265 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2343 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_2343  hypothetical protein  100 
 
 		 238 aa  481  1e-135  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.781257  normal  0.0217963 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2542  protein of unknown function DUF45  44.64 
 
 		 242 aa  221  8e-57  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.65103  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1894  hypothetical protein  42.68 
 
 		 242 aa  185  4e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.470997  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1114  hypothetical protein  37.6 
 
 		 254 aa  160  2e-38  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0617  hypothetical protein  32.88 
 
 		 222 aa  149  4e-35  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.236846  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06805  hypothetical protein  34.69 
 
 		 258 aa  142  5e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0949  hypothetical protein  34.23 
 
 		 219 aa  138  8.999999999999999e-32  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0658473  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04470  predicted metal-dependent hydrolase  31.49 
 
 		 241 aa  137  1e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2910  hypothetical protein  33.33 
 
 		 237 aa  137  2e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0156  hypothetical protein  33.6 
 
 		 270 aa  137  2e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0015  hypothetical protein  37.34 
 
 		 247 aa  137  2e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000114472  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0379  hypothetical protein  36.53 
 
 		 237 aa  134  9e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2595  hypothetical protein  31.76 
 
 		 238 aa  134  9.999999999999999e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.23171  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2307  protein of unknown function DUF45  32.17 
 
 		 244 aa  134  9.999999999999999e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0984  zinc metalloprotease  32.57 
 
 		 221 aa  132  3.9999999999999996e-30  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2393  hypothetical protein  34.21 
 
 		 244 aa  130  3e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0542  hypothetical protein  31.91 
 
 		 243 aa  129  4.0000000000000003e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0870  protein of unknown function DUF45  31.8 
 
 		 224 aa  129  5.0000000000000004e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0260023  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1819  hypothetical protein  31.51 
 
 		 222 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0083  hypothetical protein  30.59 
 
 		 222 aa  125  5e-28  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  decreased coverage  0.000843512  decreased coverage  0.0000753316 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0056  protein of unknown function DUF45  35.62 
 
 		 238 aa  123  2e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1098  hypothetical protein  29.73 
 
 		 222 aa  122  5e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2794  protein of unknown function DUF45  32.63 
 
 		 242 aa  120  1.9999999999999998e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0182535  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1824  hypothetical protein  28.57 
 
 		 224 aa  119  4.9999999999999996e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1069  hypothetical protein  30.41 
 
 		 223 aa  119  6e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.262175  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1789  hypothetical protein  34.56 
 
 		 238 aa  116  1.9999999999999998e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05618  hypothetical protein  31.22 
 
 		 226 aa  117  1.9999999999999998e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0843  hypothetical protein  32.65 
 
 		 246 aa  115  6e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.335069  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0791  hypothetical protein  32.65 
 
 		 246 aa  115  6e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.371001  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3548  hypothetical protein  33.76 
 
 		 242 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.405363  normal  0.224983 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2889  hypothetical protein  29.34 
 
 		 261 aa  114  2.0000000000000002e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.653746  normal  0.363578 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1843  protein of unknown function DUF45  28.4 
 
 		 254 aa  113  3e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.224767 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0503  hypothetical protein  28.96 
 
 		 224 aa  113  3e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1858  protein of unknown function DUF45  26.91 
 
 		 226 aa  112  5e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000912457  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1164  hypothetical protein  40.74 
 
 		 141 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0947  hypothetical protein  30.77 
 
 		 245 aa  110  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000214537 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2107  hypothetical protein  31.49 
 
 		 240 aa  107  2e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0800  hypothetical protein  24.89 
 
 		 237 aa  106  4e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0356506  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2255  zinc metalloprotease  33.33 
 
 		 227 aa  105  5e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2959  protein of unknown function DUF45  31.8 
 
 		 227 aa  104  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3143  protein of unknown function DUF45  31.8 
 
 		 227 aa  104  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0570436  normal  0.976092 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0100  hypothetical protein  32.13 
 
 		 231 aa  103  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.58057  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4010  hypothetical protein  30.52 
 
 		 253 aa  103  3e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.836815 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4201  protein of unknown function DUF45  29.13 
 
 		 245 aa  102  5e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4036  hypothetical protein  31 
 
 		 234 aa  101  1e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0899  hypothetical protein  30.49 
 
 		 254 aa  101  1e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000145532 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0568  hypothetical protein  28.77 
 
 		 235 aa  101  1e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000566322 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0100  protein of unknown function DUF45  34.5 
 
 		 241 aa  99.8  3e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0071  protein of unknown function DUF45  29.17 
 
 		 223 aa  99  6e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3789  hypothetical protein  35.22 
 
 		 235 aa  97.1  2e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2198  hypothetical protein  28.63 
 
 		 247 aa  96.7  3e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.403347  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0365  hypothetical protein  27.03 
 
 		 232 aa  96.3  4e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0669057  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0401  hypothetical protein  29.03 
 
 		 233 aa  96.3  4e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2274  protein of unknown function DUF45  30.63 
 
 		 243 aa  95.5  6e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0505  hypothetical protein  31.63 
 
 		 233 aa  95.5  6e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.722938 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0906  protein of unknown function DUF45  29.46 
 
 		 244 aa  95.1  8e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.876537  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0760  hypothetical protein  29.46 
 
 		 244 aa  95.1  8e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2675  hypothetical protein  30 
 
 		 243 aa  94.7  1e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.49786 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0459  hypothetical protein  27.95 
 
 		 235 aa  94.7  1e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0435  hypothetical protein  28.44 
 
 		 235 aa  94.7  1e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0431  protein of unknown function DUF45  27.12 
 
 		 239 aa  92.8  4e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2484  hypothetical protein  28.32 
 
 		 245 aa  92.4  6e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.186682  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0860  hypothetical protein  29.46 
 
 		 238 aa  92.4  6e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1102  zinc metalloprotease  26.92 
 
 		 243 aa  90.5  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00846989  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0727  protein of unknown function DUF45  22.97 
 
 		 223 aa  90.9  2e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0521  hypothetical protein  25.42 
 
 		 288 aa  90.1  3e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0129218 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0317  hypothetical protein  25.76 
 
 		 235 aa  89.7  4e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0431  hypothetical protein  25.33 
 
 		 235 aa  88.6  8e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0309  zinc metalloprotease  25.33 
 
 		 235 aa  88.2  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.122687  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3538  hypothetical protein  25.54 
 
 		 239 aa  87.4  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.739224  normal  0.0386409 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0384  zinc metalloprotease  25.33 
 
 		 235 aa  87.4  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0625718  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1763  protein of unknown function DUF45  27.95 
 
 		 246 aa  87.4  2e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0504  hypothetical protein  25.11 
 
 		 286 aa  86.7  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.22693  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1312  hypothetical protein  26.99 
 
 		 234 aa  85.9  4e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0151  hypothetical protein  30.04 
 
 		 240 aa  85.9  5e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0431  hypothetical protein  24.89 
 
 		 235 aa  85.9  5e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00811962  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0322  hypothetical protein  25.33 
 
 		 235 aa  85.9  5e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000118894  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0337  hypothetical protein  25.33 
 
 		 235 aa  85.9  5e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000389941  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0306  zinc metalloprotease  25.33 
 
 		 235 aa  85.1  8e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_159  hypothetical protein  28.84 
 
 		 240 aa  85.1  8e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.363835  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4297  hypothetical protein  28.22 
 
 		 251 aa  85.1  9e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0369  hypothetical protein  24.89 
 
 		 235 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1774  zinc metalloprotease  26.47 
 
 		 238 aa  84.7  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0220  hypothetical protein  28.25 
 
 		 240 aa  83.6  0.000000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0397  protein of unknown function DUF45  24.35 
 
 		 292 aa  83.6  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.119001  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0412  protein of unknown function DUF45  24.35 
 
 		 292 aa  83.6  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.505198  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0683  protein of unknown function DUF45  25.44 
 
 		 300 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.436167  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1707  hypothetical protein  28.89 
 
 		 239 aa  83.2  0.000000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.182955  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0244  hypothetical protein  24.79 
 
 		 253 aa  83.6  0.000000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1632  protein of unknown function DUF45  26.98 
 
 		 232 aa  82  0.000000000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4016  hypothetical protein  25 
 
 		 300 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00585617  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0543  peptidase S26A, signal peptidase I  26.39 
 
 		 236 aa  80.5  0.00000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00150578  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0443  hypothetical protein  24.68 
 
 		 292 aa  80.9  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.618297 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2744  hypothetical protein  25.45 
 
 		 252 aa  80.1  0.00000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0011  hypothetical protein  30.65 
 
 		 236 aa  79.3  0.00000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0555  zinc metalloprotease  24.69 
 
 		 239 aa  79.3  0.00000000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0652798  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3354  hypothetical protein  30.84 
 
 		 265 aa  79.3  0.00000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4620  protein of unknown function DUF45  28.57 
 
 		 242 aa  79.3  0.00000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.212345 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0547  hypothetical protein  27.51 
 
 		 218 aa  79  0.00000000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.825313  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0641  hypothetical protein  28.07 
 
 		 236 aa  78.6  0.00000000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>