278 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_0593 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_0593  hypothetical protein  100 
 
 		 260 aa  518  1e-146  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0332404  normal  0.0318611 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0604  protein of unknown function DUF45  99.17 
 
 		 241 aa  480  1e-134  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.068795 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0568  protein of unknown function DUF45  94.61 
 
 		 241 aa  456  1e-127  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.237402 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3493  hypothetical protein  66.8 
 
 		 244 aa  327  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.718444  normal  0.055231 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1837  protein of unknown function DUF45  60.73 
 
 		 247 aa  269  4e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.37826  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4887  hypothetical protein  59.67 
 
 		 243 aa  262  4e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.334239  normal  0.0174826 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1260  hypothetical protein  54.58 
 
 		 256 aa  258  5.0000000000000005e-68  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.017504 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0131  hypothetical protein  52.4 
 
 		 278 aa  240  2e-62  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.249542 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0228  hypothetical protein  50.99 
 
 		 278 aa  237  2e-61  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.31038  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0125  hypothetical protein  50.82 
 
 		 256 aa  235  5.0000000000000005e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.84591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0064  hypothetical protein  50.82 
 
 		 278 aa  233  3e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0355  hypothetical protein  50.2 
 
 		 279 aa  231  6e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0579  protein of unknown function DUF45  50 
 
 		 249 aa  230  2e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.452313  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0303  hypothetical protein  48.48 
 
 		 266 aa  229  4e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.037787 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0324  protein of unknown function DUF45  52.54 
 
 		 263 aa  227  1e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00482569 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7655  putative metal-dependent hydrolase  53.85 
 
 		 198 aa  216  2e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.995327  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2113  hypothetical protein  45.21 
 
 		 253 aa  199  3.9999999999999996e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.301869  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2029  hypothetical protein  45.21 
 
 		 255 aa  199  3.9999999999999996e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.611915  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0018  hypothetical protein  42.86 
 
 		 254 aa  194  8.000000000000001e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0807  hypothetical protein  43.84 
 
 		 253 aa  192  3e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0668  hypothetical protein  43.61 
 
 		 251 aa  191  1e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0010  hypothetical protein  44.63 
 
 		 270 aa  188  8e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000896967 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4279  protein of unknown function DUF45  41.7 
 
 		 252 aa  187  1e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3235  hypothetical protein  41.06 
 
 		 251 aa  187  2e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3354  hypothetical protein  45.22 
 
 		 265 aa  187  2e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3952  protein of unknown function DUF45  40.74 
 
 		 252 aa  181  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0839  hypothetical protein  46.01 
 
 		 237 aa  180  2e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.243328 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2642  hypothetical protein  47.22 
 
 		 228 aa  177  2e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0982  zinc metallopeptidase-like protein  47.22 
 
 		 228 aa  177  2e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1339  hypothetical protein  39.34 
 
 		 243 aa  168  8e-41  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0508  hypothetical protein  43.17 
 
 		 233 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.139012 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0094  hypothetical protein  46.58 
 
 		 228 aa  162  5.0000000000000005e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0430  hypothetical protein  46.43 
 
 		 241 aa  155  4e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1800  protein of unknown function DUF45  41.95 
 
 		 240 aa  149  5e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.322708  normal  0.410252 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3676  hypothetical protein  43.38 
 
 		 227 aa  146  3e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2986  conserved hypothetical protein DUF45  39.91 
 
 		 230 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2744  hypothetical protein  32.71 
 
 		 252 aa  132  6.999999999999999e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2307  protein of unknown function DUF45  30.18 
 
 		 244 aa  129  3e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0683  protein of unknown function DUF45  34.52 
 
 		 300 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.436167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2977  hypothetical protein  40.55 
 
 		 227 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0331949 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2855  hypothetical protein  35.24 
 
 		 252 aa  126  4.0000000000000003e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4016  hypothetical protein  35.27 
 
 		 300 aa  125  5e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00585617  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0877  hypothetical protein  34.89 
 
 		 292 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2427  hypothetical protein  34.89 
 
 		 292 aa  125  9e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.656656  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0215  hypothetical protein  34.89 
 
 		 292 aa  125  9e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.585984  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2347  hypothetical protein  34.89 
 
 		 292 aa  125  9e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0713  hypothetical protein  34.89 
 
 		 292 aa  125  9e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2731  hypothetical protein  34.89 
 
 		 292 aa  125  9e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.896479  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0698  hypothetical protein  34.89 
 
 		 292 aa  125  9e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0641  hypothetical protein  33.8 
 
 		 236 aa  123  3e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4654  hypothetical protein  37.55 
 
 		 239 aa  122  4e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.791009  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0581  hypothetical protein  34.47 
 
 		 295 aa  123  4e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0402  hypothetical protein  34.23 
 
 		 285 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.450593  normal  0.256851 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0036  protein of unknown function DUF45  30.36 
 
 		 262 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1480  hypothetical protein  36.07 
 
 		 268 aa  116  3e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1763  protein of unknown function DUF45  31.74 
 
 		 246 aa  115  5e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0594  hypothetical protein  31.95 
 
 		 301 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1789  hypothetical protein  29.77 
 
 		 238 aa  114  2.0000000000000002e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2818  hypothetical protein  36.86 
 
 		 240 aa  113  3e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.608131  normal  0.17098 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1707  hypothetical protein  26.47 
 
 		 239 aa  112  5e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.182955  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2622  hypothetical protein  32.87 
 
 		 285 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.276697  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2093  hypothetical protein  33.03 
 
 		 295 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.786818  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2705  hypothetical protein  33.03 
 
 		 295 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.319747  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0397  protein of unknown function DUF45  34.83 
 
 		 292 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.119001  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0412  protein of unknown function DUF45  34.83 
 
 		 292 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.505198  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4297  hypothetical protein  24.89 
 
 		 251 aa  110  2.0000000000000002e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2732  hypothetical protein  32.87 
 
 		 295 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6032  hypothetical protein  32.87 
 
 		 316 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2757  hypothetical protein  32.87 
 
 		 303 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.328108  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0521  hypothetical protein  34.83 
 
 		 288 aa  109  4.0000000000000004e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0129218 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3538  hypothetical protein  33.52 
 
 		 239 aa  109  5e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.739224  normal  0.0386409 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2344  hypothetical protein  36.67 
 
 		 217 aa  108  9.000000000000001e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.394808 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1824  hypothetical protein  27.83 
 
 		 224 aa  108  9.000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0503  hypothetical protein  25.68 
 
 		 224 aa  108  1e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0100  protein of unknown function DUF45  40.52 
 
 		 241 aa  106  3e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1181  protein of unknown function DUF45  37.56 
 
 		 242 aa  107  3e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0413  hypothetical protein  26.2 
 
 		 249 aa  106  3e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2889  hypothetical protein  31.15 
 
 		 261 aa  106  3e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.653746  normal  0.363578 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1312  hypothetical protein  30.62 
 
 		 234 aa  105  5e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0504  hypothetical protein  32.37 
 
 		 286 aa  105  6e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.22693  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0151  hypothetical protein  27.56 
 
 		 240 aa  105  7e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0547  hypothetical protein  30.88 
 
 		 218 aa  104  1e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.825313  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_159  hypothetical protein  26.46 
 
 		 240 aa  103  2e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.363835  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0056  protein of unknown function DUF45  34.48 
 
 		 238 aa  103  2e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0443  hypothetical protein  32.34 
 
 		 292 aa  103  4e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.618297 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0220  hypothetical protein  28.57 
 
 		 240 aa  103  4e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0379  hypothetical protein  28.11 
 
 		 237 aa  102  5e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0870  protein of unknown function DUF45  28.12 
 
 		 224 aa  102  5e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0260023  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2910  hypothetical protein  27.5 
 
 		 237 aa  102  6e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04470  predicted metal-dependent hydrolase  25.64 
 
 		 241 aa  102  7e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0373  protein of unknown function DUF45  26.79 
 
 		 242 aa  100  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0899  hypothetical protein  32.56 
 
 		 254 aa  100  3e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000145532 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0542  hypothetical protein  27.4 
 
 		 243 aa  100  3e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2959  protein of unknown function DUF45  38.53 
 
 		 227 aa  99.8  5e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1843  protein of unknown function DUF45  24.51 
 
 		 254 aa  99.8  5e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.224767 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1069  hypothetical protein  41.75 
 
 		 223 aa  99  7e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.262175  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3363  hypothetical protein  31.7 
 
 		 249 aa  99  7e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.211491 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3143  protein of unknown function DUF45  37.61 
 
 		 227 aa  98.2  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0570436  normal  0.976092 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0060  protein of unknown function DUF45  30.64 
 
 		 259 aa  97.4  2e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0071  protein of unknown function DUF45  36.79 
 
 		 223 aa  97.8  2e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>