272 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1069 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_1069  hypothetical protein  100 
 
 
225 aa  453  1.0000000000000001e-126  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.887273  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2307  protein of unknown function DUF45  33.33 
 
 
244 aa  99.8  3e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1763  protein of unknown function DUF45  29.21 
 
 
246 aa  99.8  3e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0083  hypothetical protein  31.7 
 
 
222 aa  96.3  3e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  decreased coverage  0.000843512  decreased coverage  0.0000753316 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0100  protein of unknown function DUF45  41.58 
 
 
241 aa  95.9  4e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2109  protein of unknown function DUF45  31.34 
 
 
249 aa  95.1  8e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0220  hypothetical protein  27.78 
 
 
240 aa  94.7  1e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1098  hypothetical protein  32.11 
 
 
222 aa  92.8  4e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0151  hypothetical protein  25.76 
 
 
240 aa  92  6e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_159  hypothetical protein  26.26 
 
 
240 aa  91.7  9e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.363835  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0547  hypothetical protein  26.87 
 
 
218 aa  90.9  1e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.825313  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0949  hypothetical protein  31.58 
 
 
219 aa  87.8  1e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0658473  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1819  hypothetical protein  32.41 
 
 
222 aa  87.4  2e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0413  hypothetical protein  44.83 
 
 
249 aa  86.7  3e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2107  hypothetical protein  32.03 
 
 
240 aa  86.7  3e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0011  hypothetical protein  23.88 
 
 
236 aa  86.3  4e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1561  zinc protease, putative  29.47 
 
 
244 aa  86.3  4e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0984  zinc metalloprotease  30.62 
 
 
221 aa  85.1  8e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0661  zinc protease, putative  41.9 
 
 
243 aa  84.3  0.000000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.792264  normal  0.0577046 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1661  protein of unknown function DUF45  23.74 
 
 
244 aa  84.7  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.843742  normal  0.112904 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0079  zinc metalloprotease  28.57 
 
 
230 aa  83.6  0.000000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0200194  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0373  protein of unknown function DUF45  32.11 
 
 
242 aa  83.6  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1292  hypothetical protein  33.02 
 
 
308 aa  82.8  0.000000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.232025 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1312  hypothetical protein  26.42 
 
 
234 aa  82.4  0.000000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2344  hypothetical protein  25 
 
 
217 aa  82.4  0.000000000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.394808 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0727  protein of unknown function DUF45  29.3 
 
 
223 aa  82.4  0.000000000000006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2889  hypothetical protein  28.48 
 
 
261 aa  81.6  0.000000000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.653746  normal  0.363578 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1707  hypothetical protein  26.43 
 
 
239 aa  81.6  0.000000000000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.182955  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4297  hypothetical protein  28.31 
 
 
251 aa  81.3  0.00000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0459  hypothetical protein  25.43 
 
 
235 aa  80.9  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0542  hypothetical protein  25 
 
 
243 aa  80.9  0.00000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2744  hypothetical protein  27.88 
 
 
252 aa  81.3  0.00000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0071  protein of unknown function DUF45  28.5 
 
 
223 aa  80.5  0.00000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0431  protein of unknown function DUF45  27.66 
 
 
239 aa  80.1  0.00000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1632  protein of unknown function DUF45  29.49 
 
 
232 aa  79.3  0.00000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0543  peptidase S26A, signal peptidase I  25.13 
 
 
236 aa  79.7  0.00000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00150578  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4173  hypothetical protein  26.89 
 
 
303 aa  79.3  0.00000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.282875 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0508  hypothetical protein  26.29 
 
 
233 aa  79.3  0.00000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.139012 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04470  predicted metal-dependent hydrolase  26.79 
 
 
241 aa  79  0.00000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2928  hypothetical protein  29.21 
 
 
219 aa  79  0.00000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2986  conserved hypothetical protein DUF45  26.55 
 
 
230 aa  78.6  0.00000000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0561  protein of unknown function DUF45  27.18 
 
 
211 aa  78.2  0.00000000000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1774  zinc metalloprotease  25.82 
 
 
238 aa  78.6  0.00000000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3354  hypothetical protein  23.08 
 
 
265 aa  78.2  0.00000000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0435  hypothetical protein  24.57 
 
 
235 aa  77.8  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0448  hypothetical protein  33.01 
 
 
319 aa  77.8  0.0000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0531  hypothetical protein  24.34 
 
 
306 aa  77.4  0.0000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.10161 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0977  protein of unknown function DUF45  27.06 
 
 
259 aa  77  0.0000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0401  hypothetical protein  26.58 
 
 
233 aa  77  0.0000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1339  hypothetical protein  27.65 
 
 
243 aa  77  0.0000000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1858  protein of unknown function DUF45  26.29 
 
 
226 aa  76.6  0.0000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000912457  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0547  protein of unknown function DUF45  24.34 
 
 
306 aa  76.6  0.0000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0617  hypothetical protein  29.21 
 
 
222 aa  76.3  0.0000000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.236846  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1181  protein of unknown function DUF45  23.41 
 
 
242 aa  75.9  0.0000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2642  hypothetical protein  25.87 
 
 
228 aa  75.9  0.0000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0947  hypothetical protein  25.11 
 
 
245 aa  75.5  0.0000000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  unclonable  0.0000214537 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0788  protein of unknown function DUF45  25.49 
 
 
241 aa  75.5  0.0000000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1772  hypothetical protein  24.87 
 
 
232 aa  75.1  0.0000000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.236777  normal  0.415522 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0568  hypothetical protein  24.77 
 
 
235 aa  75.1  0.0000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000566322 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0899  hypothetical protein  25.47 
 
 
254 aa  75.1  0.0000000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  hitchhiker  0.000145532 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2675  hypothetical protein  24.78 
 
 
243 aa  74.3  0.000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.49786 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0982  zinc metallopeptidase-like protein  25.37 
 
 
228 aa  74.7  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3692  hypothetical protein  32.43 
 
 
314 aa  74.7  0.000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.349516  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2959  protein of unknown function DUF45  25.23 
 
 
227 aa  74.7  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3143  protein of unknown function DUF45  25.23 
 
 
227 aa  73.6  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0570436  normal  0.976092 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3538  hypothetical protein  32.69 
 
 
239 aa  73.9  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.739224  normal  0.0386409 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0839  hypothetical protein  24.29 
 
 
237 aa  73.9  0.000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.243328 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0406  hypothetical protein  25.98 
 
 
257 aa  73.9  0.000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.317112  normal  0.0115722 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0056  protein of unknown function DUF45  25.42 
 
 
238 aa  72.8  0.000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0535  hypothetical protein  29.1 
 
 
206 aa  72.8  0.000000000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1084  protein of unknown function DUF45  21.51 
 
 
221 aa  72.8  0.000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2818  hypothetical protein  25.17 
 
 
240 aa  72.8  0.000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.608131  normal  0.17098 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4199  hypothetical protein  37.78 
 
 
340 aa  72.4  0.000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1114  hypothetical protein  41.67 
 
 
254 aa  72.4  0.000000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1824  hypothetical protein  26.64 
 
 
224 aa  72.4  0.000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl659  zinc metalloprotease  29.31 
 
 
238 aa  72  0.000000000007  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0804  zinc metalloprotease, putative  40 
 
 
229 aa  72  0.000000000007  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2732  hypothetical protein  23.12 
 
 
240 aa  71.6  0.000000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0094  hypothetical protein  25.56 
 
 
228 aa  71.6  0.000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2166  hypothetical protein  24.55 
 
 
310 aa  71.6  0.000000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.221845  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2542  protein of unknown function DUF45  26.85 
 
 
242 aa  71.6  0.000000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.65103  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3363  hypothetical protein  25 
 
 
249 aa  71.6  0.000000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.211491 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4201  protein of unknown function DUF45  26.48 
 
 
245 aa  71.2  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2910  hypothetical protein  30 
 
 
237 aa  71.2  0.00000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07420  predicted metal-dependent hydrolase  29.2 
 
 
198 aa  71.2  0.00000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.654381  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0036  protein of unknown function DUF45  26.8 
 
 
262 aa  70.9  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0402  hypothetical protein  31.5 
 
 
245 aa  70.5  0.00000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.95027  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0212  hypothetical protein  31.13 
 
 
321 aa  70.9  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0964391 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0060  protein of unknown function DUF45  24.19 
 
 
259 aa  70.5  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2274  protein of unknown function DUF45  27.53 
 
 
243 aa  70.5  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0555  zinc metalloprotease  25.42 
 
 
239 aa  70.9  0.00000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0652798  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0581  hypothetical protein  30 
 
 
295 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0641  hypothetical protein  24.88 
 
 
236 aa  70.1  0.00000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0794  conserved hypothetical protein (DUF45 domain protein)  27.75 
 
 
221 aa  70.9  0.00000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.308629  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4740  protein of unknown function DUF45  31.25 
 
 
318 aa  70.5  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.677282  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04860  predicted metal-dependent hydrolase  22.43 
 
 
184 aa  70.5  0.00000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2198  hypothetical protein  27.04 
 
 
247 aa  70.1  0.00000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.403347  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2794  protein of unknown function DUF45  20.43 
 
 
242 aa  69.7  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0182535  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1535  hypothetical protein  28.57 
 
 
238 aa  70.1  0.00000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.714061 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2393  hypothetical protein  28.85 
 
 
244 aa  69.7  0.00000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>