261 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_0100 on replicon NC_009076
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009076  BURPS1106A_0100  hypothetical protein  100 
 
 
231 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.58057  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0505  hypothetical protein  57.94 
 
 
233 aa  287  8e-77  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.722938 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4010  hypothetical protein  40 
 
 
253 aa  181  1e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.836815 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0568  hypothetical protein  35.04 
 
 
235 aa  167  1e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000566322 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4036  hypothetical protein  35.47 
 
 
234 aa  165  6.9999999999999995e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05618  hypothetical protein  33.63 
 
 
226 aa  158  8e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1824  hypothetical protein  31.19 
 
 
224 aa  151  7e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2959  protein of unknown function DUF45  33.93 
 
 
227 aa  150  1e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3143  protein of unknown function DUF45  33.48 
 
 
227 aa  149  3e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0570436  normal  0.976092 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0870  protein of unknown function DUF45  32.11 
 
 
224 aa  147  1.0000000000000001e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0260023  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2255  zinc metalloprotease  34.51 
 
 
227 aa  147  1.0000000000000001e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0503  hypothetical protein  29.67 
 
 
224 aa  141  7e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0071  protein of unknown function DUF45  27.68 
 
 
223 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1789  hypothetical protein  32.72 
 
 
238 aa  140  1.9999999999999998e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2307  protein of unknown function DUF45  30.26 
 
 
244 aa  139  4.999999999999999e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2910  hypothetical protein  34.06 
 
 
237 aa  135  5e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2393  hypothetical protein  32.14 
 
 
244 aa  135  5e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1069  hypothetical protein  30.14 
 
 
223 aa  134  9e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.262175  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0899  hypothetical protein  32.52 
 
 
254 aa  134  9.999999999999999e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  hitchhiker  0.000145532 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2794  protein of unknown function DUF45  35.71 
 
 
242 aa  131  6.999999999999999e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0182535  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3789  hypothetical protein  36.27 
 
 
235 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0379  hypothetical protein  33.64 
 
 
237 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1843  protein of unknown function DUF45  29.66 
 
 
254 aa  127  1.0000000000000001e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.224767 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0542  hypothetical protein  28.02 
 
 
243 aa  125  8.000000000000001e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2595  hypothetical protein  25.91 
 
 
238 aa  122  3e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.23171  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0056  protein of unknown function DUF45  35.91 
 
 
238 aa  118  7e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04470  predicted metal-dependent hydrolase  27.95 
 
 
241 aa  117  1.9999999999999998e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2889  hypothetical protein  33.47 
 
 
261 aa  117  1.9999999999999998e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.653746  normal  0.363578 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0800  hypothetical protein  28.57 
 
 
237 aa  117  1.9999999999999998e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0356506  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1474  hypothetical protein  44.03 
 
 
137 aa  115  5e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.360877  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0843  hypothetical protein  30.91 
 
 
246 aa  114  8.999999999999998e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.335069  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0791  hypothetical protein  30.91 
 
 
246 aa  114  8.999999999999998e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.371001  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1102  zinc metalloprotease  28.63 
 
 
243 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00846989  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0309  zinc metalloprotease  30.99 
 
 
235 aa  112  3e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.122687  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0431  hypothetical protein  29.67 
 
 
235 aa  112  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00811962  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0322  hypothetical protein  30.81 
 
 
235 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000118894  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0306  zinc metalloprotease  30.33 
 
 
235 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0337  hypothetical protein  30.81 
 
 
235 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000389941  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0369  hypothetical protein  30.81 
 
 
235 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0384  zinc metalloprotease  30.81 
 
 
235 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0625718  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0683  protein of unknown function DUF45  29.24 
 
 
300 aa  110  3e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.436167  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0617  hypothetical protein  29.33 
 
 
222 aa  109  3e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.236846  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0431  hypothetical protein  29.86 
 
 
235 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0317  hypothetical protein  29.58 
 
 
235 aa  108  8.000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4016  hypothetical protein  28.81 
 
 
300 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00585617  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0402  hypothetical protein  28.76 
 
 
285 aa  105  8e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.450593  normal  0.256851 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0594  hypothetical protein  28.94 
 
 
301 aa  103  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2622  hypothetical protein  29.78 
 
 
285 aa  103  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.276697  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2107  hypothetical protein  35.16 
 
 
240 aa  103  2e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2343  hypothetical protein  32.13 
 
 
238 aa  103  2e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.781257  normal  0.0217963 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2093  hypothetical protein  29.78 
 
 
295 aa  103  3e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.786818  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2705  hypothetical protein  29.78 
 
 
295 aa  103  3e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.319747  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2757  hypothetical protein  29.33 
 
 
303 aa  102  4e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.328108  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2732  hypothetical protein  29.33 
 
 
295 aa  102  5e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3354  hypothetical protein  33.33 
 
 
265 aa  102  6e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6032  hypothetical protein  29.33 
 
 
316 aa  101  8e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0581  hypothetical protein  27.12 
 
 
295 aa  100  1e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2484  hypothetical protein  26.84 
 
 
245 aa  100  2e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.186682  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0215  hypothetical protein  27.54 
 
 
292 aa  99.8  3e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.585984  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2427  hypothetical protein  27.54 
 
 
292 aa  99.8  3e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.656656  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0713  hypothetical protein  27.54 
 
 
292 aa  99.8  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0698  hypothetical protein  27.54 
 
 
292 aa  99.8  3e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2731  hypothetical protein  27.54 
 
 
292 aa  99.8  3e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.896479  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2347  hypothetical protein  27.54 
 
 
292 aa  99.8  3e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0877  hypothetical protein  27.75 
 
 
292 aa  99.4  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0397  protein of unknown function DUF45  28.02 
 
 
292 aa  99.4  4e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.119001  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0412  protein of unknown function DUF45  28.02 
 
 
292 aa  99.4  5e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.505198  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1707  hypothetical protein  24.69 
 
 
239 aa  98.6  7e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.182955  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0083  hypothetical protein  28.5 
 
 
222 aa  98.2  1e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  decreased coverage  0.000843512  decreased coverage  0.0000753316 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0303  hypothetical protein  32.17 
 
 
266 aa  97.4  1e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.037787 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0100  protein of unknown function DUF45  27.75 
 
 
241 aa  97.8  1e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0949  hypothetical protein  27.54 
 
 
219 aa  97.1  2e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0658473  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1951  hypothetical protein  24.78 
 
 
481 aa  97.1  2e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06805  hypothetical protein  26.82 
 
 
258 aa  97.1  2e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4297  hypothetical protein  22.4 
 
 
251 aa  96.3  3e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0413  hypothetical protein  24.12 
 
 
249 aa  96.3  3e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1312  hypothetical protein  25.52 
 
 
234 aa  95.1  9e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0036  protein of unknown function DUF45  25.66 
 
 
262 aa  94.7  1e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1339  hypothetical protein  29.38 
 
 
243 aa  94.7  1e-18  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0504  hypothetical protein  28.26 
 
 
286 aa  93.2  3e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.22693  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0443  hypothetical protein  29.26 
 
 
292 aa  92.4  5e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.618297 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0984  zinc metalloprotease  24.64 
 
 
221 aa  92.4  5e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1819  hypothetical protein  27.75 
 
 
222 aa  92  7e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1763  protein of unknown function DUF45  29.15 
 
 
246 aa  91.7  8e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2744  hypothetical protein  23.25 
 
 
252 aa  91.7  9e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0151  hypothetical protein  25.34 
 
 
240 aa  91.7  1e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0521  hypothetical protein  28.76 
 
 
288 aa  91.7  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0129218 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2274  protein of unknown function DUF45  29.52 
 
 
243 aa  89.4  4e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0373  protein of unknown function DUF45  25.86 
 
 
242 aa  88.6  7e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0430  hypothetical protein  30.85 
 
 
241 aa  88.6  8e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0604  protein of unknown function DUF45  29.91 
 
 
241 aa  88.2  9e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.068795 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0760  hypothetical protein  31.67 
 
 
244 aa  87.8  1e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0982  zinc metallopeptidase-like protein  31.74 
 
 
228 aa  88.2  1e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0906  protein of unknown function DUF45  31.67 
 
 
244 aa  87.8  1e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.876537  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0593  hypothetical protein  29.91 
 
 
260 aa  87.8  1e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0332404  normal  0.0318611 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1858  protein of unknown function DUF45  23.98 
 
 
226 aa  87  2e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000912457  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0220  hypothetical protein  24.55 
 
 
240 aa  86.3  4e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1114  hypothetical protein  24.56 
 
 
254 aa  85.9  4e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1098  hypothetical protein  26.7 
 
 
222 aa  85.9  5e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_159  hypothetical protein  23.96 
 
 
240 aa  85.5  6e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.363835  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>