264 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0010 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009719  Plav_0010  hypothetical protein  100 
 
 
270 aa  550  1e-155  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000896967 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3354  hypothetical protein  47.06 
 
 
265 aa  202  6e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0303  hypothetical protein  45.24 
 
 
266 aa  196  4.0000000000000005e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.037787 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1260  hypothetical protein  42.63 
 
 
256 aa  191  1e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.017504 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3493  hypothetical protein  42.98 
 
 
244 aa  190  2e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.718444  normal  0.055231 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0593  hypothetical protein  44.63 
 
 
260 aa  188  9e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0332404  normal  0.0318611 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0604  protein of unknown function DUF45  44.21 
 
 
241 aa  185  6e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.068795 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0355  hypothetical protein  47.83 
 
 
279 aa  182  6e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0568  protein of unknown function DUF45  43.39 
 
 
241 aa  181  1e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.237402 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0131  hypothetical protein  46.34 
 
 
278 aa  176  3e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.249542 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0228  hypothetical protein  47.32 
 
 
278 aa  173  1.9999999999999998e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.31038  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0324  protein of unknown function DUF45  43.46 
 
 
263 aa  172  7.999999999999999e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00482569 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0064  hypothetical protein  46.34 
 
 
278 aa  171  7.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0579  protein of unknown function DUF45  44.93 
 
 
249 aa  172  7.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.452313  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0125  hypothetical protein  45.63 
 
 
256 aa  171  9e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.84591  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1837  protein of unknown function DUF45  44.5 
 
 
247 aa  171  1e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.37826  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4279  protein of unknown function DUF45  35.43 
 
 
252 aa  171  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7655  putative metal-dependent hydrolase  45.1 
 
 
198 aa  168  1e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.995327  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4887  hypothetical protein  43.64 
 
 
243 aa  165  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.334239  normal  0.0174826 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3952  protein of unknown function DUF45  35.32 
 
 
252 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0430  hypothetical protein  42.92 
 
 
241 aa  160  3e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0668  hypothetical protein  35.71 
 
 
251 aa  154  2e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0018  hypothetical protein  36.86 
 
 
254 aa  154  2e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3235  hypothetical protein  35.74 
 
 
251 aa  152  4e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0982  zinc metallopeptidase-like protein  40.34 
 
 
228 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1800  protein of unknown function DUF45  35.92 
 
 
240 aa  147  2.0000000000000003e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.322708  normal  0.410252 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2642  hypothetical protein  40.34 
 
 
228 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR2113  hypothetical protein  33.05 
 
 
253 aa  143  3e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.301869  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2029  hypothetical protein  33.05 
 
 
255 aa  143  3e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.611915  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0807  hypothetical protein  33.48 
 
 
253 aa  143  4e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0094  hypothetical protein  41.2 
 
 
228 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0508  hypothetical protein  38.1 
 
 
233 aa  140  3e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.139012 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1339  hypothetical protein  37.71 
 
 
243 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2986  conserved hypothetical protein DUF45  37.77 
 
 
230 aa  136  4e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0839  hypothetical protein  38.33 
 
 
237 aa  131  1.0000000000000001e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.243328 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3676  hypothetical protein  35.68 
 
 
227 aa  124  2e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4654  hypothetical protein  35.08 
 
 
239 aa  123  4e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.791009  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2744  hypothetical protein  28.17 
 
 
252 aa  119  7e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1707  hypothetical protein  32.52 
 
 
239 aa  118  9e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.182955  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2977  hypothetical protein  35.22 
 
 
227 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0331949 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0413  hypothetical protein  31.6 
 
 
249 aa  113  4.0000000000000004e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0379  hypothetical protein  28.22 
 
 
237 aa  112  6e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1763  protein of unknown function DUF45  33.2 
 
 
246 aa  111  1.0000000000000001e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0036  protein of unknown function DUF45  30.49 
 
 
262 aa  110  3e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2889  hypothetical protein  28.91 
 
 
261 aa  108  1e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.653746  normal  0.363578 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2307  protein of unknown function DUF45  29.03 
 
 
244 aa  106  4e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1789  hypothetical protein  26.58 
 
 
238 aa  105  8e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04470  predicted metal-dependent hydrolase  27.91 
 
 
241 aa  105  8e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0402  hypothetical protein  29.88 
 
 
245 aa  103  2e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.95027  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0800  hypothetical protein  28 
 
 
237 aa  103  2e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0356506  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1312  hypothetical protein  28.51 
 
 
234 aa  103  4e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3789  hypothetical protein  33.13 
 
 
235 aa  103  4e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0581  hypothetical protein  30.74 
 
 
295 aa  102  5e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1824  hypothetical protein  27.31 
 
 
224 aa  102  5e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0683  protein of unknown function DUF45  28.85 
 
 
300 aa  102  8e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.436167  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0698  hypothetical protein  30.17 
 
 
292 aa  101  1e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2427  hypothetical protein  30.17 
 
 
292 aa  101  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.656656  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0215  hypothetical protein  30.17 
 
 
292 aa  101  1e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.585984  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2818  hypothetical protein  30.92 
 
 
240 aa  101  1e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.608131  normal  0.17098 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4016  hypothetical protein  28.96 
 
 
300 aa  101  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00585617  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2731  hypothetical protein  30.17 
 
 
292 aa  101  1e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.896479  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0713  hypothetical protein  30.17 
 
 
292 aa  101  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2347  hypothetical protein  30.17 
 
 
292 aa  101  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0877  hypothetical protein  30 
 
 
292 aa  100  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0100  protein of unknown function DUF45  40.18 
 
 
241 aa  99.8  4e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05618  hypothetical protein  28.44 
 
 
226 aa  100  4e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2910  hypothetical protein  26.38 
 
 
237 aa  100  4e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2959  protein of unknown function DUF45  28.76 
 
 
227 aa  99.8  4e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0641  hypothetical protein  30.17 
 
 
236 aa  99.8  4e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0899  hypothetical protein  32.73 
 
 
254 aa  99.8  4e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  hitchhiker  0.000145532 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0542  hypothetical protein  28.25 
 
 
243 aa  99  7e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3143  protein of unknown function DUF45  28.33 
 
 
227 aa  98.2  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0570436  normal  0.976092 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0521  hypothetical protein  30.17 
 
 
288 aa  97.4  2e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0129218 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2093  hypothetical protein  29.58 
 
 
295 aa  97.4  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.786818  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2705  hypothetical protein  29.58 
 
 
295 aa  97.4  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.319747  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0870  protein of unknown function DUF45  27.23 
 
 
224 aa  97.4  2e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0260023  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2732  hypothetical protein  29.17 
 
 
295 aa  96.3  4e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2855  hypothetical protein  26.1 
 
 
252 aa  96.7  4e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0402  hypothetical protein  30.53 
 
 
285 aa  96.7  4e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.450593  normal  0.256851 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1084  protein of unknown function DUF45  41.67 
 
 
221 aa  96.3  4e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6032  hypothetical protein  29.17 
 
 
316 aa  96.3  5e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3377  hypothetical protein  29.33 
 
 
320 aa  96.3  5e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.577966 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0594  hypothetical protein  28.93 
 
 
301 aa  95.9  6e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2622  hypothetical protein  29.17 
 
 
285 aa  95.9  6e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.276697  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2595  hypothetical protein  30.97 
 
 
238 aa  95.9  6e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.23171  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2757  hypothetical protein  29.17 
 
 
303 aa  95.9  6e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.328108  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0412  protein of unknown function DUF45  30.52 
 
 
292 aa  94.4  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.505198  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4297  hypothetical protein  35.4 
 
 
251 aa  94.4  2e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1480  hypothetical protein  30 
 
 
268 aa  94.4  2e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0397  protein of unknown function DUF45  30.52 
 
 
292 aa  94.4  2e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.119001  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0443  hypothetical protein  28.24 
 
 
292 aa  94.4  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.618297 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0504  hypothetical protein  30.05 
 
 
286 aa  93.6  3e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.22693  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2393  hypothetical protein  25.73 
 
 
244 aa  93.2  4e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4036  hypothetical protein  26.64 
 
 
234 aa  92.8  5e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0056  protein of unknown function DUF45  28.84 
 
 
238 aa  92.8  6e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0373  protein of unknown function DUF45  25.1 
 
 
242 aa  92.8  6e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0505  hypothetical protein  30.54 
 
 
233 aa  92.4  6e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.722938 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1951  hypothetical protein  28.57 
 
 
481 aa  92  8e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1102  zinc metalloprotease  26.51 
 
 
243 aa  92  9e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00846989  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3363  hypothetical protein  29.74 
 
 
249 aa  92  9e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.211491 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>