70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1591 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011060  Ppha_1591  protein of unknown function DUF45  100 
 
 
153 aa  307  4e-83  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.961397  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1774  zinc metalloprotease  48.28 
 
 
238 aa  153  9e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0431  protein of unknown function DUF45  47.92 
 
 
239 aa  150  7e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0244  hypothetical protein  45.14 
 
 
253 aa  149  1e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0947  hypothetical protein  44.9 
 
 
245 aa  127  4.0000000000000003e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  unclonable  0.0000214537 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2198  hypothetical protein  44.52 
 
 
247 aa  127  5.0000000000000004e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.403347  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4620  protein of unknown function DUF45  42.75 
 
 
242 aa  124  6e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.212345 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0401  hypothetical protein  43.84 
 
 
233 aa  122  2e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0860  hypothetical protein  44.06 
 
 
238 aa  122  2e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2675  hypothetical protein  41.1 
 
 
243 aa  112  1.0000000000000001e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.49786 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0906  protein of unknown function DUF45  39.72 
 
 
244 aa  112  3e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.876537  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0760  hypothetical protein  39.72 
 
 
244 aa  112  3e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0365  hypothetical protein  35.53 
 
 
232 aa  94.4  6e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0669057  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0435  hypothetical protein  44.12 
 
 
235 aa  93.6  1e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0459  hypothetical protein  44.12 
 
 
235 aa  92  3e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0543  peptidase S26A, signal peptidase I  34.03 
 
 
236 aa  87.8  5e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00150578  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0555  zinc metalloprotease  36.09 
 
 
239 aa  87  9e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0652798  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0949  hypothetical protein  30.22 
 
 
219 aa  66.6  0.0000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0658473  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2550  hypothetical protein  31.39 
 
 
231 aa  64.7  0.0000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.52441  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0977  protein of unknown function DUF45  26.53 
 
 
259 aa  64.7  0.0000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0984  zinc metalloprotease  31.82 
 
 
221 aa  61.6  0.000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1858  protein of unknown function DUF45  28 
 
 
226 aa  61.2  0.000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000912457  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1800  hypothetical protein  42.37 
 
 
222 aa  61.2  0.000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.404735  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2141  hypothetical protein  40 
 
 
233 aa  60.8  0.000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0199813 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07420  predicted metal-dependent hydrolase  38.57 
 
 
198 aa  60.5  0.000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.654381  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0617  hypothetical protein  29.77 
 
 
222 aa  59.7  0.00000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.236846  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2082  hypothetical protein  38.98 
 
 
222 aa  59.3  0.00000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1098  hypothetical protein  27.59 
 
 
222 aa  54.3  0.0000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04860  predicted metal-dependent hydrolase  39.66 
 
 
184 aa  53.5  0.000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2668  protein of unknown function DUF45  36.51 
 
 
202 aa  52  0.000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.255358  normal  0.761746 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1819  hypothetical protein  26.32 
 
 
222 aa  51.6  0.000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0503  hypothetical protein  24.37 
 
 
224 aa  51.6  0.000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2307  protein of unknown function DUF45  26.8 
 
 
244 aa  50.1  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0079  zinc metalloprotease  29.32 
 
 
230 aa  48.9  0.00002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0200194  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0870  protein of unknown function DUF45  27.12 
 
 
224 aa  48.5  0.00003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0260023  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0794  conserved hypothetical protein (DUF45 domain protein)  26.92 
 
 
221 aa  48.5  0.00003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.308629  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0647  hypothetical protein  30.16 
 
 
215 aa  48.9  0.00003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.764633  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0723  hypothetical protein  36.07 
 
 
220 aa  48.9  0.00003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.835761  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0535  hypothetical protein  32.81 
 
 
206 aa  48.1  0.00004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1049  hypothetical protein  34.43 
 
 
215 aa  47.8  0.00005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0449963  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0056  protein of unknown function DUF45  26.06 
 
 
238 aa  47.8  0.00006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0649  hypothetical protein  32.79 
 
 
215 aa  47  0.00009  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0542  hypothetical protein  27.56 
 
 
243 aa  47  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_159  hypothetical protein  27.41 
 
 
240 aa  46.6  0.0001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.363835  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0156  hypothetical protein  27.27 
 
 
270 aa  46.6  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0083  hypothetical protein  26.67 
 
 
222 aa  46.6  0.0001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  decreased coverage  0.000843512  decreased coverage  0.0000753316 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2542  protein of unknown function DUF45  27.41 
 
 
242 aa  45.8  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.65103  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0015  hypothetical protein  26 
 
 
247 aa  45.8  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000114472  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2393  hypothetical protein  25.74 
 
 
244 aa  45.8  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1114  hypothetical protein  25.87 
 
 
254 aa  45.4  0.0003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0220  hypothetical protein  27.21 
 
 
240 aa  45.1  0.0004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1894  hypothetical protein  24.29 
 
 
242 aa  44.7  0.0004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.470997  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2910  hypothetical protein  28.26 
 
 
237 aa  44.7  0.0004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0646  hypothetical protein  39.22 
 
 
220 aa  44.7  0.0004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1069  hypothetical protein  25.42 
 
 
223 aa  44.7  0.0004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.262175  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0373  protein of unknown function DUF45  26.28 
 
 
242 aa  44.7  0.0005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2744  hypothetical protein  23.85 
 
 
252 aa  44.7  0.0005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04470  predicted metal-dependent hydrolase  26.5 
 
 
241 aa  44.3  0.0006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1824  hypothetical protein  25.42 
 
 
224 aa  43.9  0.0007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0151  hypothetical protein  25.37 
 
 
240 aa  43.9  0.0008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1669  metal-dependent hydrolase-like  38.33 
 
 
137 aa  43.1  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000580277 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2595  hypothetical protein  24.04 
 
 
238 aa  42.7  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.23171  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1789  hypothetical protein  25.22 
 
 
238 aa  42.4  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3789  hypothetical protein  27.55 
 
 
235 aa  42.4  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1763  protein of unknown function DUF45  23.81 
 
 
246 aa  41.6  0.004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2343  hypothetical protein  26.85 
 
 
238 aa  41.2  0.006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.781257  normal  0.0217963 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0142  protein of unknown function DUF45  44 
 
 
107 aa  40.4  0.008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.596952  normal  0.717523 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1632  protein of unknown function DUF45  28.57 
 
 
232 aa  40.4  0.008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1102  zinc metalloprotease  26.05 
 
 
243 aa  40.4  0.009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00846989  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3548  hypothetical protein  26.12 
 
 
242 aa  40.4  0.01  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.405363  normal  0.224983 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>