272 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_1661 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_1661  protein of unknown function DUF45  100 
 
 
244 aa  503  1e-141  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.843742  normal  0.112904 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2109  protein of unknown function DUF45  42.74 
 
 
249 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0788  protein of unknown function DUF45  40.98 
 
 
241 aa  181  7e-45  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0661  zinc protease, putative  44.21 
 
 
243 aa  176  2e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.792264  normal  0.0577046 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0904  hypothetical protein  39.36 
 
 
251 aa  174  9.999999999999999e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1561  zinc protease, putative  36.1 
 
 
244 aa  160  2e-38  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2732  hypothetical protein  36.02 
 
 
240 aa  157  2e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1535  hypothetical protein  37.39 
 
 
238 aa  153  2.9999999999999998e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.714061 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1657  protein of unknown function DUF45  37.34 
 
 
244 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0073  protein of unknown function DUF45  36.43 
 
 
316 aa  146  3e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.658711 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1381  protein of unknown function DUF45  37.12 
 
 
229 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.263783  normal  0.318048 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2744  hypothetical protein  30.45 
 
 
252 aa  123  3e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0036  protein of unknown function DUF45  29.69 
 
 
262 aa  122  4e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2267  hypothetical protein  34.43 
 
 
217 aa  121  8e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.083076  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0220  hypothetical protein  29.86 
 
 
240 aa  115  8.999999999999998e-25  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0151  hypothetical protein  29.07 
 
 
240 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_159  hypothetical protein  27.93 
 
 
240 aa  111  8.000000000000001e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.363835  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1772  hypothetical protein  35.81 
 
 
232 aa  108  1e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.236777  normal  0.415522 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0402  hypothetical protein  32.58 
 
 
245 aa  105  6e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.95027  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0542  hypothetical protein  29.06 
 
 
243 aa  105  7e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2107  hypothetical protein  31.6 
 
 
240 aa  104  1e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0373  protein of unknown function DUF45  28.69 
 
 
242 aa  102  6e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0100  protein of unknown function DUF45  33.33 
 
 
241 aa  101  1e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1084  protein of unknown function DUF45  35.71 
 
 
221 aa  100  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0413  hypothetical protein  45.1 
 
 
249 aa  100  2e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2928  hypothetical protein  33.5 
 
 
219 aa  100  2e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2307  protein of unknown function DUF45  29.15 
 
 
244 aa  99  6e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2293  hypothetical protein  33.5 
 
 
227 aa  99  6e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1858  protein of unknown function DUF45  28.11 
 
 
226 aa  98.2  1e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000912457  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1102  zinc metalloprotease  29.63 
 
 
243 aa  97.4  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00846989  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4201  protein of unknown function DUF45  28.82 
 
 
245 aa  95.5  7e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0094  hypothetical protein  31.46 
 
 
228 aa  94.4  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0875  protein of unknown function DUF45  30.45 
 
 
240 aa  94  2e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1951  hypothetical protein  26.29 
 
 
481 aa  93.2  3e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0982  zinc metallopeptidase-like protein  30.37 
 
 
228 aa  92.8  5e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3354  hypothetical protein  27.47 
 
 
265 aa  92.4  5e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2595  hypothetical protein  22.88 
 
 
238 aa  92.8  5e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.23171  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2113  hypothetical protein  29.03 
 
 
253 aa  91.7  9e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.301869  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2029  hypothetical protein  29.03 
 
 
255 aa  91.7  9e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.611915  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2642  hypothetical protein  30.37 
 
 
228 aa  91.7  9e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0561  protein of unknown function DUF45  28.07 
 
 
211 aa  90.9  2e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1894  hypothetical protein  28.95 
 
 
242 aa  89.4  4e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.470997  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3538  hypothetical protein  28.81 
 
 
239 aa  88.6  8e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.739224  normal  0.0386409 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0807  hypothetical protein  27.31 
 
 
253 aa  88.6  9e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0668  hypothetical protein  27.23 
 
 
251 aa  88.2  1e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0984  zinc metalloprotease  25 
 
 
221 aa  87.8  1e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04470  predicted metal-dependent hydrolase  25.22 
 
 
241 aa  87.4  2e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3143  protein of unknown function DUF45  23.01 
 
 
227 aa  87.4  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0570436  normal  0.976092 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2959  protein of unknown function DUF45  23.01 
 
 
227 aa  87.4  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0379  hypothetical protein  28.04 
 
 
237 aa  87  3e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1480  hypothetical protein  32.88 
 
 
268 aa  86.7  3e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2889  hypothetical protein  26.48 
 
 
261 aa  86.7  3e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.653746  normal  0.363578 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1114  hypothetical protein  26.42 
 
 
254 aa  85.9  5e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1824  hypothetical protein  23.21 
 
 
224 aa  85.5  6e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0843  hypothetical protein  29.02 
 
 
246 aa  85.9  6e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.335069  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0791  hypothetical protein  29.02 
 
 
246 aa  85.9  6e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.371001  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05618  hypothetical protein  29.44 
 
 
226 aa  85.1  9e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2484  hypothetical protein  25 
 
 
245 aa  84.3  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.186682  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2344  hypothetical protein  31.84 
 
 
217 aa  84.3  0.000000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.394808 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1069  hypothetical protein  23.74 
 
 
225 aa  84.7  0.000000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.887273  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0870  protein of unknown function DUF45  22.78 
 
 
224 aa  84.3  0.000000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0260023  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0839  hypothetical protein  30.04 
 
 
237 aa  84.3  0.000000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.243328 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1763  protein of unknown function DUF45  27.62 
 
 
246 aa  84.3  0.000000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1707  hypothetical protein  25.96 
 
 
239 aa  83.2  0.000000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.182955  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3493  hypothetical protein  28.39 
 
 
244 aa  83.2  0.000000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.718444  normal  0.055231 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0056  protein of unknown function DUF45  36.27 
 
 
238 aa  83.6  0.000000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0641  hypothetical protein  24.58 
 
 
236 aa  83.2  0.000000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4297  hypothetical protein  28.14 
 
 
251 aa  82.8  0.000000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1819  hypothetical protein  25.12 
 
 
222 aa  83.2  0.000000000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0949  hypothetical protein  25 
 
 
219 aa  83.2  0.000000000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0658473  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2986  conserved hypothetical protein DUF45  30.49 
 
 
230 aa  82.8  0.000000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0083  hypothetical protein  26.79 
 
 
222 aa  82.8  0.000000000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  decreased coverage  0.000843512  decreased coverage  0.0000753316 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0503  hypothetical protein  21.88 
 
 
224 aa  82.8  0.000000000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1312  hypothetical protein  25.23 
 
 
234 aa  82.4  0.000000000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1837  protein of unknown function DUF45  31.07 
 
 
247 aa  82  0.000000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.37826  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1098  hypothetical protein  27.36 
 
 
222 aa  81.6  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4740  protein of unknown function DUF45  27.23 
 
 
318 aa  81.3  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.677282  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0412  protein of unknown function DUF45  36.84 
 
 
292 aa  80.9  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.505198  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1789  hypothetical protein  26.19 
 
 
238 aa  80.5  0.00000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0604  protein of unknown function DUF45  28.82 
 
 
241 aa  80.9  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.068795 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0397  protein of unknown function DUF45  36.84 
 
 
292 aa  80.9  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.119001  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1339  hypothetical protein  28.65 
 
 
243 aa  80.9  0.00000000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0010  hypothetical protein  29.17 
 
 
270 aa  80.9  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000896967 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0011  hypothetical protein  32.08 
 
 
236 aa  79.7  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0594  hypothetical protein  26.27 
 
 
301 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0521  hypothetical protein  35.96 
 
 
288 aa  79.7  0.00000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0129218 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2274  protein of unknown function DUF45  25.84 
 
 
243 aa  79.3  0.00000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0317  hypothetical protein  26.22 
 
 
235 aa  79.3  0.00000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0431  hypothetical protein  25.45 
 
 
235 aa  79.3  0.00000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0568  protein of unknown function DUF45  27.78 
 
 
241 aa  79  0.00000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.237402 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0947  hypothetical protein  28.5 
 
 
245 aa  79  0.00000000000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  unclonable  0.0000214537 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06805  hypothetical protein  27.23 
 
 
258 aa  78.6  0.00000000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1069  hypothetical protein  23.79 
 
 
223 aa  78.6  0.00000000000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.262175  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2910  hypothetical protein  27.93 
 
 
237 aa  78.6  0.00000000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0431  hypothetical protein  25 
 
 
235 aa  77.8  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00811962  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1260  hypothetical protein  26.84 
 
 
256 aa  78.2  0.0000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.017504 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0384  zinc metalloprotease  26.41 
 
 
235 aa  77.8  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0625718  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0508  hypothetical protein  30.59 
 
 
233 aa  77.8  0.0000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.139012 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0593  hypothetical protein  27.95 
 
 
260 aa  78.2  0.0000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0332404  normal  0.0318611 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3676  hypothetical protein  26.99 
 
 
227 aa  78.2  0.0000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>