263 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_2109 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_2109  protein of unknown function DUF45  100 
 
 		 249 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0904  hypothetical protein  48.57 
 
 		 251 aa  245  4e-64  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1561  zinc protease, putative  49.58 
 
 		 244 aa  241  9e-63  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0661  zinc protease, putative  51.48 
 
 		 243 aa  236  3e-61  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.792264  normal  0.0577046 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1661  protein of unknown function DUF45  42.74 
 
 		 244 aa  196  2.0000000000000003e-49  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.843742  normal  0.112904 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1657  protein of unknown function DUF45  43.44 
 
 		 244 aa  196  2.0000000000000003e-49  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0788  protein of unknown function DUF45  42.44 
 
 		 241 aa  187  2e-46  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1535  hypothetical protein  36.69 
 
 		 238 aa  155  7e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.714061 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0073  protein of unknown function DUF45  32.46 
 
 		 316 aa  144  1e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.658711 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2732  hypothetical protein  34.06 
 
 		 240 aa  142  5e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0875  protein of unknown function DUF45  34.91 
 
 		 240 aa  124  2e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0151  hypothetical protein  29.74 
 
 		 240 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_159  hypothetical protein  29.61 
 
 		 240 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.363835  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1381  protein of unknown function DUF45  32.77 
 
 		 229 aa  107  2e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.263783  normal  0.318048 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2744  hypothetical protein  30.67 
 
 		 252 aa  107  2e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0220  hypothetical protein  30.17 
 
 		 240 aa  106  4e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1772  hypothetical protein  30.74 
 
 		 232 aa  103  2e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.236777  normal  0.415522 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0100  protein of unknown function DUF45  28.45 
 
 		 241 aa  101  1e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2267  hypothetical protein  27.23 
 
 		 217 aa  95.5  6e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.083076  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0402  hypothetical protein  30.53 
 
 		 245 aa  95.5  7e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.95027  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2928  hypothetical protein  30.24 
 
 		 219 aa  94.4  1e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1069  hypothetical protein  31.34 
 
 		 225 aa  95.1  1e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.887273  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0036  protein of unknown function DUF45  26.51 
 
 		 262 aa  95.1  1e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1951  hypothetical protein  28.63 
 
 		 481 aa  93.2  4e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2274  protein of unknown function DUF45  25 
 
 		 243 aa  88.6  9e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2113  hypothetical protein  29.36 
 
 		 253 aa  87  3e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.301869  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2029  hypothetical protein  29.36 
 
 		 255 aa  87  3e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.611915  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0807  hypothetical protein  29.36 
 
 		 253 aa  85.5  6e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1312  hypothetical protein  27.1 
 
 		 234 aa  84.7  0.000000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0317  hypothetical protein  29.91 
 
 		 235 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0379  hypothetical protein  25.99 
 
 		 237 aa  84  0.000000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2910  hypothetical protein  24.09 
 
 		 237 aa  84.3  0.000000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2307  protein of unknown function DUF45  27.63 
 
 		 244 aa  83.2  0.000000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1480  hypothetical protein  27.35 
 
 		 268 aa  83.2  0.000000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3354  hypothetical protein  26.91 
 
 		 265 aa  82.8  0.000000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0503  hypothetical protein  24.54 
 
 		 224 aa  82.4  0.000000000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0309  zinc metalloprotease  28.9 
 
 		 235 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.122687  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04470  predicted metal-dependent hydrolase  26.96 
 
 		 241 aa  81.3  0.00000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2393  hypothetical protein  25.11 
 
 		 244 aa  81.6  0.00000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0369  hypothetical protein  28.44 
 
 		 235 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0384  zinc metalloprotease  28.04 
 
 		 235 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0625718  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1824  hypothetical protein  26.07 
 
 		 224 aa  81.3  0.00000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1789  hypothetical protein  24.89 
 
 		 238 aa  80.5  0.00000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0322  hypothetical protein  28.44 
 
 		 235 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000118894  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0306  zinc metalloprotease  26.89 
 
 		 235 aa  80.1  0.00000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0337  hypothetical protein  28.44 
 
 		 235 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000389941  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0870  protein of unknown function DUF45  24.77 
 
 		 224 aa  80.5  0.00000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0260023  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0431  hypothetical protein  27.36 
 
 		 235 aa  79.7  0.00000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00811962  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0431  hypothetical protein  27.83 
 
 		 235 aa  79.7  0.00000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0547  hypothetical protein  29.19 
 
 		 218 aa  79  0.00000000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.825313  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2293  hypothetical protein  27.31 
 
 		 227 aa  79  0.00000000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2642  hypothetical protein  28.31 
 
 		 228 aa  79  0.00000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0413  hypothetical protein  37.63 
 
 		 249 aa  78.6  0.00000000000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0982  zinc metallopeptidase-like protein  27.85 
 
 		 228 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0373  protein of unknown function DUF45  24.11 
 
 		 242 aa  77  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0542  hypothetical protein  24.29 
 
 		 243 aa  77  0.0000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3952  protein of unknown function DUF45  27.4 
 
 		 252 aa  75.9  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3538  hypothetical protein  28.1 
 
 		 239 aa  75.9  0.0000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.739224  normal  0.0386409 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3235  hypothetical protein  25.45 
 
 		 251 aa  75.5  0.0000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3363  hypothetical protein  28.11 
 
 		 249 aa  75.5  0.0000000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.211491 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0579  protein of unknown function DUF45  29.27 
 
 		 249 aa  75.1  0.0000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.452313  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2986  conserved hypothetical protein DUF45  27.27 
 
 		 230 aa  73.9  0.000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0543  peptidase S26A, signal peptidase I  24.79 
 
 		 236 aa  73.6  0.000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00150578  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3676  hypothetical protein  26.41 
 
 		 227 aa  73.2  0.000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4297  hypothetical protein  35.42 
 
 		 251 aa  72.4  0.000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0641  hypothetical protein  27.39 
 
 		 236 aa  72.4  0.000000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0668  hypothetical protein  25.46 
 
 		 251 aa  72  0.000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0056  protein of unknown function DUF45  30.38 
 
 		 238 aa  72  0.000000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1084  protein of unknown function DUF45  34.34 
 
 		 221 aa  72  0.000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3789  hypothetical protein  25.45 
 
 		 235 aa  72  0.000000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4279  protein of unknown function DUF45  26.73 
 
 		 252 aa  71.6  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0406  hypothetical protein  24.05 
 
 		 257 aa  71.6  0.00000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.317112  normal  0.0115722 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2484  hypothetical protein  23.92 
 
 		 245 aa  70.9  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.186682  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1763  protein of unknown function DUF45  27.15 
 
 		 246 aa  70.9  0.00000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0125  hypothetical protein  28.29 
 
 		 256 aa  70.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.84591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0508  hypothetical protein  26.39 
 
 		 233 aa  70.9  0.00000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.139012 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1894  hypothetical protein  26.97 
 
 		 242 aa  70.1  0.00000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.470997  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1707  hypothetical protein  27.03 
 
 		 239 aa  70.1  0.00000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.182955  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0839  hypothetical protein  26 
 
 		 237 aa  70.5  0.00000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.243328 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0064  hypothetical protein  27.8 
 
 		 278 aa  70.1  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0631  protein of unknown function DUF45  28.36 
 
 		 344 aa  68.9  0.00000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0545956  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0018  hypothetical protein  24.54 
 
 		 254 aa  69.3  0.00000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0071  protein of unknown function DUF45  22.38 
 
 		 223 aa  68.9  0.00000000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0355  hypothetical protein  28.99 
 
 		 279 aa  68.2  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3548  hypothetical protein  24.45 
 
 		 242 aa  68.2  0.0000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.405363  normal  0.224983 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05618  hypothetical protein  24.66 
 
 		 226 aa  68.2  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2255  zinc metalloprotease  22.02 
 
 		 227 aa  68.6  0.0000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1800  protein of unknown function DUF45  27.63 
 
 		 240 aa  68.2  0.0000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.322708  normal  0.410252 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0011  hypothetical protein  34.41 
 
 		 236 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2959  protein of unknown function DUF45  21.46 
 
 		 227 aa  67.4  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3143  protein of unknown function DUF45  21.46 
 
 		 227 aa  67.4  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0570436  normal  0.976092 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1069  hypothetical protein  21.7 
 
 		 223 aa  66.6  0.0000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.262175  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0010  hypothetical protein  26.61 
 
 		 270 aa  67  0.0000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000896967 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2107  hypothetical protein  24.3 
 
 		 240 aa  66.6  0.0000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3493  hypothetical protein  25.22 
 
 		 244 aa  66.2  0.0000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.718444  normal  0.055231 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1260  hypothetical protein  32.79 
 
 		 256 aa  66.2  0.0000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.017504 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0843  hypothetical protein  22.51 
 
 		 246 aa  65.5  0.0000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.335069  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0791  hypothetical protein  22.51 
 
 		 246 aa  65.5  0.0000000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.371001  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1098  hypothetical protein  22.22 
 
 		 222 aa  65.5  0.0000000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0594  hypothetical protein  34 
 
 		 301 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>