266 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_0431 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012918  GM21_0431  protein of unknown function DUF45  100 
 
 
239 aa  491  9.999999999999999e-139  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0244  hypothetical protein  71.19 
 
 
253 aa  353  2e-96  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1774  zinc metalloprotease  52.54 
 
 
238 aa  254  1.0000000000000001e-66  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0947  hypothetical protein  43.59 
 
 
245 aa  209  4e-53  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  unclonable  0.0000214537 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4620  protein of unknown function DUF45  41.28 
 
 
242 aa  204  1e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.212345 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2198  hypothetical protein  42.8 
 
 
247 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.403347  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2675  hypothetical protein  42.31 
 
 
243 aa  194  1e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.49786 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0860  hypothetical protein  42.31 
 
 
238 aa  194  1e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0365  hypothetical protein  38.22 
 
 
232 aa  183  2.0000000000000003e-45  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0669057  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0401  hypothetical protein  37.72 
 
 
233 aa  168  6e-41  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0760  hypothetical protein  39.58 
 
 
244 aa  167  1e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0906  protein of unknown function DUF45  39.58 
 
 
244 aa  167  1e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.876537  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0555  zinc metalloprotease  39.04 
 
 
239 aa  156  2e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0652798  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1591  protein of unknown function DUF45  47.92 
 
 
153 aa  150  2e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.961397  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0543  peptidase S26A, signal peptidase I  35.96 
 
 
236 aa  140  1.9999999999999998e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00150578  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0459  hypothetical protein  32.02 
 
 
235 aa  139  3e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0435  hypothetical protein  31.8 
 
 
235 aa  137  1e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0617  hypothetical protein  33.64 
 
 
222 aa  121  9.999999999999999e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.236846  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0949  hypothetical protein  33.03 
 
 
219 aa  118  7.999999999999999e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0658473  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1858  protein of unknown function DUF45  31.05 
 
 
226 aa  112  4.0000000000000004e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000912457  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0984  zinc metalloprotease  32.88 
 
 
221 aa  111  1.0000000000000001e-23  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1819  hypothetical protein  26.36 
 
 
222 aa  106  3e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1098  hypothetical protein  27.73 
 
 
222 aa  106  4e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0083  hypothetical protein  26.82 
 
 
222 aa  105  9e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  decreased coverage  0.000843512  decreased coverage  0.0000753316 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04860  predicted metal-dependent hydrolase  29.07 
 
 
184 aa  102  7e-21  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2550  hypothetical protein  27.56 
 
 
231 aa  101  8e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.52441  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0156  hypothetical protein  29.07 
 
 
270 aa  95.9  5e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0977  protein of unknown function DUF45  25.88 
 
 
259 aa  94  2e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07420  predicted metal-dependent hydrolase  40.82 
 
 
198 aa  93.2  3e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.654381  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2343  hypothetical protein  27.12 
 
 
238 aa  92.8  4e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.781257  normal  0.0217963 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1632  protein of unknown function DUF45  33.33 
 
 
232 aa  91.3  1e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1114  hypothetical protein  28.21 
 
 
254 aa  90.5  2e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2668  protein of unknown function DUF45  39.8 
 
 
202 aa  89.4  5e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.255358  normal  0.761746 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0056  protein of unknown function DUF45  29.9 
 
 
238 aa  87.8  1e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2744  hypothetical protein  24.89 
 
 
252 aa  87  2e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2307  protein of unknown function DUF45  27.6 
 
 
244 aa  86.7  3e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0015  hypothetical protein  27.8 
 
 
247 aa  86.7  3e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000114472  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3548  hypothetical protein  30.04 
 
 
242 aa  85.9  6e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.405363  normal  0.224983 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4201  protein of unknown function DUF45  29.2 
 
 
245 aa  85.1  9e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0151  hypothetical protein  32.35 
 
 
240 aa  85.1  0.000000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2484  hypothetical protein  27.8 
 
 
245 aa  84.3  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.186682  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0542  hypothetical protein  26.84 
 
 
243 aa  83.2  0.000000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1416  putative metal-dependent hydrolase  26.86 
 
 
268 aa  82.4  0.000000000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06805  hypothetical protein  27.15 
 
 
258 aa  82.4  0.000000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2393  hypothetical protein  26.11 
 
 
244 aa  82.4  0.000000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_159  hypothetical protein  27.49 
 
 
240 aa  81.3  0.00000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.363835  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04470  predicted metal-dependent hydrolase  27.63 
 
 
241 aa  81.3  0.00000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0521  hypothetical protein  32.88 
 
 
288 aa  79.7  0.00000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0129218 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1069  hypothetical protein  27.66 
 
 
225 aa  80.1  0.00000000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.887273  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1894  hypothetical protein  28.45 
 
 
242 aa  79.7  0.00000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.470997  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0220  hypothetical protein  26.7 
 
 
240 aa  79.7  0.00000000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1049  hypothetical protein  26.36 
 
 
215 aa  79.3  0.00000000000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0449963  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2542  protein of unknown function DUF45  27.36 
 
 
242 aa  79.3  0.00000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.65103  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0547  hypothetical protein  36.67 
 
 
218 aa  79  0.00000000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.825313  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0647  hypothetical protein  24.55 
 
 
215 aa  78.2  0.00000000000009  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.764633  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2910  hypothetical protein  26.87 
 
 
237 aa  77.8  0.0000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0402  hypothetical protein  32.41 
 
 
285 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.450593  normal  0.256851 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0723  hypothetical protein  34.07 
 
 
220 aa  76.6  0.0000000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.835761  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0379  hypothetical protein  28.37 
 
 
237 aa  76.3  0.0000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2959  protein of unknown function DUF45  28.14 
 
 
227 aa  76.3  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3538  hypothetical protein  37.19 
 
 
239 aa  76.3  0.0000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.739224  normal  0.0386409 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0443  hypothetical protein  27.04 
 
 
292 aa  76.3  0.0000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.618297 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0373  protein of unknown function DUF45  25.93 
 
 
242 aa  75.5  0.0000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0649  hypothetical protein  23.39 
 
 
215 aa  75.5  0.0000000000007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0683  protein of unknown function DUF45  37.74 
 
 
300 aa  75.1  0.0000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.436167  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0397  protein of unknown function DUF45  39.81 
 
 
292 aa  75.5  0.0000000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.119001  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4016  hypothetical protein  37.74 
 
 
300 aa  75.5  0.0000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00585617  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0412  protein of unknown function DUF45  39.81 
 
 
292 aa  75.1  0.0000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.505198  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0079  zinc metalloprotease  24.41 
 
 
230 aa  74.7  0.000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0200194  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3143  protein of unknown function DUF45  27.64 
 
 
227 aa  74.3  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0570436  normal  0.976092 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0794  conserved hypothetical protein (DUF45 domain protein)  35.11 
 
 
221 aa  74.7  0.000000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.308629  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0100  protein of unknown function DUF45  27.84 
 
 
241 aa  75.1  0.000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2093  hypothetical protein  31.65 
 
 
295 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.786818  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2595  hypothetical protein  24.77 
 
 
238 aa  74.3  0.000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.23171  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2705  hypothetical protein  31.65 
 
 
295 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.319747  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2889  hypothetical protein  26.99 
 
 
261 aa  73.9  0.000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.653746  normal  0.363578 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6032  hypothetical protein  31.65 
 
 
316 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2732  hypothetical protein  31.65 
 
 
295 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0641  hypothetical protein  46.91 
 
 
236 aa  74.3  0.000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2082  hypothetical protein  27.07 
 
 
222 aa  73.9  0.000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2757  hypothetical protein  31.21 
 
 
303 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.328108  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0581  hypothetical protein  34.04 
 
 
295 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2622  hypothetical protein  30.5 
 
 
285 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.276697  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2293  hypothetical protein  30.33 
 
 
227 aa  72.8  0.000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2794  protein of unknown function DUF45  28.11 
 
 
242 aa  72  0.000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0182535  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0594  hypothetical protein  31.21 
 
 
301 aa  72  0.000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0215  hypothetical protein  36.79 
 
 
292 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.585984  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0727  protein of unknown function DUF45  23.85 
 
 
223 aa  71.6  0.00000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0100  hypothetical protein  26.55 
 
 
231 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.58057  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0504  hypothetical protein  29.45 
 
 
286 aa  71.2  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.22693  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0877  hypothetical protein  36.79 
 
 
292 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0698  hypothetical protein  36.79 
 
 
292 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0713  hypothetical protein  36.79 
 
 
292 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2427  hypothetical protein  36.79 
 
 
292 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.656656  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2731  hypothetical protein  36.79 
 
 
292 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.896479  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2347  hypothetical protein  36.79 
 
 
292 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0402  hypothetical protein  36.44 
 
 
245 aa  69.3  0.00000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.95027  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0646  hypothetical protein  31.31 
 
 
220 aa  69.3  0.00000000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0036  protein of unknown function DUF45  29.52 
 
 
262 aa  69.3  0.00000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0535  hypothetical protein  26.27 
 
 
206 aa  69.3  0.00000000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>