267 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_1164 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_1164  hypothetical protein  100 
 
 
141 aa  298  2e-80  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2542  protein of unknown function DUF45  48.87 
 
 
242 aa  136  1e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.65103  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1894  hypothetical protein  41.54 
 
 
242 aa  128  2.0000000000000002e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.470997  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2343  hypothetical protein  40.74 
 
 
238 aa  110  6e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.781257  normal  0.0217963 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0156  hypothetical protein  43.64 
 
 
270 aa  99.8  1e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0015  hypothetical protein  40.52 
 
 
247 aa  98.2  3e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000114472  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3548  hypothetical protein  37.3 
 
 
242 aa  95.9  1e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.405363  normal  0.224983 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1114  hypothetical protein  36.97 
 
 
254 aa  96.3  1e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06805  hypothetical protein  38.64 
 
 
258 aa  92.8  1e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0984  zinc metalloprotease  39.86 
 
 
221 aa  92  2e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0617  hypothetical protein  37.31 
 
 
222 aa  85.9  2e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.236846  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0083  hypothetical protein  39.37 
 
 
222 aa  83.6  9e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  decreased coverage  0.000843512  decreased coverage  0.0000753316 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0949  hypothetical protein  40.91 
 
 
219 aa  83.2  0.000000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0658473  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1098  hypothetical protein  36.57 
 
 
222 aa  82.4  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1789  hypothetical protein  33.07 
 
 
238 aa  80.1  0.00000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3789  hypothetical protein  31.4 
 
 
235 aa  77  0.00000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4201  protein of unknown function DUF45  33.33 
 
 
245 aa  77  0.00000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2889  hypothetical protein  31.25 
 
 
261 aa  76.3  0.0000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.653746  normal  0.363578 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1819  hypothetical protein  37.38 
 
 
222 aa  75.5  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0947  hypothetical protein  33.58 
 
 
245 aa  75.5  0.0000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  unclonable  0.0000214537 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0843  hypothetical protein  31.54 
 
 
246 aa  75.1  0.0000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.335069  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1763  protein of unknown function DUF45  42.86 
 
 
246 aa  75.1  0.0000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0791  hypothetical protein  31.54 
 
 
246 aa  75.1  0.0000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.371001  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2910  hypothetical protein  38.78 
 
 
237 aa  74.7  0.0000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1774  zinc metalloprotease  35.85 
 
 
238 aa  73.9  0.0000000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2595  hypothetical protein  34.4 
 
 
238 aa  73.6  0.0000000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.23171  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04860  predicted metal-dependent hydrolase  48.53 
 
 
184 aa  73.6  0.0000000000009  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0435  hypothetical protein  31.82 
 
 
235 aa  73.2  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2484  hypothetical protein  40.74 
 
 
245 aa  72.8  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.186682  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0609  hypothetical protein  45.21 
 
 
179 aa  71.6  0.000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1858  protein of unknown function DUF45  30.3 
 
 
226 aa  72  0.000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000912457  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0459  hypothetical protein  31.82 
 
 
235 aa  71.2  0.000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0555  zinc metalloprotease  37.96 
 
 
239 aa  71.2  0.000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0652798  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3538  hypothetical protein  30.08 
 
 
239 aa  70.9  0.000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.739224  normal  0.0386409 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2107  hypothetical protein  37.18 
 
 
240 aa  70.9  0.000000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2668  protein of unknown function DUF45  40.45 
 
 
202 aa  70.5  0.000000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.255358  normal  0.761746 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0056  protein of unknown function DUF45  31.3 
 
 
238 aa  70.5  0.000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4297  hypothetical protein  32.38 
 
 
251 aa  70.1  0.00000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0379  hypothetical protein  40 
 
 
237 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0011  hypothetical protein  29.85 
 
 
236 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0413  hypothetical protein  43.06 
 
 
249 aa  69.7  0.00000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1661  protein of unknown function DUF45  30.08 
 
 
244 aa  69.7  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.843742  normal  0.112904 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0402  hypothetical protein  40.28 
 
 
245 aa  68.9  0.00000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.95027  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4010  hypothetical protein  32.67 
 
 
253 aa  69.3  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.836815 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2393  hypothetical protein  36.05 
 
 
244 aa  68.9  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1824  hypothetical protein  32.79 
 
 
224 aa  68.2  0.00000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4620  protein of unknown function DUF45  35.78 
 
 
242 aa  67.8  0.00000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.212345 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2198  hypothetical protein  32.76 
 
 
247 aa  67.4  0.00000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.403347  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2794  protein of unknown function DUF45  27.34 
 
 
242 aa  66.2  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0182535  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3363  hypothetical protein  41.67 
 
 
249 aa  66.6  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.211491 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1069  hypothetical protein  31.3 
 
 
223 aa  65.9  0.0000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.262175  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0594  hypothetical protein  31.82 
 
 
301 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1707  hypothetical protein  40 
 
 
239 aa  65.9  0.0000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.182955  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0212  hypothetical protein  31.25 
 
 
321 aa  65.9  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0964391 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05618  hypothetical protein  29.51 
 
 
226 aa  65.5  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0977  protein of unknown function DUF45  32 
 
 
259 aa  65.5  0.0000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0151  hypothetical protein  30.56 
 
 
240 aa  65.1  0.0000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0100  hypothetical protein  29.03 
 
 
231 aa  65.1  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.58057  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0220  hypothetical protein  33.03 
 
 
240 aa  64.7  0.0000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0661  zinc protease, putative  32.71 
 
 
243 aa  64.7  0.0000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.792264  normal  0.0577046 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2282  protein of unknown function DUF45  41.1 
 
 
108 aa  63.9  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.879838  hitchhiker  0.00256901 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2219  protein of unknown function DUF45  41.1 
 
 
108 aa  63.9  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2344  hypothetical protein  33.02 
 
 
217 aa  63.9  0.0000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.394808 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2307  protein of unknown function DUF45  40 
 
 
244 aa  63.9  0.0000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04470  predicted metal-dependent hydrolase  28.46 
 
 
241 aa  63.5  0.0000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0794  conserved hypothetical protein (DUF45 domain protein)  33.33 
 
 
221 aa  63.5  0.000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.308629  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1480  hypothetical protein  32.93 
 
 
268 aa  62.8  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1069  hypothetical protein  36.36 
 
 
225 aa  63.2  0.000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.887273  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0581  hypothetical protein  30 
 
 
295 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2732  hypothetical protein  30.91 
 
 
295 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3143  protein of unknown function DUF45  32.23 
 
 
227 aa  62  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0570436  normal  0.976092 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0860  hypothetical protein  32.41 
 
 
238 aa  62.4  0.000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0401  hypothetical protein  33.91 
 
 
233 aa  62.4  0.000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6032  hypothetical protein  30.91 
 
 
316 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0060  protein of unknown function DUF45  32.88 
 
 
259 aa  62.4  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2093  hypothetical protein  30.91 
 
 
295 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.786818  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2705  hypothetical protein  30.91 
 
 
295 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.319747  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1084  protein of unknown function DUF45  30.97 
 
 
221 aa  62  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1772  hypothetical protein  30.58 
 
 
232 aa  62  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.236777  normal  0.415522 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2427  hypothetical protein  30 
 
 
292 aa  62  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.656656  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0309  zinc metalloprotease  29.06 
 
 
235 aa  61.6  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.122687  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0215  hypothetical protein  30 
 
 
292 aa  62  0.000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.585984  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0698  hypothetical protein  30 
 
 
292 aa  62  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0877  hypothetical protein  30 
 
 
292 aa  62  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2959  protein of unknown function DUF45  32.23 
 
 
227 aa  62  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3354  hypothetical protein  28.8 
 
 
265 aa  61.6  0.000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0543  peptidase S26A, signal peptidase I  35 
 
 
236 aa  61.6  0.000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00150578  normal 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3111  metal-dependent hydrolase  41.54 
 
 
120 aa  61.6  0.000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0713  hypothetical protein  30 
 
 
292 aa  62  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07420  predicted metal-dependent hydrolase  42.25 
 
 
198 aa  61.6  0.000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.654381  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2347  hypothetical protein  30 
 
 
292 aa  62  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2757  hypothetical protein  30 
 
 
303 aa  62  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.328108  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2731  hypothetical protein  30 
 
 
292 aa  62  0.000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.896479  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1181  protein of unknown function DUF45  34.04 
 
 
242 aa  62  0.000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0870  protein of unknown function DUF45  31.96 
 
 
224 aa  61.2  0.000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0260023  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0788  protein of unknown function DUF45  38.55 
 
 
241 aa  61.2  0.000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0010  hypothetical protein  37.5 
 
 
270 aa  61.6  0.000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000896967 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1843  protein of unknown function DUF45  27.69 
 
 
254 aa  61.6  0.000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.224767 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2622  hypothetical protein  29.09 
 
 
285 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.276697  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1951  hypothetical protein  37.84 
 
 
481 aa  60.8  0.000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>