257 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0555 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0555  zinc metalloprotease  100 
 
 
239 aa  486  1e-136  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0652798  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2675  hypothetical protein  41.67 
 
 
243 aa  190  2e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.49786 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2198  hypothetical protein  40.85 
 
 
247 aa  186  4e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.403347  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0760  hypothetical protein  41.78 
 
 
244 aa  179  2.9999999999999997e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0906  protein of unknown function DUF45  41.78 
 
 
244 aa  179  2.9999999999999997e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.876537  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0860  hypothetical protein  40.35 
 
 
238 aa  177  1e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0435  hypothetical protein  41.28 
 
 
235 aa  174  9.999999999999999e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0459  hypothetical protein  40.83 
 
 
235 aa  172  5e-42  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0543  peptidase S26A, signal peptidase I  39.73 
 
 
236 aa  171  7.999999999999999e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00150578  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1774  zinc metalloprotease  38.6 
 
 
238 aa  165  5e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0365  hypothetical protein  35.4 
 
 
232 aa  164  8e-40  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0669057  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4620  protein of unknown function DUF45  36.17 
 
 
242 aa  162  3e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.212345 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0947  hypothetical protein  36.09 
 
 
245 aa  162  6e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  unclonable  0.0000214537 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0244  hypothetical protein  36.84 
 
 
253 aa  160  1e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0431  protein of unknown function DUF45  39.04 
 
 
239 aa  156  2e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0401  hypothetical protein  34.82 
 
 
233 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0977  protein of unknown function DUF45  35.35 
 
 
259 aa  137  2e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1858  protein of unknown function DUF45  31.82 
 
 
226 aa  124  2e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000912457  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04860  predicted metal-dependent hydrolase  30.63 
 
 
184 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07420  predicted metal-dependent hydrolase  30.4 
 
 
198 aa  114  2.0000000000000002e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.654381  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0617  hypothetical protein  27.73 
 
 
222 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.236846  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2141  hypothetical protein  31.19 
 
 
233 aa  107  1e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0199813 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1098  hypothetical protein  25.94 
 
 
222 aa  107  1e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0984  zinc metalloprotease  28.23 
 
 
221 aa  107  2e-22  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1800  hypothetical protein  32.55 
 
 
222 aa  104  1e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.404735  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0949  hypothetical protein  27.75 
 
 
219 aa  102  5e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0658473  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0083  hypothetical protein  26.42 
 
 
222 aa  101  1e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  decreased coverage  0.000843512  decreased coverage  0.0000753316 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2082  hypothetical protein  30.28 
 
 
222 aa  101  1e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2550  hypothetical protein  26.36 
 
 
231 aa  100  2e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.52441  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1416  putative metal-dependent hydrolase  27.04 
 
 
268 aa  99  6e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1819  hypothetical protein  25.94 
 
 
222 aa  99  6e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2668  protein of unknown function DUF45  44.44 
 
 
202 aa  98.6  7e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.255358  normal  0.761746 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0535  hypothetical protein  26.22 
 
 
206 aa  95.9  6e-19  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1632  protein of unknown function DUF45  25.6 
 
 
232 aa  94.7  1e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2910  hypothetical protein  29.95 
 
 
237 aa  89.7  4e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0794  conserved hypothetical protein (DUF45 domain protein)  26.34 
 
 
221 aa  89  7e-17  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.308629  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1114  hypothetical protein  29.57 
 
 
254 aa  88.2  1e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2274  protein of unknown function DUF45  30.88 
 
 
243 aa  87  2e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1591  protein of unknown function DUF45  36.09 
 
 
153 aa  87  3e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.961397  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0647  hypothetical protein  24.44 
 
 
215 aa  84.3  0.000000000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.764633  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0156  hypothetical protein  26.85 
 
 
270 aa  82.8  0.000000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0151  hypothetical protein  26.53 
 
 
240 aa  82.4  0.000000000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1894  hypothetical protein  29.91 
 
 
242 aa  81.3  0.00000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.470997  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0843  hypothetical protein  28.29 
 
 
246 aa  81.3  0.00000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.335069  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0791  hypothetical protein  28.29 
 
 
246 aa  81.3  0.00000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.371001  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0581  hypothetical protein  28.44 
 
 
295 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0641  hypothetical protein  30.69 
 
 
236 aa  80.1  0.00000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06805  hypothetical protein  25.85 
 
 
258 aa  80.1  0.00000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2542  protein of unknown function DUF45  27.41 
 
 
242 aa  79.3  0.00000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.65103  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2343  hypothetical protein  24.69 
 
 
238 aa  79.3  0.00000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.781257  normal  0.0217963 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_159  hypothetical protein  26.67 
 
 
240 aa  78.6  0.00000000000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.363835  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0723  hypothetical protein  27.32 
 
 
220 aa  77  0.0000000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.835761  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0079  zinc metalloprotease  25 
 
 
230 aa  77.8  0.0000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0200194  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0220  hypothetical protein  26.9 
 
 
240 aa  77  0.0000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3143  protein of unknown function DUF45  29.63 
 
 
227 aa  77.4  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0570436  normal  0.976092 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2393  hypothetical protein  25.52 
 
 
244 aa  77.4  0.0000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4201  protein of unknown function DUF45  25 
 
 
245 aa  77.8  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0649  hypothetical protein  27.32 
 
 
215 aa  77.4  0.0000000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0215  hypothetical protein  27.96 
 
 
292 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.585984  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0877  hypothetical protein  27.96 
 
 
292 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0713  hypothetical protein  27.96 
 
 
292 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2427  hypothetical protein  27.96 
 
 
292 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.656656  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0698  hypothetical protein  27.96 
 
 
292 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2731  hypothetical protein  27.96 
 
 
292 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.896479  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2347  hypothetical protein  27.96 
 
 
292 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2307  protein of unknown function DUF45  25.62 
 
 
244 aa  75.9  0.0000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2595  hypothetical protein  22.22 
 
 
238 aa  75.9  0.0000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.23171  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2959  protein of unknown function DUF45  29.1 
 
 
227 aa  75.9  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0521  hypothetical protein  26.32 
 
 
288 aa  75.5  0.0000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0129218 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3538  hypothetical protein  29.32 
 
 
239 aa  75.5  0.0000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.739224  normal  0.0386409 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1789  hypothetical protein  26.94 
 
 
238 aa  75.1  0.0000000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0412  protein of unknown function DUF45  26.64 
 
 
292 aa  75.1  0.0000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.505198  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0504  hypothetical protein  25.85 
 
 
286 aa  74.7  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.22693  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0397  protein of unknown function DUF45  26.64 
 
 
292 aa  74.7  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.119001  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2889  hypothetical protein  26.54 
 
 
261 aa  74.3  0.000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.653746  normal  0.363578 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1049  hypothetical protein  25.85 
 
 
215 aa  74.3  0.000000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0449963  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04470  predicted metal-dependent hydrolase  27.06 
 
 
241 aa  73.9  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0402  hypothetical protein  29.33 
 
 
285 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.450593  normal  0.256851 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1763  protein of unknown function DUF45  26.84 
 
 
246 aa  73.2  0.000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2484  hypothetical protein  24.27 
 
 
245 aa  73.2  0.000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.186682  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2928  hypothetical protein  25.85 
 
 
219 aa  72.8  0.000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4016  hypothetical protein  31.58 
 
 
300 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00585617  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3354  hypothetical protein  25.82 
 
 
265 aa  72  0.000000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3789  hypothetical protein  29.89 
 
 
235 aa  72  0.000000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1164  hypothetical protein  37.96 
 
 
141 aa  71.2  0.00000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0056  protein of unknown function DUF45  26.9 
 
 
238 aa  71.2  0.00000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1707  hypothetical protein  27.07 
 
 
239 aa  71.2  0.00000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.182955  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0547  hypothetical protein  26.29 
 
 
218 aa  71.2  0.00000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.825313  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0443  hypothetical protein  26.92 
 
 
292 aa  71.2  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.618297 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0683  protein of unknown function DUF45  29.95 
 
 
300 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.436167  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1069  hypothetical protein  25.42 
 
 
225 aa  70.9  0.00000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.887273  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2107  hypothetical protein  23.48 
 
 
240 aa  70.9  0.00000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1843  protein of unknown function DUF45  24.17 
 
 
254 aa  70.9  0.00000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.224767 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2732  hypothetical protein  26.7 
 
 
295 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2093  hypothetical protein  26.7 
 
 
295 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.786818  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0100  protein of unknown function DUF45  27.19 
 
 
241 aa  70.1  0.00000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2255  zinc metalloprotease  28.57 
 
 
227 aa  69.7  0.00000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2705  hypothetical protein  26.7 
 
 
295 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.319747  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0594  hypothetical protein  26.21 
 
 
301 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0402  hypothetical protein  28.71 
 
 
245 aa  69.7  0.00000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.95027  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>