275 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_159 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013552  DhcVS_159  hypothetical protein  100 
 
 
240 aa  502  1e-141  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.363835  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0151  hypothetical protein  87.08 
 
 
240 aa  447  1e-125  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0220  hypothetical protein  85 
 
 
240 aa  442  1e-123  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2744  hypothetical protein  34.91 
 
 
252 aa  150  1e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0542  hypothetical protein  35.78 
 
 
243 aa  137  1e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2307  protein of unknown function DUF45  32.3 
 
 
244 aa  137  1e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0100  protein of unknown function DUF45  34.36 
 
 
241 aa  132  6e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0036  protein of unknown function DUF45  32.2 
 
 
262 aa  127  1.0000000000000001e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3538  hypothetical protein  32.58 
 
 
239 aa  123  2e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.739224  normal  0.0386409 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0683  protein of unknown function DUF45  29.49 
 
 
300 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.436167  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4016  hypothetical protein  30.34 
 
 
300 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00585617  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0373  protein of unknown function DUF45  30.09 
 
 
242 aa  119  3e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3354  hypothetical protein  29.46 
 
 
265 aa  118  7e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2107  hypothetical protein  31.44 
 
 
240 aa  117  9.999999999999999e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0056  protein of unknown function DUF45  30.41 
 
 
238 aa  115  6e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1789  hypothetical protein  28.86 
 
 
238 aa  114  1.0000000000000001e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2889  hypothetical protein  27.76 
 
 
261 aa  114  1.0000000000000001e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.653746  normal  0.363578 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0402  hypothetical protein  30.64 
 
 
285 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.450593  normal  0.256851 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1561  zinc protease, putative  29.46 
 
 
244 aa  113  3e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05618  hypothetical protein  28.04 
 
 
226 aa  112  4.0000000000000004e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0581  hypothetical protein  29.49 
 
 
295 aa  112  5e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1661  protein of unknown function DUF45  27.93 
 
 
244 aa  111  8.000000000000001e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.843742  normal  0.112904 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1084  protein of unknown function DUF45  34.55 
 
 
221 aa  110  1.0000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1292  hypothetical protein  30.71 
 
 
308 aa  110  2.0000000000000002e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.232025 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2109  protein of unknown function DUF45  29.61 
 
 
249 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2910  hypothetical protein  28.92 
 
 
237 aa  110  3e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1824  hypothetical protein  33.5 
 
 
224 aa  110  3e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0547  hypothetical protein  29.61 
 
 
218 aa  109  3e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.825313  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3493  hypothetical protein  27.8 
 
 
244 aa  110  3e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.718444  normal  0.055231 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0379  hypothetical protein  27.78 
 
 
237 aa  109  5e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0503  hypothetical protein  33 
 
 
224 aa  109  5e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0443  hypothetical protein  28.27 
 
 
292 aa  108  6e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.618297 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2794  protein of unknown function DUF45  26.92 
 
 
242 aa  108  6e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0182535  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0594  hypothetical protein  28.21 
 
 
301 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0412  protein of unknown function DUF45  31.34 
 
 
292 aa  108  9.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.505198  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0397  protein of unknown function DUF45  31.34 
 
 
292 aa  108  1e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.119001  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0215  hypothetical protein  28.14 
 
 
292 aa  107  2e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.585984  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0698  hypothetical protein  28.14 
 
 
292 aa  107  2e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0877  hypothetical protein  28.14 
 
 
292 aa  107  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2427  hypothetical protein  28.14 
 
 
292 aa  107  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.656656  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0713  hypothetical protein  28.14 
 
 
292 aa  107  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2093  hypothetical protein  28.14 
 
 
295 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.786818  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2705  hypothetical protein  28.14 
 
 
295 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.319747  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1069  hypothetical protein  33.33 
 
 
223 aa  107  2e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.262175  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2731  hypothetical protein  28.14 
 
 
292 aa  107  2e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.896479  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2347  hypothetical protein  28.14 
 
 
292 aa  107  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2732  hypothetical protein  27.71 
 
 
295 aa  105  6e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0904  hypothetical protein  30.84 
 
 
251 aa  105  7e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0413  hypothetical protein  31.98 
 
 
249 aa  105  8e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0521  hypothetical protein  29.5 
 
 
288 aa  105  9e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0129218 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6032  hypothetical protein  27.71 
 
 
316 aa  105  9e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0504  hypothetical protein  29.76 
 
 
286 aa  104  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.22693  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1312  hypothetical protein  31.22 
 
 
234 aa  104  1e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2757  hypothetical protein  27.27 
 
 
303 aa  104  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.328108  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2622  hypothetical protein  27.27 
 
 
285 aa  104  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.276697  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1951  hypothetical protein  25.99 
 
 
481 aa  103  2e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0593  hypothetical protein  26.46 
 
 
260 aa  103  2e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0332404  normal  0.0318611 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0303  hypothetical protein  24.88 
 
 
266 aa  104  2e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.037787 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2393  hypothetical protein  29.05 
 
 
244 aa  103  2e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0604  protein of unknown function DUF45  26.46 
 
 
241 aa  103  2e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.068795 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4297  hypothetical protein  28.57 
 
 
251 aa  103  3e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2959  protein of unknown function DUF45  27.85 
 
 
227 aa  103  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0212  hypothetical protein  27.94 
 
 
321 aa  102  5e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0964391 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3143  protein of unknown function DUF45  27.85 
 
 
227 aa  102  6e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0570436  normal  0.976092 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0402  hypothetical protein  29.83 
 
 
245 aa  101  9e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.95027  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0870  protein of unknown function DUF45  32.2 
 
 
224 aa  101  1e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0260023  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0156  hypothetical protein  30.05 
 
 
270 aa  101  1e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0543  peptidase S26A, signal peptidase I  31.68 
 
 
236 aa  101  1e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00150578  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0641  hypothetical protein  32.83 
 
 
236 aa  101  1e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0982  zinc metallopeptidase-like protein  28.05 
 
 
228 aa  100  2e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0661  zinc protease, putative  28.57 
 
 
243 aa  100  2e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.792264  normal  0.0577046 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0568  protein of unknown function DUF45  26.01 
 
 
241 aa  100  2e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.237402 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3676  hypothetical protein  27.48 
 
 
227 aa  100  2e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0448  hypothetical protein  29.13 
 
 
319 aa  100  2e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0839  hypothetical protein  41.41 
 
 
237 aa  100  3e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.243328 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0125  hypothetical protein  30.61 
 
 
256 aa  99.8  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.84591  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0459  hypothetical protein  28.37 
 
 
235 aa  99.8  4e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3692  hypothetical protein  29.77 
 
 
314 aa  99.8  4e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.349516  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2113  hypothetical protein  28.57 
 
 
253 aa  99  6e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.301869  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04470  predicted metal-dependent hydrolase  25.59 
 
 
241 aa  99  6e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2029  hypothetical protein  28.57 
 
 
255 aa  99  6e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.611915  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0788  protein of unknown function DUF45  29.07 
 
 
241 aa  99  6e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0579  protein of unknown function DUF45  29.95 
 
 
249 aa  98.6  8e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.452313  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2642  hypothetical protein  28.05 
 
 
228 aa  98.2  9e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0435  hypothetical protein  27.88 
 
 
235 aa  98.2  1e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1763  protein of unknown function DUF45  26.38 
 
 
246 aa  97.8  1e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1774  zinc metalloprotease  28.78 
 
 
238 aa  97.8  1e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0064  hypothetical protein  30.1 
 
 
278 aa  98.2  1e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4740  protein of unknown function DUF45  28.17 
 
 
318 aa  97.8  1e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.677282  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1535  hypothetical protein  29.09 
 
 
238 aa  97.4  2e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.714061 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1858  protein of unknown function DUF45  28.29 
 
 
226 aa  96.7  3e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000912457  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0071  protein of unknown function DUF45  31.89 
 
 
223 aa  96.7  3e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4199  hypothetical protein  27.73 
 
 
340 aa  96.7  3e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2274  protein of unknown function DUF45  26.64 
 
 
243 aa  96.3  4e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1837  protein of unknown function DUF45  27.71 
 
 
247 aa  96.3  4e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.37826  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3952  protein of unknown function DUF45  27.98 
 
 
252 aa  95.9  6e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0561  protein of unknown function DUF45  28.32 
 
 
211 aa  95.5  7e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0807  hypothetical protein  28.57 
 
 
253 aa  94.7  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0508  hypothetical protein  30.09 
 
 
233 aa  94.4  1e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.139012 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3789  hypothetical protein  27.37 
 
 
235 aa  94.7  1e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>