263 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_4010 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_4010  hypothetical protein  100 
 
 		 253 aa  498  1e-140  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.836815 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1474  hypothetical protein  80.29 
 
 		 137 aa  229  4e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.360877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0100  hypothetical protein  40 
 
 		 231 aa  181  1e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.58057  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0505  hypothetical protein  40.49 
 
 		 233 aa  172  3.9999999999999995e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.722938 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05618  hypothetical protein  32 
 
 		 226 aa  147  2.0000000000000003e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4036  hypothetical protein  35.44 
 
 		 234 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2959  protein of unknown function DUF45  28.63 
 
 		 227 aa  139  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3143  protein of unknown function DUF45  28.23 
 
 		 227 aa  137  1e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0570436  normal  0.976092 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0568  hypothetical protein  31.22 
 
 		 235 aa  136  4e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000566322 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1824  hypothetical protein  27.76 
 
 		 224 aa  133  3e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0843  hypothetical protein  36.95 
 
 		 246 aa  130  2.0000000000000002e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.335069  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0791  hypothetical protein  36.95 
 
 		 246 aa  130  2.0000000000000002e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.371001  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1069  hypothetical protein  28.94 
 
 		 223 aa  130  3e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.262175  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0503  hypothetical protein  26.53 
 
 		 224 aa  129  4.0000000000000003e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04470  predicted metal-dependent hydrolase  30.42 
 
 		 241 aa  128  8.000000000000001e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0870  protein of unknown function DUF45  26.91 
 
 		 224 aa  124  1e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0260023  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2889  hypothetical protein  32.81 
 
 		 261 aa  124  1e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.653746  normal  0.363578 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2255  zinc metalloprotease  32.66 
 
 		 227 aa  122  4e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2794  protein of unknown function DUF45  34.24 
 
 		 242 aa  121  9e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0182535  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2307  protein of unknown function DUF45  30.36 
 
 		 244 aa  121  9.999999999999999e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0071  protein of unknown function DUF45  25.86 
 
 		 223 aa  119  3.9999999999999996e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0379  hypothetical protein  30.84 
 
 		 237 aa  118  9e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2595  hypothetical protein  26.29 
 
 		 238 aa  117  9.999999999999999e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.23171  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1102  zinc metalloprotease  28.57 
 
 		 243 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00846989  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2910  hypothetical protein  30.42 
 
 		 237 aa  116  3e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1789  hypothetical protein  27.8 
 
 		 238 aa  116  3.9999999999999997e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2393  hypothetical protein  27.8 
 
 		 244 aa  115  6.9999999999999995e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2107  hypothetical protein  32.26 
 
 		 240 aa  105  9e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0542  hypothetical protein  26.86 
 
 		 243 aa  104  2e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3789  hypothetical protein  30.33 
 
 		 235 aa  103  3e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2343  hypothetical protein  30.52 
 
 		 238 aa  103  4e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.781257  normal  0.0217963 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0100  protein of unknown function DUF45  33.05 
 
 		 241 aa  102  8e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1843  protein of unknown function DUF45  25.94 
 
 		 254 aa  97.4  2e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.224767 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0056  protein of unknown function DUF45  31.25 
 
 		 238 aa  97.8  2e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2484  hypothetical protein  25.31 
 
 		 245 aa  96.7  3e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.186682  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0504  hypothetical protein  31.03 
 
 		 286 aa  94.4  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.22693  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_159  hypothetical protein  33.54 
 
 		 240 aa  94  2e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.363835  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0899  hypothetical protein  27.15 
 
 		 254 aa  94  2e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000145532 
 
 
-
 
NC_002936  DET0151  hypothetical protein  32.3 
 
 		 240 aa  90.9  2e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0011  hypothetical protein  29.46 
 
 		 236 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2622  hypothetical protein  26.52 
 
 		 285 aa  90.5  3e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.276697  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1894  hypothetical protein  28.88 
 
 		 242 aa  89.4  5e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.470997  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0617  hypothetical protein  24.46 
 
 		 222 aa  89.4  5e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.236846  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0443  hypothetical protein  28.81 
 
 		 292 aa  89  6e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.618297 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2093  hypothetical protein  25.83 
 
 		 295 aa  89  6e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.786818  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2705  hypothetical protein  25.83 
 
 		 295 aa  89  6e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.319747  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4016  hypothetical protein  25.7 
 
 		 300 aa  89  7e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00585617  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0015  hypothetical protein  29.96 
 
 		 247 aa  89  7e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000114472  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2757  hypothetical protein  26.09 
 
 		 303 aa  88.6  8e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.328108  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2732  hypothetical protein  25.65 
 
 		 295 aa  88.2  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3538  hypothetical protein  31.35 
 
 		 239 aa  88.2  1e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.739224  normal  0.0386409 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6032  hypothetical protein  25.65 
 
 		 316 aa  88.2  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0547  hypothetical protein  28.02 
 
 		 218 aa  88.6  1e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.825313  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0683  protein of unknown function DUF45  25.43 
 
 		 300 aa  87.8  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.436167  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0412  protein of unknown function DUF45  26.52 
 
 		 292 aa  87  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.505198  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0397  protein of unknown function DUF45  26.52 
 
 		 292 aa  87.4  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.119001  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0581  hypothetical protein  25.51 
 
 		 295 aa  87.4  2e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3548  hypothetical protein  28.74 
 
 		 242 aa  87  2e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.405363  normal  0.224983 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0594  hypothetical protein  26.09 
 
 		 301 aa  87.4  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2744  hypothetical protein  23.14 
 
 		 252 aa  85.9  6e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0413  hypothetical protein  24.24 
 
 		 249 aa  85.9  6e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4297  hypothetical protein  22.89 
 
 		 251 aa  85.5  7e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0215  hypothetical protein  25 
 
 		 292 aa  85.5  7e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.585984  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0877  hypothetical protein  25 
 
 		 292 aa  85.5  7e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2427  hypothetical protein  25 
 
 		 292 aa  85.5  7e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.656656  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0800  hypothetical protein  22.04 
 
 		 237 aa  85.5  7e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0356506  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0698  hypothetical protein  25 
 
 		 292 aa  85.5  7e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0402  hypothetical protein  26.32 
 
 		 285 aa  85.5  7e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.450593  normal  0.256851 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2731  hypothetical protein  25 
 
 		 292 aa  85.5  7e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.896479  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0713  hypothetical protein  25 
 
 		 292 aa  85.5  7e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2347  hypothetical protein  25 
 
 		 292 aa  85.5  7e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0212  hypothetical protein  27.83 
 
 		 321 aa  84.3  0.000000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0964391 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1292  hypothetical protein  28.26 
 
 		 308 aa  85.1  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.232025 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0521  hypothetical protein  31.37 
 
 		 288 aa  84.3  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0129218 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1181  protein of unknown function DUF45  31.2 
 
 		 242 aa  84.3  0.000000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0220  hypothetical protein  31.25 
 
 		 240 aa  83.2  0.000000000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1707  hypothetical protein  33.88 
 
 		 239 aa  82  0.000000000000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.182955  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0373  protein of unknown function DUF45  22.58 
 
 		 242 aa  81.3  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2542  protein of unknown function DUF45  23.38 
 
 		 242 aa  80.9  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.65103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2344  hypothetical protein  30.64 
 
 		 217 aa  80.1  0.00000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.394808 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06805  hypothetical protein  25.31 
 
 		 258 aa  80.1  0.00000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2267  hypothetical protein  27.78 
 
 		 217 aa  79  0.00000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.083076  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1858  protein of unknown function DUF45  22.41 
 
 		 226 aa  78.6  0.00000000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000912457  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0309  zinc metalloprotease  21.83 
 
 		 235 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.122687  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0641  hypothetical protein  24.58 
 
 		 236 aa  77.8  0.0000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0156  hypothetical protein  25.2 
 
 		 270 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1312  hypothetical protein  24.51 
 
 		 234 aa  78.2  0.0000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1632  protein of unknown function DUF45  22.7 
 
 		 232 aa  77.8  0.0000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0317  hypothetical protein  22.17 
 
 		 235 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1763  protein of unknown function DUF45  39.18 
 
 		 246 aa  77.4  0.0000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1480  hypothetical protein  26.96 
 
 		 268 aa  77.8  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0384  zinc metalloprotease  22.17 
 
 		 235 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0625718  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0947  hypothetical protein  24.19 
 
 		 245 aa  77.8  0.0000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000214537 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0036  protein of unknown function DUF45  22.61 
 
 		 262 aa  77.4  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0431  hypothetical protein  21.83 
 
 		 235 aa  76.6  0.0000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00811962  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1114  hypothetical protein  24.71 
 
 		 254 aa  77  0.0000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0984  zinc metalloprotease  22.84 
 
 		 221 aa  76.6  0.0000000000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0306  zinc metalloprotease  22.61 
 
 		 235 aa  76.3  0.0000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1098  hypothetical protein  22.41 
 
 		 222 aa  75.9  0.0000000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3692  hypothetical protein  26.72 
 
 		 314 aa  75.5  0.0000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.349516  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>