298 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_04860 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013170  Ccur_04860  predicted metal-dependent hydrolase  100 
 
 
184 aa  378  1e-104  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2668  protein of unknown function DUF45  56.57 
 
 
202 aa  188  4e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.255358  normal  0.761746 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07420  predicted metal-dependent hydrolase  45.51 
 
 
198 aa  174  6e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.654381  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0543  peptidase S26A, signal peptidase I  32.11 
 
 
236 aa  122  2e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00150578  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2198  hypothetical protein  31.84 
 
 
247 aa  122  4e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.403347  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0555  zinc metalloprotease  30.63 
 
 
239 aa  120  9.999999999999999e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0652798  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0365  hypothetical protein  27.68 
 
 
232 aa  116  1.9999999999999998e-25  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0669057  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0459  hypothetical protein  30.84 
 
 
235 aa  114  6e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0435  hypothetical protein  30.37 
 
 
235 aa  114  7.999999999999999e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0401  hypothetical protein  29.82 
 
 
233 aa  108  4.0000000000000004e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0860  hypothetical protein  30.77 
 
 
238 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1774  zinc metalloprotease  30.53 
 
 
238 aa  108  5e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0947  hypothetical protein  28.7 
 
 
245 aa  108  5e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  unclonable  0.0000214537 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2675  hypothetical protein  30 
 
 
243 aa  108  6e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.49786 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0760  hypothetical protein  30.74 
 
 
244 aa  104  6e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0906  protein of unknown function DUF45  30.74 
 
 
244 aa  104  6e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.876537  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0431  protein of unknown function DUF45  29.07 
 
 
239 aa  102  4e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4620  protein of unknown function DUF45  29.55 
 
 
242 aa  101  6e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.212345 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2082  hypothetical protein  32.47 
 
 
222 aa  100  1e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0244  hypothetical protein  29.55 
 
 
253 aa  100  1e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1800  hypothetical protein  30.69 
 
 
222 aa  96.3  2e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.404735  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2141  hypothetical protein  33.17 
 
 
233 aa  95.1  5e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0199813 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1858  protein of unknown function DUF45  29.17 
 
 
226 aa  95.1  5e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000912457  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1416  putative metal-dependent hydrolase  46.67 
 
 
268 aa  89.7  2e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1098  hypothetical protein  27.91 
 
 
222 aa  87.8  9e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0617  hypothetical protein  26.98 
 
 
222 aa  87.4  1e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.236846  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0083  hypothetical protein  27.91 
 
 
222 aa  86.7  2e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  decreased coverage  0.000843512  decreased coverage  0.0000753316 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3676  hypothetical protein  32.41 
 
 
227 aa  86.3  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1894  hypothetical protein  31.93 
 
 
242 aa  84.3  0.000000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.470997  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1819  hypothetical protein  27.31 
 
 
222 aa  83.6  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0984  zinc metalloprotease  25.35 
 
 
221 aa  84  0.000000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0977  protein of unknown function DUF45  22.83 
 
 
259 aa  83.2  0.000000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0220  hypothetical protein  38 
 
 
240 aa  81.3  0.000000000000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2550  hypothetical protein  27.78 
 
 
231 aa  80.9  0.000000000000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.52441  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1339  hypothetical protein  35.29 
 
 
243 aa  80.9  0.000000000000009  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0151  hypothetical protein  37 
 
 
240 aa  80.1  0.00000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1632  protein of unknown function DUF45  36.56 
 
 
232 aa  79.3  0.00000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4201  protein of unknown function DUF45  26.96 
 
 
245 aa  79.3  0.00000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2343  hypothetical protein  28.84 
 
 
238 aa  78.6  0.00000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.781257  normal  0.0217963 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1763  protein of unknown function DUF45  39.8 
 
 
246 aa  76.6  0.0000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0949  hypothetical protein  23.47 
 
 
219 aa  76.6  0.0000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0658473  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2107  hypothetical protein  38.3 
 
 
240 aa  76.3  0.0000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0413  hypothetical protein  40.51 
 
 
249 aa  75.9  0.0000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2910  hypothetical protein  37.93 
 
 
237 aa  76.3  0.0000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0504  hypothetical protein  39.78 
 
 
286 aa  75.5  0.0000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.22693  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0397  protein of unknown function DUF45  37.07 
 
 
292 aa  75.5  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.119001  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2542  protein of unknown function DUF45  43.04 
 
 
242 aa  75.5  0.0000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.65103  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0412  protein of unknown function DUF45  42.05 
 
 
292 aa  75.1  0.0000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.505198  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_159  hypothetical protein  34 
 
 
240 aa  74.7  0.0000000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.363835  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0521  hypothetical protein  40.91 
 
 
288 aa  73.9  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0129218 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0649  hypothetical protein  23.53 
 
 
215 aa  73.9  0.000000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2986  conserved hypothetical protein DUF45  28.31 
 
 
230 aa  74.3  0.000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0535  hypothetical protein  25.51 
 
 
206 aa  73.9  0.000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3538  hypothetical protein  45 
 
 
239 aa  72.8  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.739224  normal  0.0386409 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1164  hypothetical protein  48.53 
 
 
141 aa  73.6  0.000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0839  hypothetical protein  29.05 
 
 
237 aa  73.2  0.000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.243328 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0015  hypothetical protein  45.21 
 
 
247 aa  73.2  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000114472  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1049  hypothetical protein  25.56 
 
 
215 aa  72.8  0.000000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0449963  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0647  hypothetical protein  22.34 
 
 
215 aa  72.4  0.000000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.764633  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4010  hypothetical protein  38.71 
 
 
253 aa  72.4  0.000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.836815 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0100  protein of unknown function DUF45  45.21 
 
 
241 aa  72.4  0.000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0683  protein of unknown function DUF45  36.67 
 
 
300 aa  72  0.000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.436167  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4016  hypothetical protein  36.67 
 
 
300 aa  72  0.000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00585617  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3789  hypothetical protein  36.36 
 
 
235 aa  72  0.000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3235  hypothetical protein  39.77 
 
 
251 aa  71.6  0.000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1766  hypothetical protein  33.8 
 
 
241 aa  71.6  0.000000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0794  conserved hypothetical protein (DUF45 domain protein)  26 
 
 
221 aa  71.2  0.000000000007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.308629  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2744  hypothetical protein  36.84 
 
 
252 aa  71.6  0.000000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0594  hypothetical protein  40.48 
 
 
301 aa  71.2  0.000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6032  hypothetical protein  40.48 
 
 
316 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1707  hypothetical protein  37.36 
 
 
239 aa  70.5  0.00000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.182955  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1069  hypothetical protein  22.43 
 
 
225 aa  70.5  0.00000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.887273  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1114  hypothetical protein  25.76 
 
 
254 aa  70.9  0.00000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2732  hypothetical protein  40.48 
 
 
295 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0443  hypothetical protein  41.98 
 
 
292 aa  70.9  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.618297 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2093  hypothetical protein  40.48 
 
 
295 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.786818  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0727  protein of unknown function DUF45  21.13 
 
 
223 aa  70.9  0.00000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0561  protein of unknown function DUF45  34.41 
 
 
211 aa  70.9  0.00000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2705  hypothetical protein  40.48 
 
 
295 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.319747  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0056  protein of unknown function DUF45  36.73 
 
 
238 aa  69.7  0.00000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2427  hypothetical protein  40.48 
 
 
292 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.656656  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0723  hypothetical protein  24.06 
 
 
220 aa  69.7  0.00000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.835761  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1292  hypothetical protein  43.21 
 
 
308 aa  70.1  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.232025 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl659  zinc metalloprotease  31.76 
 
 
238 aa  69.7  0.00000000002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0215  hypothetical protein  40.48 
 
 
292 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.585984  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0018  hypothetical protein  41.25 
 
 
254 aa  69.7  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0877  hypothetical protein  40.48 
 
 
292 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2347  hypothetical protein  40.48 
 
 
292 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2622  hypothetical protein  40.48 
 
 
285 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.276697  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0581  hypothetical protein  40.48 
 
 
295 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3548  hypothetical protein  34.96 
 
 
242 aa  70.1  0.00000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.405363  normal  0.224983 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0698  hypothetical protein  40.48 
 
 
292 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0713  hypothetical protein  40.48 
 
 
292 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2757  hypothetical protein  40.48 
 
 
303 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.328108  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2731  hypothetical protein  40.48 
 
 
292 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.896479  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2889  hypothetical protein  38.37 
 
 
261 aa  69.3  0.00000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.653746  normal  0.363578 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2891  protein of unknown function DUF45  54.55 
 
 
208 aa  69.3  0.00000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00416901  hitchhiker  0.00700023 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0402  hypothetical protein  40.48 
 
 
285 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.450593  normal  0.256851 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0079  zinc metalloprotease  25 
 
 
230 aa  69.3  0.00000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0200194  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2959  hypothetical protein  33.59 
 
 
213 aa  68.9  0.00000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0212989  normal  0.321513 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>