227 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_0860 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_0860  hypothetical protein  100 
 
 		 238 aa  496  1e-139  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2198  hypothetical protein  61.28 
 
 		 247 aa  310  9e-84  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.403347  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0947  hypothetical protein  54.2 
 
 		 245 aa  259  3e-68  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000214537 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2675  hypothetical protein  46.15 
 
 		 243 aa  230  2e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.49786 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4620  protein of unknown function DUF45  42.49 
 
 		 242 aa  217  1e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.212345 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0906  protein of unknown function DUF45  45.89 
 
 		 244 aa  209  3e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.876537  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0760  hypothetical protein  45.89 
 
 		 244 aa  209  3e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0365  hypothetical protein  41.88 
 
 		 232 aa  206  2e-52  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0669057  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1774  zinc metalloprotease  42.37 
 
 		 238 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0401  hypothetical protein  41.92 
 
 		 233 aa  196  3e-49  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0431  protein of unknown function DUF45  42.31 
 
 		 239 aa  194  1e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0244  hypothetical protein  38.89 
 
 		 253 aa  189  2e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0555  zinc metalloprotease  40.35 
 
 		 239 aa  177  1e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0652798  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0435  hypothetical protein  39.46 
 
 		 235 aa  171  6.999999999999999e-42  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0459  hypothetical protein  39.3 
 
 		 235 aa  171  1e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0543  peptidase S26A, signal peptidase I  36.94 
 
 		 236 aa  155  5.0000000000000005e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00150578  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0977  protein of unknown function DUF45  31.94 
 
 		 259 aa  132  5e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1591  protein of unknown function DUF45  44.06 
 
 		 153 aa  122  4e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.961397  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0949  hypothetical protein  32.41 
 
 		 219 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0658473  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1858  protein of unknown function DUF45  32.57 
 
 		 226 aa  116  1.9999999999999998e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000912457  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1416  putative metal-dependent hydrolase  31.67 
 
 		 268 aa  115  6.9999999999999995e-25  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1098  hypothetical protein  30.45 
 
 		 222 aa  115  7.999999999999999e-25  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2550  hypothetical protein  26.75 
 
 		 231 aa  114  2.0000000000000002e-24  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.52441  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04860  predicted metal-dependent hydrolase  30.77 
 
 		 184 aa  108  6e-23  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1819  hypothetical protein  27.85 
 
 		 222 aa  107  2e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0984  zinc metalloprotease  30.18 
 
 		 221 aa  106  4e-22  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0617  hypothetical protein  30.14 
 
 		 222 aa  105  5e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.236846  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0156  hypothetical protein  33.33 
 
 		 270 aa  104  1e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0083  hypothetical protein  26.94 
 
 		 222 aa  100  2e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  decreased coverage  0.000843512  decreased coverage  0.0000753316 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2082  hypothetical protein  29.02 
 
 		 222 aa  99  6e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4201  protein of unknown function DUF45  30.57 
 
 		 245 aa  97.4  2e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2668  protein of unknown function DUF45  43.88 
 
 		 202 aa  94.4  1e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.255358  normal  0.761746 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07420  predicted metal-dependent hydrolase  29.49 
 
 		 198 aa  94.7  1e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.654381  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2141  hypothetical protein  28.44 
 
 		 233 aa  94.4  2e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0199813 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2484  hypothetical protein  28.11 
 
 		 245 aa  92.4  6e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.186682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1114  hypothetical protein  32.19 
 
 		 254 aa  92.4  6e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2343  hypothetical protein  29.46 
 
 		 238 aa  92.4  6e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.781257  normal  0.0217963 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06805  hypothetical protein  30.62 
 
 		 258 aa  90.1  3e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3548  hypothetical protein  32.54 
 
 		 242 aa  88.2  1e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.405363  normal  0.224983 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1800  hypothetical protein  26.52 
 
 		 222 aa  86.7  3e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.404735  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2910  hypothetical protein  30.35 
 
 		 237 aa  86.7  3e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04470  predicted metal-dependent hydrolase  27.69 
 
 		 241 aa  87  3e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1843  protein of unknown function DUF45  25.61 
 
 		 254 aa  83.6  0.000000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.224767 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1632  protein of unknown function DUF45  26.76 
 
 		 232 aa  82.8  0.000000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2393  hypothetical protein  26.73 
 
 		 244 aa  81.3  0.00000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0151  hypothetical protein  27.98 
 
 		 240 aa  80.1  0.00000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0100  hypothetical protein  26.96 
 
 		 231 aa  78.6  0.00000000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.58057  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0503  hypothetical protein  24.51 
 
 		 224 aa  77  0.0000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0794  conserved hypothetical protein (DUF45 domain protein)  24.23 
 
 		 221 aa  76.6  0.0000000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.308629  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0535  hypothetical protein  25.68 
 
 		 206 aa  76.6  0.0000000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0649  hypothetical protein  25.36 
 
 		 215 aa  76.6  0.0000000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0542  hypothetical protein  24.63 
 
 		 243 aa  76.3  0.0000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2595  hypothetical protein  27.83 
 
 		 238 aa  75.9  0.0000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.23171  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1894  hypothetical protein  28.44 
 
 		 242 aa  74.7  0.000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.470997  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0723  hypothetical protein  26.32 
 
 		 220 aa  74.3  0.000000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.835761  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1049  hypothetical protein  25.35 
 
 		 215 aa  74.7  0.000000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0449963  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0220  hypothetical protein  26.42 
 
 		 240 aa  74.3  0.000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_159  hypothetical protein  25.91 
 
 		 240 aa  73.6  0.000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.363835  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1824  hypothetical protein  23.04 
 
 		 224 aa  72.8  0.000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0568  hypothetical protein  26.34 
 
 		 235 aa  72.8  0.000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000566322 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3143  protein of unknown function DUF45  28.5 
 
 		 227 aa  72  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0570436  normal  0.976092 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0899  hypothetical protein  25.69 
 
 		 254 aa  70.9  0.00000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000145532 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2542  protein of unknown function DUF45  25.73 
 
 		 242 aa  69.7  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.65103  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0870  protein of unknown function DUF45  25.51 
 
 		 224 aa  69.7  0.00000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0260023  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2959  protein of unknown function DUF45  27.98 
 
 		 227 aa  70.1  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0015  hypothetical protein  29.35 
 
 		 247 aa  70.1  0.00000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000114472  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0727  protein of unknown function DUF45  25.79 
 
 		 223 aa  69.7  0.00000000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2255  zinc metalloprotease  28.96 
 
 		 227 aa  69.3  0.00000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3789  hypothetical protein  26.04 
 
 		 235 aa  68.9  0.00000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4036  hypothetical protein  23.65 
 
 		 234 aa  68.6  0.00000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0402  hypothetical protein  28.23 
 
 		 245 aa  67.4  0.0000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.95027  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0843  hypothetical protein  26.09 
 
 		 246 aa  67.4  0.0000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.335069  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0791  hypothetical protein  26.09 
 
 		 246 aa  67.4  0.0000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.371001  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2307  protein of unknown function DUF45  23.5 
 
 		 244 aa  67  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1312  hypothetical protein  24.39 
 
 		 234 aa  66.6  0.0000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1789  hypothetical protein  24.26 
 
 		 238 aa  66.6  0.0000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0413  hypothetical protein  26.82 
 
 		 249 aa  66.2  0.0000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0647  hypothetical protein  24.76 
 
 		 215 aa  66.2  0.0000000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.764633  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0373  protein of unknown function DUF45  26.64 
 
 		 242 aa  65.9  0.0000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0309  zinc metalloprotease  22.39 
 
 		 235 aa  65.5  0.0000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.122687  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0056  protein of unknown function DUF45  23.53 
 
 		 238 aa  65.5  0.0000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0060  protein of unknown function DUF45  33.33 
 
 		 259 aa  65.5  0.0000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2744  hypothetical protein  23.98 
 
 		 252 aa  65.5  0.0000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0581  hypothetical protein  24.45 
 
 		 295 aa  65.1  0.0000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0800  hypothetical protein  23.38 
 
 		 237 aa  64.7  0.000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0356506  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0379  hypothetical protein  25.98 
 
 		 237 aa  63.9  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0322  hypothetical protein  22.39 
 
 		 235 aa  64.3  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000118894  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0337  hypothetical protein  22.39 
 
 		 235 aa  64.3  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000389941  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2928  hypothetical protein  26.36 
 
 		 219 aa  63.9  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4010  hypothetical protein  23.29 
 
 		 253 aa  64.3  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.836815 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1763  protein of unknown function DUF45  25.37 
 
 		 246 aa  63.9  0.000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0369  hypothetical protein  22.38 
 
 		 235 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0561  protein of unknown function DUF45  31.31 
 
 		 211 aa  63.5  0.000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0384  zinc metalloprotease  23.65 
 
 		 235 aa  63.2  0.000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0625718  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2274  protein of unknown function DUF45  25.79 
 
 		 243 aa  63.2  0.000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1292  hypothetical protein  26.5 
 
 		 308 aa  62.8  0.000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.232025 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0079  zinc metalloprotease  39.44 
 
 		 230 aa  62.8  0.000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0200194  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2293  hypothetical protein  29.11 
 
 		 227 aa  62.4  0.000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1164  hypothetical protein  32.41 
 
 		 141 aa  62.4  0.000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1951  hypothetical protein  24.75 
 
 		 481 aa  62  0.000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>