296 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_07420 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_07420  predicted metal-dependent hydrolase  100 
 
 
198 aa  412  1e-114  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.654381  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04860  predicted metal-dependent hydrolase  45.51 
 
 
184 aa  174  7e-43  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2668  protein of unknown function DUF45  45.95 
 
 
202 aa  163  1.0000000000000001e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.255358  normal  0.761746 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0435  hypothetical protein  32.59 
 
 
235 aa  124  7e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0459  hypothetical protein  31.7 
 
 
235 aa  120  9e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0543  peptidase S26A, signal peptidase I  31.72 
 
 
236 aa  120  1.9999999999999998e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00150578  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0555  zinc metalloprotease  30.4 
 
 
239 aa  114  1.0000000000000001e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0652798  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1416  putative metal-dependent hydrolase  30.8 
 
 
268 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1774  zinc metalloprotease  30.67 
 
 
238 aa  111  7.000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0365  hypothetical protein  27.68 
 
 
232 aa  110  2.0000000000000002e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0669057  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2198  hypothetical protein  29.03 
 
 
247 aa  102  4e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.403347  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0947  hypothetical protein  28.7 
 
 
245 aa  102  5e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  unclonable  0.0000214537 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0401  hypothetical protein  29.33 
 
 
233 aa  101  8e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4620  protein of unknown function DUF45  31.14 
 
 
242 aa  99  4e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.212345 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0079  zinc metalloprotease  27.57 
 
 
230 aa  98.2  7e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0200194  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0906  protein of unknown function DUF45  29.66 
 
 
244 aa  97.4  1e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.876537  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0760  hypothetical protein  29.66 
 
 
244 aa  97.4  1e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2675  hypothetical protein  27.11 
 
 
243 aa  96.3  3e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.49786 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0860  hypothetical protein  29.49 
 
 
238 aa  94.7  8e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0244  hypothetical protein  44.44 
 
 
253 aa  94.7  8e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0431  protein of unknown function DUF45  40.82 
 
 
239 aa  93.2  2e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0794  conserved hypothetical protein (DUF45 domain protein)  29.2 
 
 
221 aa  90.5  1e-17  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.308629  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1800  hypothetical protein  37.5 
 
 
222 aa  90.9  1e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.404735  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1858  protein of unknown function DUF45  34.34 
 
 
226 aa  89.4  3e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000912457  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2550  hypothetical protein  39.78 
 
 
231 aa  87.4  1e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.52441  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0977  protein of unknown function DUF45  39.13 
 
 
259 aa  86.3  2e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0535  hypothetical protein  25.54 
 
 
206 aa  86.7  2e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0647  hypothetical protein  34.74 
 
 
215 aa  85.5  5e-16  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.764633  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0723  hypothetical protein  27.46 
 
 
220 aa  85.1  6e-16  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.835761  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0646  hypothetical protein  24.77 
 
 
220 aa  84.7  8e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0649  hypothetical protein  26.06 
 
 
215 aa  81.3  0.000000000000008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2141  hypothetical protein  31.67 
 
 
233 aa  80.9  0.00000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0199813 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1632  protein of unknown function DUF45  32.38 
 
 
232 aa  80.9  0.00000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2082  hypothetical protein  34 
 
 
222 aa  80.1  0.00000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4201  protein of unknown function DUF45  25.78 
 
 
245 aa  80.1  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0561  protein of unknown function DUF45  35.96 
 
 
211 aa  80.5  0.00000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1049  hypothetical protein  24.34 
 
 
215 aa  79.3  0.00000000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0449963  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0984  zinc metalloprotease  32.53 
 
 
221 aa  78.2  0.00000000000007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0151  hypothetical protein  34.23 
 
 
240 aa  77.4  0.0000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1894  hypothetical protein  38.61 
 
 
242 aa  77.4  0.0000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.470997  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0220  hypothetical protein  33.64 
 
 
240 aa  77  0.0000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0609  hypothetical protein  30.12 
 
 
179 aa  77.8  0.0000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0949  hypothetical protein  43.75 
 
 
219 aa  76.3  0.0000000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0658473  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0156  hypothetical protein  35.45 
 
 
270 aa  74.7  0.0000000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1098  hypothetical protein  43.48 
 
 
222 aa  74.7  0.0000000000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2910  hypothetical protein  37.93 
 
 
237 aa  74.7  0.0000000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0083  hypothetical protein  43.48 
 
 
222 aa  73.9  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  decreased coverage  0.000843512  decreased coverage  0.0000753316 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1763  protein of unknown function DUF45  38.78 
 
 
246 aa  73.6  0.000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1624  hypothetical protein  28.49 
 
 
187 aa  73.2  0.000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.594523  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1114  hypothetical protein  27.15 
 
 
254 aa  73.6  0.000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0617  hypothetical protein  39.51 
 
 
222 aa  72.8  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.236846  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0100  protein of unknown function DUF45  35.48 
 
 
241 aa  72.4  0.000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_159  hypothetical protein  37.93 
 
 
240 aa  72.4  0.000000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.363835  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0402  hypothetical protein  39.56 
 
 
245 aa  71.6  0.000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.95027  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0839  hypothetical protein  44.05 
 
 
237 aa  71.6  0.000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.243328 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06805  hypothetical protein  43.48 
 
 
258 aa  71.6  0.000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2393  hypothetical protein  37.93 
 
 
244 aa  71.6  0.000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1819  hypothetical protein  42.03 
 
 
222 aa  71.2  0.000000000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1069  hypothetical protein  29.2 
 
 
225 aa  71.2  0.00000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.887273  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0015  hypothetical protein  39.73 
 
 
247 aa  70.5  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000114472  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0056  protein of unknown function DUF45  36.67 
 
 
238 aa  69.7  0.00000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0542  hypothetical protein  37.5 
 
 
243 aa  70.1  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2484  hypothetical protein  37.36 
 
 
245 aa  70.1  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.186682  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0604  protein of unknown function DUF45  40.48 
 
 
241 aa  70.1  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.068795 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0593  hypothetical protein  40.48 
 
 
260 aa  70.5  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0332404  normal  0.0318611 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2274  protein of unknown function DUF45  37.37 
 
 
243 aa  69.3  0.00000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0568  protein of unknown function DUF45  40.48 
 
 
241 aa  69.3  0.00000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.237402 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2293  hypothetical protein  28.5 
 
 
227 aa  69.3  0.00000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1707  hypothetical protein  38.1 
 
 
239 aa  69.7  0.00000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.182955  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3493  hypothetical protein  39.76 
 
 
244 aa  68.9  0.00000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.718444  normal  0.055231 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2307  protein of unknown function DUF45  37.93 
 
 
244 aa  68.6  0.00000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2542  protein of unknown function DUF45  37.97 
 
 
242 aa  68.2  0.00000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.65103  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1561  zinc protease, putative  37.23 
 
 
244 aa  68.2  0.00000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2343  hypothetical protein  37.18 
 
 
238 aa  67.4  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.781257  normal  0.0217963 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04470  predicted metal-dependent hydrolase  29.2 
 
 
241 aa  67.4  0.0000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4887  hypothetical protein  36.78 
 
 
243 aa  67.4  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.334239  normal  0.0174826 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1480  hypothetical protein  40.51 
 
 
268 aa  67  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3538  hypothetical protein  36.19 
 
 
239 aa  66.2  0.0000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.739224  normal  0.0386409 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2889  hypothetical protein  40.7 
 
 
261 aa  66.2  0.0000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.653746  normal  0.363578 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1661  protein of unknown function DUF45  33.96 
 
 
244 aa  66.2  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.843742  normal  0.112904 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2794  protein of unknown function DUF45  35.71 
 
 
242 aa  64.3  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0182535  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0064  hypothetical protein  36.84 
 
 
278 aa  64.3  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0641  hypothetical protein  35.71 
 
 
236 aa  64.3  0.000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0125  hypothetical protein  34.15 
 
 
256 aa  64.3  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.84591  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0508  hypothetical protein  28.34 
 
 
233 aa  63.9  0.000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.139012 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0899  hypothetical protein  33.01 
 
 
254 aa  63.2  0.000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  hitchhiker  0.000145532 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1772  hypothetical protein  24.88 
 
 
232 aa  63.5  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.236777  normal  0.415522 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1292  hypothetical protein  33.96 
 
 
308 aa  63.9  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.232025 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4387  hypothetical protein  37.18 
 
 
122 aa  63.5  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.177424  normal  0.972662 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3354  hypothetical protein  42.03 
 
 
265 aa  63.2  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1808  protein of unknown function DUF45  38.16 
 
 
111 aa  63.2  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1766  hypothetical protein  47.37 
 
 
241 aa  63.5  0.000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0379  hypothetical protein  35.23 
 
 
237 aa  62.8  0.000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0413  hypothetical protein  30.77 
 
 
249 aa  62.8  0.000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1837  protein of unknown function DUF45  34.48 
 
 
247 aa  63.2  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.37826  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2219  protein of unknown function DUF45  32.18 
 
 
108 aa  62.4  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1951  hypothetical protein  28.87 
 
 
481 aa  62.4  0.000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2282  protein of unknown function DUF45  32.18 
 
 
108 aa  62.4  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.879838  hitchhiker  0.00256901 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3363  hypothetical protein  31.94 
 
 
249 aa  62.4  0.000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.211491 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3789  hypothetical protein  34.48 
 
 
235 aa  62  0.000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>