237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE2550 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE2550  hypothetical protein  100 
 
 
231 aa  471  1e-132  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.52441  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0459  hypothetical protein  32.02 
 
 
235 aa  129  3e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0435  hypothetical protein  31.42 
 
 
235 aa  127  1.0000000000000001e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0947  hypothetical protein  27.95 
 
 
245 aa  117  9.999999999999999e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  unclonable  0.0000214537 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1774  zinc metalloprotease  28.19 
 
 
238 aa  115  3.9999999999999997e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2198  hypothetical protein  29.96 
 
 
247 aa  115  3.9999999999999997e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.403347  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0860  hypothetical protein  26.75 
 
 
238 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4620  protein of unknown function DUF45  25.33 
 
 
242 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.212345 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0401  hypothetical protein  31.28 
 
 
233 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0365  hypothetical protein  27.97 
 
 
232 aa  105  5e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0669057  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0431  protein of unknown function DUF45  27.56 
 
 
239 aa  101  8e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0977  protein of unknown function DUF45  28.44 
 
 
259 aa  101  1e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0555  zinc metalloprotease  26.36 
 
 
239 aa  100  2e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0652798  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1819  hypothetical protein  32.14 
 
 
222 aa  99.4  5e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0244  hypothetical protein  27.56 
 
 
253 aa  97.4  2e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0083  hypothetical protein  30.49 
 
 
222 aa  95.9  5e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  decreased coverage  0.000843512  decreased coverage  0.0000753316 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0543  peptidase S26A, signal peptidase I  24.89 
 
 
236 aa  95.1  7e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00150578  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0760  hypothetical protein  25 
 
 
244 aa  94.4  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0220  hypothetical protein  30.13 
 
 
240 aa  93.6  2e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0906  protein of unknown function DUF45  25 
 
 
244 aa  94.4  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.876537  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2668  protein of unknown function DUF45  41.49 
 
 
202 aa  92.4  5e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.255358  normal  0.761746 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1416  putative metal-dependent hydrolase  27.31 
 
 
268 aa  91.3  1e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1098  hypothetical protein  29.6 
 
 
222 aa  90.9  1e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0151  hypothetical protein  27.51 
 
 
240 aa  90.9  2e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_159  hypothetical protein  27.51 
 
 
240 aa  89.7  3e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.363835  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0984  zinc metalloprotease  26.76 
 
 
221 aa  88.2  1e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07420  predicted metal-dependent hydrolase  39.78 
 
 
198 aa  87.4  2e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.654381  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1858  protein of unknown function DUF45  26.58 
 
 
226 aa  84  0.000000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000912457  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2675  hypothetical protein  24.66 
 
 
243 aa  82  0.000000000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.49786 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0949  hypothetical protein  29.89 
 
 
219 aa  80.9  0.00000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0658473  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04860  predicted metal-dependent hydrolase  27.78 
 
 
184 aa  80.9  0.00000000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4201  protein of unknown function DUF45  23.89 
 
 
245 aa  77.4  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0617  hypothetical protein  26.05 
 
 
222 aa  77.4  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.236846  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2082  hypothetical protein  22.58 
 
 
222 aa  76.6  0.0000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3363  hypothetical protein  26.58 
 
 
249 aa  75.1  0.0000000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.211491 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0727  protein of unknown function DUF45  25.23 
 
 
223 aa  74.7  0.000000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0542  hypothetical protein  24.75 
 
 
243 aa  74.3  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1800  hypothetical protein  24.75 
 
 
222 aa  73.9  0.000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.404735  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0794  conserved hypothetical protein (DUF45 domain protein)  24.67 
 
 
221 aa  73.2  0.000000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.308629  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2219  protein of unknown function DUF45  45.78 
 
 
108 aa  72.8  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2282  protein of unknown function DUF45  45.78 
 
 
108 aa  72.8  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.879838  hitchhiker  0.00256901 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2307  protein of unknown function DUF45  29.05 
 
 
244 aa  72  0.000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0807  hypothetical protein  22.75 
 
 
253 aa  70.5  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0646  hypothetical protein  27.01 
 
 
220 aa  70.1  0.00000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2141  hypothetical protein  32.61 
 
 
233 aa  68.9  0.00000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0199813 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0402  hypothetical protein  25.93 
 
 
245 aa  68.6  0.00000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.95027  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1632  protein of unknown function DUF45  28.83 
 
 
232 aa  68.2  0.00000000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4016  hypothetical protein  24.71 
 
 
300 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00585617  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0015  hypothetical protein  25.22 
 
 
247 aa  67.8  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000114472  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0413  hypothetical protein  35.05 
 
 
249 aa  67.4  0.0000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1069  hypothetical protein  27.67 
 
 
225 aa  66.6  0.0000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.887273  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0683  protein of unknown function DUF45  24.71 
 
 
300 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.436167  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0604  protein of unknown function DUF45  22.4 
 
 
241 aa  65.5  0.0000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.068795 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0406  hypothetical protein  24.15 
 
 
257 aa  65.5  0.0000000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.317112  normal  0.0115722 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0317  hypothetical protein  26.19 
 
 
235 aa  64.7  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1707  hypothetical protein  26.9 
 
 
239 aa  64.7  0.000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.182955  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0593  hypothetical protein  21.99 
 
 
260 aa  64.7  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0332404  normal  0.0318611 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1591  protein of unknown function DUF45  31.39 
 
 
153 aa  64.7  0.000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.961397  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0384  zinc metalloprotease  26.94 
 
 
235 aa  63.5  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0625718  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1661  protein of unknown function DUF45  23.85 
 
 
244 aa  64.3  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.843742  normal  0.112904 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1951  hypothetical protein  24.24 
 
 
481 aa  64.3  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0018  hypothetical protein  23.22 
 
 
254 aa  63.9  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0402  hypothetical protein  24.88 
 
 
285 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.450593  normal  0.256851 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0156  hypothetical protein  45.16 
 
 
270 aa  63.5  0.000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1155  metal-dependent hydrolase-like  46.84 
 
 
111 aa  63.5  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.439664  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1339  hypothetical protein  22.73 
 
 
243 aa  63.5  0.000000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3235  hypothetical protein  23.56 
 
 
251 aa  63.2  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2293  hypothetical protein  26.11 
 
 
227 aa  63.5  0.000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0804  zinc metalloprotease, putative  35.24 
 
 
229 aa  63.2  0.000000004  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0843  hypothetical protein  24.62 
 
 
246 aa  62.4  0.000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.335069  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0791  hypothetical protein  24.62 
 
 
246 aa  62.4  0.000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.371001  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0431  hypothetical protein  25.91 
 
 
235 aa  62.8  0.000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0079  zinc metalloprotease  23.68 
 
 
230 aa  62.8  0.000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0200194  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2889  hypothetical protein  28.68 
 
 
261 aa  62.4  0.000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.653746  normal  0.363578 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0309  zinc metalloprotease  25.71 
 
 
235 aa  62.4  0.000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.122687  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0508  hypothetical protein  24.54 
 
 
233 aa  62.4  0.000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.139012 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1894  hypothetical protein  33.04 
 
 
242 aa  62  0.000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.470997  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2029  hypothetical protein  21.05 
 
 
255 aa  62  0.000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.611915  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2113  hypothetical protein  21.05 
 
 
253 aa  62  0.000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.301869  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06805  hypothetical protein  24.42 
 
 
258 aa  61.6  0.000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2107  hypothetical protein  22.75 
 
 
240 aa  62  0.000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0431  hypothetical protein  26.42 
 
 
235 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00811962  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0982  zinc metallopeptidase-like protein  23 
 
 
228 aa  61.2  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0228  hypothetical protein  38.16 
 
 
151 aa  61.6  0.00000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3789  hypothetical protein  23.08 
 
 
235 aa  61.2  0.00000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0306  zinc metalloprotease  26.42 
 
 
235 aa  60.8  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl659  zinc metalloprotease  28.66 
 
 
238 aa  60.5  0.00000002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1114  hypothetical protein  24.89 
 
 
254 aa  60.8  0.00000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0303  hypothetical protein  23.67 
 
 
266 aa  60.5  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.037787 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2274  protein of unknown function DUF45  21.46 
 
 
243 aa  60.8  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1837  protein of unknown function DUF45  23.62 
 
 
247 aa  60.8  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.37826  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0373  protein of unknown function DUF45  20.85 
 
 
242 aa  60.1  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0259  hypothetical protein  35.06 
 
 
149 aa  59.7  0.00000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0668  hypothetical protein  23.11 
 
 
251 aa  60.1  0.00000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0505  hypothetical protein  26.05 
 
 
233 aa  60.1  0.00000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.722938 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3538  hypothetical protein  24.5 
 
 
239 aa  59.7  0.00000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.739224  normal  0.0386409 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1824  hypothetical protein  24.89 
 
 
224 aa  59.7  0.00000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0647  hypothetical protein  26.18 
 
 
215 aa  59.3  0.00000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.764633  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0561  protein of unknown function DUF45  26.12 
 
 
211 aa  59.3  0.00000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0899  hypothetical protein  24.66 
 
 
254 aa  58.9  0.00000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  hitchhiker  0.000145532 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>