  4.0000000000000004e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2141  hypothetical protein  31.31 
 
 
233 aa  107  2e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0199813 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0156  hypothetical protein  31.75 
 
 
270 aa  107  2e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04860  predicted metal-dependent hydrolase  30.74 
 
 
184 aa  104  1e-21  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1632  protein of unknown function DUF45  26.21 
 
 
232 aa  102  6e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2668  protein of unknown function DUF45  46.94 
 
 
202 aa  99.8  4e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.255358  normal  0.761746 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1800  hypothetical protein  30.04 
 
 
222 aa  99.4  5e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.404735  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07420  predicted metal-dependent hydrolase  29.66 
 
 
198 aa  97.4  2e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.654381  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0151  hypothetical protein  27.07 
 
 
240 aa  96.7  3e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3548  hypothetical protein  32.72 
 
 
242 aa  96.3  4e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.405363  normal  0.224983 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2889  hypothetical protein  29.84 
 
 
261 aa  95.9  5e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.653746  normal  0.363578 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2343  hypothetical protein  29.46 
 
 
238 aa  95.1  8e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.781257  normal  0.0217963 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06805  hypothetical protein  29.41 
 
 
258 aa  95.1  8e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1416  putative metal-dependent hydrolase  28.24 
 
 
268 aa  95.1  1e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2550  hypothetical protein  25 
 
 
231 aa  94.4  2e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.52441  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0503  hypothetical protein  27.15 
 
 
224 aa  93.2  4e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2484  hypothetical protein  28.1 
 
 
245 aa  91.3  1e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.186682  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2910  hypothetical protein  29.57 
 
 
237 aa  90.1  3e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1894  hypothetical protein  31.53 
 
 
242 aa  89.4  4e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.470997  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2595  hypothetical protein  26.11 
 
 
238 aa  89  6e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.23171  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2542  protein of unknown function DUF45  27.91 
 
 
242 aa  88.6  8e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.65103  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0535  hypothetical protein  27.56 
 
 
206 aa  87.8  1e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0100  hypothetical protein  31.67 
 
 
231 aa  87.8  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.58057  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0542  hypothetical protein  24.67 
 
 
243 aa  87.4  2e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0056  protein of unknown function DUF45  29.63 
 
 
238 aa  87  3e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1824  hypothetical protein  26.79 
 
 
224 aa  85.1  9e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0647  hypothetical protein  22.71 
 
 
215 aa  85.1  0.000000000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.764633  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0870  protein of unknown function DUF45  27.64 
 
 
224 aa  84.7  0.000000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0260023  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0220  hypothetical protein  25.76 
 
 
240 aa  84  0.000000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2393  hypothetical protein  27 
 
 
244 aa  83.2  0.000000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1843  protein of unknown function DUF45  25.66 
 
 
254 aa  80.5  0.00000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.224767 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3692  hypothetical protein  30.59 
 
 
314 aa  80.5  0.00000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.349516  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_159  hypothetical protein  25.12 
 
 
240 aa  80.9  0.00000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.363835  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1789  hypothetical protein  28.57 
 
 
238 aa  79.7  0.00000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0379  hypothetical protein  28.5 
 
 
237 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0071  protein of unknown function DUF45  23.42 
 
 
223 aa  78.2  0.0000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4201  protein of unknown function DUF45  26.72 
 
 
245 aa  77.8  0.0000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2307  protein of unknown function DUF45  24.26 
 
 
244 aa  77  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1069  hypothetical protein  23.21 
 
 
223 aa  76.6  0.0000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.262175  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1049  hypothetical protein  23.7 
 
 
215 aa  76.3  0.0000000000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0449963  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3789  hypothetical protein  28.93 
 
 
235 aa  76.3  0.0000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0723  hypothetical protein  24.17 
 
 
220 aa  75.9  0.0000000000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.835761  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0505  hypothetical protein  29.66 
 
 
233 aa  75.9  0.0000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.722938 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04470  predicted metal-dependent hydrolase  25.23 
 
 
241 aa  75.9  0.0000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0899  hypothetical protein  28.91 
 
 
254 aa  75.5  0.0000000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  hitchhiker  0.000145532 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2794  protein of unknown function DUF45  30.51 
 
 
242 aa  75.5  0.0000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0182535  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1312  hypothetical protein  23.71 
 
 
234 aa  75.5  0.0000000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0794  conserved hypothetical protein (DUF45 domain protein)  25.11 
 
 
221 aa  75.5  0.0000000000008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.308629  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0402  hypothetical protein  32.88 
 
 
245 aa  73.9  0.000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.95027  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0727  protein of unknown function DUF45  21.82 
 
 
223 aa  73.2  0.000000000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0649  hypothetical protein  23.22 
 
 
215 aa  72.8  0.000000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0843  hypothetical protein  26.87 
 
 
246 aa  72.8  0.000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.335069  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2166  hypothetical protein  26.81 
 
 
310 aa  72.8  0.000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.221845  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0791  hypothetical protein  26.87 
 
 
246 aa  72.8  0.000000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.371001  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0079  zinc metalloprotease  23.01 
 
 
230 aa  72.4  0.000000000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0200194  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05618  hypothetical protein  27.69 
 
 
226 aa  72  0.000000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0568  hypothetical protein  24.74 
 
 
235 aa  72  0.000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000566322 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0800  hypothetical protein  24.39 
 
 
237 aa  71.6  0.00000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0356506  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1102  zinc metalloprotease  26.9 
 
 
243 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00846989  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0015  hypothetical protein  28.71 
 
 
247 aa  71.2  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000114472  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3377  hypothetical protein  26.21 
 
 
320 aa  71.2  0.00000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.577966 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0581  hypothetical protein  25.43 
 
 
295 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0212  hypothetical protein  33.33 
 
 
321 aa  70.1  0.00000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0964391 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2959  protein of unknown function DUF45  28.5 
 
 
227 aa  69.3  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1292  hypothetical protein  30.26 
 
 
308 aa  69.3  0.00000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.232025 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4016  hypothetical protein  24.14 
 
 
300 aa  68.9  0.00000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00585617  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0100  protein of unknown function DUF45  28.19 
 
 
241 aa  68.9  0.00000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3143  protein of unknown function DUF45  28 
 
 
227 aa  67.8  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0570436  normal  0.976092 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0504  hypothetical protein  23.38 
 
 
286 aa  68.2  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.22693  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0683  protein of unknown function DUF45  24.14 
 
 
300 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.436167  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1069  hypothetical protein  33.33 
 
 
225 aa  68.2  0.0000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.887273  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0443  hypothetical protein  26.5 
 
 
292 aa  68.2  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.618297 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2274  protein of unknown function DUF45  26.64 
 
 
243 aa  66.6  0.0000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0641  hypothetical protein  26.15 
 
 
236 aa  66.6  0.0000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>