251 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0365 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE0365  hypothetical protein  100 
 
 
232 aa  478  1e-134  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0669057  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0860  hypothetical protein  41.88 
 
 
238 aa  206  2e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2675  hypothetical protein  40.79 
 
 
243 aa  203  2e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.49786 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0401  hypothetical protein  44.89 
 
 
233 aa  203  2e-51  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2198  hypothetical protein  44.74 
 
 
247 aa  202  4e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.403347  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0947  hypothetical protein  40.69 
 
 
245 aa  201  6e-51  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  unclonable  0.0000214537 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4620  protein of unknown function DUF45  35.81 
 
 
242 aa  192  4e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.212345 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0431  protein of unknown function DUF45  38.22 
 
 
239 aa  183  2.0000000000000003e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1774  zinc metalloprotease  37.39 
 
 
238 aa  181  1e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0244  hypothetical protein  37.33 
 
 
253 aa  176  3e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0906  protein of unknown function DUF45  36.94 
 
 
244 aa  175  6e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.876537  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0760  hypothetical protein  36.94 
 
 
244 aa  175  6e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0555  zinc metalloprotease  35.4 
 
 
239 aa  164  6.9999999999999995e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0652798  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0543  peptidase S26A, signal peptidase I  35.4 
 
 
236 aa  157  1e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00150578  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0459  hypothetical protein  35.53 
 
 
235 aa  153  2e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0435  hypothetical protein  36.28 
 
 
235 aa  152  5e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0617  hypothetical protein  35.32 
 
 
222 aa  128  8.000000000000001e-29  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.236846  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1858  protein of unknown function DUF45  33.18 
 
 
226 aa  125  4.0000000000000003e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000912457  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1819  hypothetical protein  34.86 
 
 
222 aa  125  5e-28  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1098  hypothetical protein  34.4 
 
 
222 aa  124  2e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0949  hypothetical protein  33.8 
 
 
219 aa  119  3e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0658473  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0083  hypothetical protein  32.88 
 
 
222 aa  118  7.999999999999999e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  decreased coverage  0.000843512  decreased coverage  0.0000753316 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0977  protein of unknown function DUF45  31.02 
 
 
259 aa  118  9e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04860  predicted metal-dependent hydrolase  27.68 
 
 
184 aa  116  3e-25  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0984  zinc metalloprotease  33.03 
 
 
221 aa  111  1.0000000000000001e-23  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07420  predicted metal-dependent hydrolase  27.68 
 
 
198 aa  110  3e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.654381  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1416  putative metal-dependent hydrolase  27.78 
 
 
268 aa  108  8.000000000000001e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2550  hypothetical protein  27.97 
 
 
231 aa  105  5e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.52441  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2668  protein of unknown function DUF45  29.41 
 
 
202 aa  104  9e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.255358  normal  0.761746 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0156  hypothetical protein  30.28 
 
 
270 aa  102  5e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4201  protein of unknown function DUF45  30.09 
 
 
245 aa  101  9e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2141  hypothetical protein  29.82 
 
 
233 aa  98.2  1e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0199813 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2910  hypothetical protein  27.18 
 
 
237 aa  98.2  1e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1114  hypothetical protein  31.09 
 
 
254 aa  97.4  2e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06805  hypothetical protein  29.77 
 
 
258 aa  97.1  2e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2343  hypothetical protein  27.03 
 
 
238 aa  96.3  4e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.781257  normal  0.0217963 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2082  hypothetical protein  26.58 
 
 
222 aa  94.7  1e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1591  protein of unknown function DUF45  35.53 
 
 
153 aa  94.4  2e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.961397  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3548  hypothetical protein  29.19 
 
 
242 aa  93.6  2e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.405363  normal  0.224983 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1894  hypothetical protein  28.16 
 
 
242 aa  92.4  5e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.470997  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2484  hypothetical protein  29.58 
 
 
245 aa  90.5  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.186682  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2393  hypothetical protein  26.6 
 
 
244 aa  90.1  2e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0015  hypothetical protein  27.4 
 
 
247 aa  90.1  3e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000114472  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2542  protein of unknown function DUF45  29.28 
 
 
242 aa  89  6e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.65103  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2595  hypothetical protein  26.01 
 
 
238 aa  83.2  0.000000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.23171  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1800  hypothetical protein  27.75 
 
 
222 aa  82  0.000000000000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.404735  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0899  hypothetical protein  26.32 
 
 
254 aa  81.6  0.000000000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  hitchhiker  0.000145532 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1789  hypothetical protein  27.18 
 
 
238 aa  81.3  0.00000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0379  hypothetical protein  26.7 
 
 
237 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1632  protein of unknown function DUF45  27.57 
 
 
232 aa  79.7  0.00000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0542  hypothetical protein  27.41 
 
 
243 aa  79  0.00000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2274  protein of unknown function DUF45  25.98 
 
 
243 aa  79  0.00000000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0100  protein of unknown function DUF45  29.1 
 
 
241 aa  78.6  0.00000000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3363  hypothetical protein  23.74 
 
 
249 aa  78.6  0.00000000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.211491 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4036  hypothetical protein  27.88 
 
 
234 aa  77.8  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0649  hypothetical protein  26.83 
 
 
215 aa  77.8  0.0000000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0723  hypothetical protein  26.83 
 
 
220 aa  77  0.0000000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.835761  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0060  protein of unknown function DUF45  25.42 
 
 
259 aa  77  0.0000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1049  hypothetical protein  28.78 
 
 
215 aa  77  0.0000000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0449963  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2307  protein of unknown function DUF45  26.32 
 
 
244 aa  77.4  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0402  hypothetical protein  24.2 
 
 
245 aa  76.6  0.0000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.95027  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0056  protein of unknown function DUF45  26.67 
 
 
238 aa  76.6  0.0000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0843  hypothetical protein  29.15 
 
 
246 aa  76.3  0.0000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.335069  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0791  hypothetical protein  29.15 
 
 
246 aa  76.3  0.0000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.371001  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2794  protein of unknown function DUF45  24.75 
 
 
242 aa  75.9  0.0000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0182535  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0151  hypothetical protein  27.18 
 
 
240 aa  75.9  0.0000000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0220  hypothetical protein  26.92 
 
 
240 aa  75.9  0.0000000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0431  hypothetical protein  26.91 
 
 
235 aa  75.9  0.0000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00811962  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1312  hypothetical protein  27 
 
 
234 aa  75.5  0.0000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2889  hypothetical protein  25.69 
 
 
261 aa  74.7  0.000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.653746  normal  0.363578 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_159  hypothetical protein  28.16 
 
 
240 aa  73.9  0.000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.363835  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03844  hypothetical protein  25.13 
 
 
263 aa  73.2  0.000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0794  conserved hypothetical protein (DUF45 domain protein)  27.45 
 
 
221 aa  73.2  0.000000000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.308629  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0727  protein of unknown function DUF45  24.42 
 
 
223 aa  72.8  0.000000000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0431  hypothetical protein  25.56 
 
 
235 aa  72.8  0.000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05618  hypothetical protein  28.34 
 
 
226 aa  72.8  0.000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3789  hypothetical protein  25.63 
 
 
235 aa  72.8  0.000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0309  zinc metalloprotease  24.66 
 
 
235 aa  72.4  0.000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.122687  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0397  protein of unknown function DUF45  28.37 
 
 
292 aa  72.4  0.000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.119001  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0412  protein of unknown function DUF45  28.37 
 
 
292 aa  72.4  0.000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.505198  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1661  protein of unknown function DUF45  28.97 
 
 
244 aa  72  0.000000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.843742  normal  0.112904 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0521  hypothetical protein  27.44 
 
 
288 aa  71.2  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0129218 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0100  hypothetical protein  26.46 
 
 
231 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.58057  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0505  hypothetical protein  26.26 
 
 
233 aa  71.6  0.00000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.722938 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0641  hypothetical protein  27.69 
 
 
236 aa  70.1  0.00000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0384  zinc metalloprotease  25.33 
 
 
235 aa  70.1  0.00000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0625718  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0317  hypothetical protein  25.11 
 
 
235 aa  70.1  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0369  hypothetical protein  26.43 
 
 
235 aa  69.7  0.00000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0322  hypothetical protein  25.11 
 
 
235 aa  68.9  0.00000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000118894  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0337  hypothetical protein  25.11 
 
 
235 aa  68.9  0.00000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000389941  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0306  zinc metalloprotease  24.66 
 
 
235 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1843  protein of unknown function DUF45  24.67 
 
 
254 aa  67.8  0.0000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.224767 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3538  hypothetical protein  24.09 
 
 
239 aa  68.2  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.739224  normal  0.0386409 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1069  hypothetical protein  27.84 
 
 
223 aa  68.2  0.0000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.262175  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0535  hypothetical protein  28.44 
 
 
206 aa  67.8  0.0000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2732  hypothetical protein  28.44 
 
 
295 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0870  protein of unknown function DUF45  29.91 
 
 
224 aa  67.4  0.0000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0260023  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0581  hypothetical protein  27.7 
 
 
295 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2622  hypothetical protein  28.44 
 
 
285 aa  67  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.276697  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2093  hypothetical protein  28.44 
 
 
295 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.786818  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>