257 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_1800 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007204  Psyc_1800  hypothetical protein  100 
 
 
222 aa  463  1e-129  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.404735  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2082  hypothetical protein  77.93 
 
 
222 aa  374  1e-103  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2141  hypothetical protein  57.52 
 
 
233 aa  263  2e-69  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0199813 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0977  protein of unknown function DUF45  29.67 
 
 
259 aa  108  7.000000000000001e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0459  hypothetical protein  30.32 
 
 
235 aa  108  7.000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0435  hypothetical protein  30.91 
 
 
235 aa  108  8.000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0543  peptidase S26A, signal peptidase I  28.5 
 
 
236 aa  106  3e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00150578  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0555  zinc metalloprotease  32.55 
 
 
239 aa  104  1e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0652798  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0401  hypothetical protein  30.45 
 
 
233 aa  104  1e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2198  hypothetical protein  30.49 
 
 
247 aa  102  4e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.403347  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0760  hypothetical protein  30.04 
 
 
244 aa  99.4  4e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0906  protein of unknown function DUF45  30.04 
 
 
244 aa  99.4  4e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.876537  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1858  protein of unknown function DUF45  28.31 
 
 
226 aa  98.2  8e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000912457  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04860  predicted metal-dependent hydrolase  30.69 
 
 
184 aa  96.3  3e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2668  protein of unknown function DUF45  26.6 
 
 
202 aa  93.2  2e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.255358  normal  0.761746 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0079  zinc metalloprotease  29.15 
 
 
230 aa  91.7  9e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0200194  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07420  predicted metal-dependent hydrolase  37.5 
 
 
198 aa  90.9  1e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.654381  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0947  hypothetical protein  25.78 
 
 
245 aa  91.3  1e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  unclonable  0.0000214537 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0402  hypothetical protein  27.88 
 
 
245 aa  86.3  3e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.95027  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0860  hypothetical protein  26.52 
 
 
238 aa  86.7  3e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0647  hypothetical protein  36 
 
 
215 aa  84.7  9e-16  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.764633  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0949  hypothetical protein  28.02 
 
 
219 aa  82.4  0.000000000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0658473  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0365  hypothetical protein  27.75 
 
 
232 aa  82  0.000000000000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0669057  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1774  zinc metalloprotease  38.3 
 
 
238 aa  82  0.000000000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0984  zinc metalloprotease  28.29 
 
 
221 aa  80.9  0.00000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1632  protein of unknown function DUF45  35.87 
 
 
232 aa  80.1  0.00000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0727  protein of unknown function DUF45  24.77 
 
 
223 aa  80.1  0.00000000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4620  protein of unknown function DUF45  22.78 
 
 
242 aa  80.1  0.00000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.212345 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0083  hypothetical protein  25 
 
 
222 aa  79  0.00000000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  decreased coverage  0.000843512  decreased coverage  0.0000753316 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1416  putative metal-dependent hydrolase  25.33 
 
 
268 aa  78.6  0.00000000000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0542  hypothetical protein  23.32 
 
 
243 aa  77.8  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2910  hypothetical protein  33.96 
 
 
237 aa  77.4  0.0000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1098  hypothetical protein  28.84 
 
 
222 aa  78.2  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0723  hypothetical protein  25.38 
 
 
220 aa  77.4  0.0000000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.835761  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2274  protein of unknown function DUF45  32.59 
 
 
243 aa  77.4  0.0000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2675  hypothetical protein  24.2 
 
 
243 aa  77  0.0000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.49786 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0561  protein of unknown function DUF45  30 
 
 
211 aa  76.3  0.0000000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1049  hypothetical protein  26.18 
 
 
215 aa  75.9  0.0000000000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0449963  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4173  hypothetical protein  24.38 
 
 
303 aa  75.9  0.0000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.282875 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1819  hypothetical protein  24.53 
 
 
222 aa  75.1  0.0000000000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0794  conserved hypothetical protein (DUF45 domain protein)  37.62 
 
 
221 aa  74.7  0.0000000000009  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.308629  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1661  protein of unknown function DUF45  27.85 
 
 
244 aa  74.7  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.843742  normal  0.112904 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2550  hypothetical protein  24.75 
 
 
231 aa  73.9  0.000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.52441  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3789  hypothetical protein  38.95 
 
 
235 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0617  hypothetical protein  46.15 
 
 
222 aa  73.9  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.236846  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0649  hypothetical protein  24.87 
 
 
215 aa  72.8  0.000000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0244  hypothetical protein  36 
 
 
253 aa  72.4  0.000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1789  hypothetical protein  36.56 
 
 
238 aa  72  0.000000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2166  hypothetical protein  22.82 
 
 
310 aa  71.6  0.000000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.221845  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2307  protein of unknown function DUF45  39.24 
 
 
244 aa  70.9  0.00000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1763  protein of unknown function DUF45  24.63 
 
 
246 aa  70.9  0.00000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0646  hypothetical protein  33.02 
 
 
220 aa  70.1  0.00000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1894  hypothetical protein  38.95 
 
 
242 aa  70.1  0.00000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.470997  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4297  hypothetical protein  31.48 
 
 
251 aa  70.5  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04470  predicted metal-dependent hydrolase  32.63 
 
 
241 aa  70.5  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0535  hypothetical protein  30.11 
 
 
206 aa  70.5  0.00000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2484  hypothetical protein  34.62 
 
 
245 aa  70.1  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.186682  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0373  protein of unknown function DUF45  26.42 
 
 
242 aa  69.3  0.00000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0071  protein of unknown function DUF45  34.34 
 
 
223 aa  68.9  0.00000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2552  hypothetical protein  22.07 
 
 
217 aa  68.6  0.00000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000141461  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2393  hypothetical protein  30.11 
 
 
244 aa  68.6  0.00000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0661  zinc protease, putative  53.33 
 
 
243 aa  68.2  0.00000000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.792264  normal  0.0577046 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1951  hypothetical protein  34.04 
 
 
481 aa  68.2  0.00000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0503  hypothetical protein  26.34 
 
 
224 aa  67.8  0.0000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0100  protein of unknown function DUF45  35.48 
 
 
241 aa  67.8  0.0000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1707  hypothetical protein  25.57 
 
 
239 aa  67.8  0.0000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.182955  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0431  protein of unknown function DUF45  26.34 
 
 
239 aa  67.8  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0547  protein of unknown function DUF45  23.35 
 
 
306 aa  68.2  0.0000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0531  hypothetical protein  23.35 
 
 
306 aa  68.2  0.0000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.10161 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1292  hypothetical protein  42.86 
 
 
308 aa  67.4  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.232025 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0594  hypothetical protein  22.69 
 
 
301 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0100  hypothetical protein  41.33 
 
 
231 aa  67  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.58057  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2595  hypothetical protein  20.91 
 
 
238 aa  67  0.0000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.23171  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0015  hypothetical protein  44.62 
 
 
247 aa  67  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000114472  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4201  protein of unknown function DUF45  21.82 
 
 
245 aa  67  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0504  hypothetical protein  23.5 
 
 
286 aa  66.6  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.22693  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0568  hypothetical protein  32.98 
 
 
235 aa  66.6  0.0000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000566322 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1102  zinc metalloprotease  38.36 
 
 
243 aa  66.6  0.0000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00846989  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0804  zinc metalloprotease, putative  36.05 
 
 
229 aa  66.6  0.0000000003  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4010  hypothetical protein  32.69 
 
 
253 aa  66.2  0.0000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.836815 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0212  hypothetical protein  39.77 
 
 
321 aa  66.2  0.0000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0964391 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0215  hypothetical protein  22.94 
 
 
292 aa  65.5  0.0000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.585984  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0877  hypothetical protein  22.94 
 
 
292 aa  65.5  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0698  hypothetical protein  22.94 
 
 
292 aa  65.5  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2427  hypothetical protein  22.94 
 
 
292 aa  65.5  0.0000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.656656  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0713  hypothetical protein  22.94 
 
 
292 aa  65.5  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2731  hypothetical protein  22.94 
 
 
292 aa  65.5  0.0000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.896479  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2347  hypothetical protein  22.94 
 
 
292 aa  65.5  0.0000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0899  hypothetical protein  34.02 
 
 
254 aa  65.1  0.0000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  hitchhiker  0.000145532 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0379  hypothetical protein  36.71 
 
 
237 aa  64.7  0.000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0011  hypothetical protein  32.32 
 
 
236 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1312  hypothetical protein  32.98 
 
 
234 aa  64.3  0.000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0547  hypothetical protein  29.79 
 
 
218 aa  64.7  0.000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.825313  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0581  hypothetical protein  23.39 
 
 
295 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2093  hypothetical protein  22.48 
 
 
295 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.786818  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2705  hypothetical protein  22.48 
 
 
295 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.319747  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4740  protein of unknown function DUF45  21.24 
 
 
318 aa  63.9  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.677282  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1114  hypothetical protein  42.42 
 
 
254 aa  63.9  0.000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0412  protein of unknown function DUF45  21.1 
 
 
292 aa  63.5  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.505198  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0156  hypothetical protein  40.91 
 
 
270 aa  63.9  0.000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>