253 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_2141 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_2141  hypothetical protein  100 
 
 
233 aa  482  1e-135  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0199813 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2082  hypothetical protein  59.91 
 
 
222 aa  268  5e-71  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1800  hypothetical protein  57.52 
 
 
222 aa  263  2e-69  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.404735  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0459  hypothetical protein  32.27 
 
 
235 aa  122  7e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0435  hypothetical protein  33.94 
 
 
235 aa  120  1.9999999999999998e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0543  peptidase S26A, signal peptidase I  33.49 
 
 
236 aa  117  9.999999999999999e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00150578  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2198  hypothetical protein  31.47 
 
 
247 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.403347  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0977  protein of unknown function DUF45  31.17 
 
 
259 aa  109  4.0000000000000004e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0555  zinc metalloprotease  31.19 
 
 
239 aa  107  1e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0652798  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0760  hypothetical protein  31.31 
 
 
244 aa  107  2e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0906  protein of unknown function DUF45  31.31 
 
 
244 aa  107  2e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.876537  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1858  protein of unknown function DUF45  29.22 
 
 
226 aa  101  8e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000912457  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0401  hypothetical protein  30.56 
 
 
233 aa  98.2  9e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0365  hypothetical protein  29.82 
 
 
232 aa  98.2  1e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0669057  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2668  protein of unknown function DUF45  28.04 
 
 
202 aa  96.3  3e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.255358  normal  0.761746 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04860  predicted metal-dependent hydrolase  33.17 
 
 
184 aa  95.1  9e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0860  hypothetical protein  28.44 
 
 
238 aa  94.4  2e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0947  hypothetical protein  28.02 
 
 
245 aa  93.2  3e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  unclonable  0.0000214537 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0402  hypothetical protein  30.48 
 
 
245 aa  92  8e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.95027  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2675  hypothetical protein  29.65 
 
 
243 aa  89.7  4e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.49786 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4620  protein of unknown function DUF45  25.21 
 
 
242 aa  87.4  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.212345 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1632  protein of unknown function DUF45  38.38 
 
 
232 aa  87  2e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1774  zinc metalloprotease  26.34 
 
 
238 aa  85.1  8e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2910  hypothetical protein  36.63 
 
 
237 aa  84.7  0.000000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0079  zinc metalloprotease  26.18 
 
 
230 aa  84.7  0.000000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0200194  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0647  hypothetical protein  31.25 
 
 
215 aa  83.6  0.000000000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.764633  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0949  hypothetical protein  25.94 
 
 
219 aa  82.8  0.000000000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0658473  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0071  protein of unknown function DUF45  37.14 
 
 
223 aa  81.6  0.000000000000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1416  putative metal-dependent hydrolase  25.78 
 
 
268 aa  80.9  0.00000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07420  predicted metal-dependent hydrolase  31.67 
 
 
198 aa  80.9  0.00000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.654381  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0617  hypothetical protein  26.92 
 
 
222 aa  80.9  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.236846  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1789  hypothetical protein  35.79 
 
 
238 aa  78.6  0.00000000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1819  hypothetical protein  27.06 
 
 
222 aa  77.8  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3789  hypothetical protein  26.18 
 
 
235 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2393  hypothetical protein  26.15 
 
 
244 aa  78.2  0.0000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0379  hypothetical protein  25.82 
 
 
237 aa  76.6  0.0000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0542  hypothetical protein  24.54 
 
 
243 aa  77  0.0000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0984  zinc metalloprotease  24.76 
 
 
221 aa  75.9  0.0000000000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0727  protein of unknown function DUF45  24.66 
 
 
223 aa  75.5  0.0000000000006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0594  hypothetical protein  26.94 
 
 
301 aa  75.5  0.0000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0083  hypothetical protein  26.54 
 
 
222 aa  75.5  0.0000000000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  decreased coverage  0.000843512  decreased coverage  0.0000753316 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0535  hypothetical protein  24.24 
 
 
206 aa  75.1  0.0000000000009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0794  conserved hypothetical protein (DUF45 domain protein)  28.14 
 
 
221 aa  74.3  0.000000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.308629  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0503  hypothetical protein  32.77 
 
 
224 aa  74.3  0.000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1098  hypothetical protein  25.71 
 
 
222 aa  74.7  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0723  hypothetical protein  23.68 
 
 
220 aa  73.9  0.000000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.835761  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0212  hypothetical protein  25.32 
 
 
321 aa  74.3  0.000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0964391 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0581  hypothetical protein  26.13 
 
 
295 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0561  protein of unknown function DUF45  31.36 
 
 
211 aa  73.6  0.000000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2307  protein of unknown function DUF45  35.48 
 
 
244 aa  72.4  0.000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0215  hypothetical protein  26.13 
 
 
292 aa  72.4  0.000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.585984  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3538  hypothetical protein  24.37 
 
 
239 aa  72.4  0.000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.739224  normal  0.0386409 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2427  hypothetical protein  26.13 
 
 
292 aa  72.4  0.000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.656656  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0713  hypothetical protein  26.13 
 
 
292 aa  72.4  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2731  hypothetical protein  26.13 
 
 
292 aa  72.4  0.000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.896479  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2347  hypothetical protein  26.13 
 
 
292 aa  72.4  0.000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0698  hypothetical protein  26.13 
 
 
292 aa  72.4  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2274  protein of unknown function DUF45  35.11 
 
 
243 aa  72.4  0.000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1069  hypothetical protein  31.93 
 
 
223 aa  72  0.000000000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.262175  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0877  hypothetical protein  25.68 
 
 
292 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0870  protein of unknown function DUF45  32.5 
 
 
224 aa  71.2  0.00000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0260023  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2757  hypothetical protein  24.76 
 
 
303 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.328108  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1824  hypothetical protein  32.5 
 
 
224 aa  71.2  0.00000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2732  hypothetical protein  25.24 
 
 
295 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0568  hypothetical protein  40.24 
 
 
235 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000566322 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2093  hypothetical protein  25.24 
 
 
295 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.786818  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2705  hypothetical protein  25.24 
 
 
295 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.319747  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0649  hypothetical protein  33.7 
 
 
215 aa  70.1  0.00000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2622  hypothetical protein  24.76 
 
 
285 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.276697  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2552  hypothetical protein  23.94 
 
 
217 aa  69.7  0.00000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000141461  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0244  hypothetical protein  34.44 
 
 
253 aa  69.7  0.00000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4297  hypothetical protein  32.65 
 
 
251 aa  69.7  0.00000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6032  hypothetical protein  24.76 
 
 
316 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1312  hypothetical protein  32.73 
 
 
234 aa  69.3  0.00000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2166  hypothetical protein  26.32 
 
 
310 aa  69.3  0.00000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.221845  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2550  hypothetical protein  32.61 
 
 
231 aa  68.9  0.00000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.52441  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0412  protein of unknown function DUF45  22.86 
 
 
292 aa  68.9  0.00000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.505198  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0646  hypothetical protein  22.16 
 
 
220 aa  68.9  0.00000000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0397  protein of unknown function DUF45  22.86 
 
 
292 aa  68.9  0.00000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.119001  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0899  hypothetical protein  35 
 
 
254 aa  67.8  0.0000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  hitchhiker  0.000145532 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1102  zinc metalloprotease  37.97 
 
 
243 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00846989  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0156  hypothetical protein  23.96 
 
 
270 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0402  hypothetical protein  22.12 
 
 
285 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.450593  normal  0.256851 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2484  hypothetical protein  32 
 
 
245 aa  67.4  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.186682  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1661  protein of unknown function DUF45  28.04 
 
 
244 aa  67  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.843742  normal  0.112904 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4010  hypothetical protein  34.29 
 
 
253 aa  67.4  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.836815 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2889  hypothetical protein  34.34 
 
 
261 aa  67  0.0000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.653746  normal  0.363578 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0100  hypothetical protein  31.53 
 
 
231 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.58057  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04470  predicted metal-dependent hydrolase  23.91 
 
 
241 aa  66.6  0.0000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0661  zinc protease, putative  36.73 
 
 
243 aa  66.6  0.0000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.792264  normal  0.0577046 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0431  protein of unknown function DUF45  40.74 
 
 
239 aa  66.6  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0373  protein of unknown function DUF45  24.31 
 
 
242 aa  66.2  0.0000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1114  hypothetical protein  35.71 
 
 
254 aa  66.2  0.0000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0100  protein of unknown function DUF45  36.17 
 
 
241 aa  66.6  0.0000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0504  hypothetical protein  24.89 
 
 
286 aa  65.9  0.0000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.22693  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06805  hypothetical protein  28.14 
 
 
258 aa  65.9  0.0000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1894  hypothetical protein  37.11 
 
 
242 aa  65.9  0.0000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.470997  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0547  hypothetical protein  34.69 
 
 
218 aa  65.5  0.0000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.825313  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0521  hypothetical protein  22.8 
 
 
288 aa  65.1  0.0000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0129218 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1049  hypothetical protein  33.7 
 
 
215 aa  65.1  0.0000000009  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0449963  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>