259 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_2198 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009665  Shew185_2198  hypothetical protein  100 
 
 
247 aa  510  1e-144  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.403347  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0860  hypothetical protein  61.28 
 
 
238 aa  310  9e-84  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0947  hypothetical protein  53.59 
 
 
245 aa  261  6e-69  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  unclonable  0.0000214537 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2675  hypothetical protein  47.06 
 
 
243 aa  233  1.0000000000000001e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.49786 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4620  protein of unknown function DUF45  46.35 
 
 
242 aa  229  3e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.212345 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0760  hypothetical protein  45.34 
 
 
244 aa  216  4e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0906  protein of unknown function DUF45  45.34 
 
 
244 aa  216  4e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.876537  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0401  hypothetical protein  48.25 
 
 
233 aa  214  9.999999999999999e-55  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1774  zinc metalloprotease  45.34 
 
 
238 aa  213  2.9999999999999995e-54  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0365  hypothetical protein  44.74 
 
 
232 aa  202  5e-51  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0669057  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0431  protein of unknown function DUF45  42.8 
 
 
239 aa  197  1.0000000000000001e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0244  hypothetical protein  40.85 
 
 
253 aa  195  4.0000000000000005e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0555  zinc metalloprotease  40.85 
 
 
239 aa  186  4e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0652798  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0459  hypothetical protein  41.45 
 
 
235 aa  167  1e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0543  peptidase S26A, signal peptidase I  38.43 
 
 
236 aa  167  1e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00150578  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0435  hypothetical protein  40.36 
 
 
235 aa  162  3e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0977  protein of unknown function DUF45  37.5 
 
 
259 aa  149  4e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1591  protein of unknown function DUF45  44.52 
 
 
153 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.961397  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04860  predicted metal-dependent hydrolase  31.84 
 
 
184 aa  122  6e-27  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0949  hypothetical protein  31.05 
 
 
219 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0658473  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2550  hypothetical protein  29.96 
 
 
231 aa  115  5e-25  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.52441  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0984  zinc metalloprotease  29.63 
 
 
221 aa  112  5e-24  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0617  hypothetical protein  32.02 
 
 
222 aa  112  5e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.236846  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2141  hypothetical protein  31.47 
 
 
233 aa  111  1.0000000000000001e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0199813 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1858  protein of unknown function DUF45  32.24 
 
 
226 aa  111  1.0000000000000001e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000912457  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1098  hypothetical protein  31.48 
 
 
222 aa  109  3e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0083  hypothetical protein  31.58 
 
 
222 aa  109  5e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  decreased coverage  0.000843512  decreased coverage  0.0000753316 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1819  hypothetical protein  30.7 
 
 
222 aa  108  6e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2668  protein of unknown function DUF45  45.92 
 
 
202 aa  105  8e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.255358  normal  0.761746 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1800  hypothetical protein  30.49 
 
 
222 aa  102  5e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.404735  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07420  predicted metal-dependent hydrolase  29.03 
 
 
198 aa  102  6e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.654381  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1416  putative metal-dependent hydrolase  29.6 
 
 
268 aa  102  7e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4201  protein of unknown function DUF45  32.3 
 
 
245 aa  100  1e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2082  hypothetical protein  28.7 
 
 
222 aa  99.4  5e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1632  protein of unknown function DUF45  28.44 
 
 
232 aa  99  6e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2484  hypothetical protein  31.8 
 
 
245 aa  97.4  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.186682  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1114  hypothetical protein  30.17 
 
 
254 aa  97.4  2e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2343  hypothetical protein  28.63 
 
 
238 aa  96.7  4e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.781257  normal  0.0217963 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2542  protein of unknown function DUF45  29.73 
 
 
242 aa  93.6  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.65103  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06805  hypothetical protein  29.34 
 
 
258 aa  92.4  6e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0794  conserved hypothetical protein (DUF45 domain protein)  25.66 
 
 
221 aa  90.1  3e-17  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.308629  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0568  hypothetical protein  29.06 
 
 
235 aa  89.7  3e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000566322 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04470  predicted metal-dependent hydrolase  30.45 
 
 
241 aa  87.8  1e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0156  hypothetical protein  27.52 
 
 
270 aa  87.4  2e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0843  hypothetical protein  28.15 
 
 
246 aa  86.3  4e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.335069  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0791  hypothetical protein  28.15 
 
 
246 aa  86.3  4e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.371001  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0535  hypothetical protein  26.11 
 
 
206 aa  85.5  7e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2393  hypothetical protein  27.93 
 
 
244 aa  85.1  9e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3143  protein of unknown function DUF45  31.09 
 
 
227 aa  84  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0570436  normal  0.976092 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2959  protein of unknown function DUF45  31.09 
 
 
227 aa  84  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3548  hypothetical protein  31.07 
 
 
242 aa  82.4  0.000000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.405363  normal  0.224983 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0056  protein of unknown function DUF45  28.43 
 
 
238 aa  82.4  0.000000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2307  protein of unknown function DUF45  26.37 
 
 
244 aa  81.6  0.000000000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0646  hypothetical protein  25.54 
 
 
220 aa  81.6  0.00000000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2744  hypothetical protein  26.92 
 
 
252 aa  80.9  0.00000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1843  protein of unknown function DUF45  24.1 
 
 
254 aa  79  0.00000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.224767 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0542  hypothetical protein  24.63 
 
 
243 aa  79.3  0.00000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_159  hypothetical protein  26.92 
 
 
240 aa  79  0.00000000000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.363835  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05618  hypothetical protein  30.26 
 
 
226 aa  79  0.00000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0647  hypothetical protein  25.57 
 
 
215 aa  79  0.00000000000007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.764633  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2910  hypothetical protein  27.59 
 
 
237 aa  78.6  0.00000000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1894  hypothetical protein  27.91 
 
 
242 aa  78.6  0.00000000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.470997  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2595  hypothetical protein  25.11 
 
 
238 aa  77.4  0.0000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.23171  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0151  hypothetical protein  26.44 
 
 
240 aa  77  0.0000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0220  hypothetical protein  26.92 
 
 
240 aa  76.6  0.0000000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0402  hypothetical protein  29.19 
 
 
245 aa  74.7  0.000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.95027  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3538  hypothetical protein  26.56 
 
 
239 aa  74.7  0.000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.739224  normal  0.0386409 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0373  protein of unknown function DUF45  27.4 
 
 
242 aa  74.7  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2255  zinc metalloprotease  29.69 
 
 
227 aa  75.1  0.000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0727  protein of unknown function DUF45  25.71 
 
 
223 aa  74.7  0.000000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0870  protein of unknown function DUF45  25.51 
 
 
224 aa  74.3  0.000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0260023  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3363  hypothetical protein  27.27 
 
 
249 aa  72.8  0.000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.211491 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1049  hypothetical protein  25.48 
 
 
215 aa  72  0.000000000008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0449963  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2889  hypothetical protein  25.33 
 
 
261 aa  72  0.000000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.653746  normal  0.363578 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1312  hypothetical protein  26.48 
 
 
234 aa  72  0.000000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0100  protein of unknown function DUF45  33 
 
 
241 aa  71.6  0.00000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1102  zinc metalloprotease  27.23 
 
 
243 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00846989  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0079  zinc metalloprotease  23.08 
 
 
230 aa  71.6  0.00000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0200194  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0503  hypothetical protein  23.53 
 
 
224 aa  71.2  0.00000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2274  protein of unknown function DUF45  27.4 
 
 
243 aa  71.2  0.00000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2107  hypothetical protein  23.91 
 
 
240 aa  71.2  0.00000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0015  hypothetical protein  29.35 
 
 
247 aa  70.9  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000114472  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1069  hypothetical protein  27.04 
 
 
225 aa  70.1  0.00000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.887273  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0397  protein of unknown function DUF45  36.36 
 
 
292 aa  70.1  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.119001  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0800  hypothetical protein  23.15 
 
 
237 aa  70.1  0.00000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0356506  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0723  hypothetical protein  33.65 
 
 
220 aa  69.7  0.00000000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.835761  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0412  protein of unknown function DUF45  27.59 
 
 
292 aa  69.7  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.505198  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0561  protein of unknown function DUF45  31.07 
 
 
211 aa  69.7  0.00000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1789  hypothetical protein  24.26 
 
 
238 aa  69.3  0.00000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4036  hypothetical protein  26.34 
 
 
234 aa  69.7  0.00000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4016  hypothetical protein  24.79 
 
 
300 aa  68.9  0.00000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00585617  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0581  hypothetical protein  23.4 
 
 
295 aa  68.9  0.00000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3235  hypothetical protein  23.53 
 
 
251 aa  68.6  0.00000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1661  protein of unknown function DUF45  28.64 
 
 
244 aa  68.2  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.843742  normal  0.112904 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0649  hypothetical protein  31.73 
 
 
215 aa  68.2  0.0000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2794  protein of unknown function DUF45  27.14 
 
 
242 aa  68.2  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0182535  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0521  hypothetical protein  36.19 
 
 
288 aa  67.8  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0129218 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0594  hypothetical protein  22.36 
 
 
301 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1164  hypothetical protein  32.76 
 
 
141 aa  67.4  0.0000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1951  hypothetical protein  26.24 
 
 
481 aa  67.8  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>