185 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_0896 on replicon NC_010508
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_0896  lysine exporter protein LysE/YggA  100 
 
 		 208 aa  397  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4035  lysine exporter protein LysE/YggA  88.94 
 
 		 214 aa  359  2e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.94524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0455  lysine exporter protein LysE/YggA  96.63 
 
 		 208 aa  353  1e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0934  lysine exporter protein LysE/YggA  96.63 
 
 		 208 aa  353  1e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4488  lysine exporter protein LysE/YggA  43.94 
 
 		 206 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5299  lysine exporter protein LysE/YggA  43.43 
 
 		 206 aa  138  7e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1537  LysE family protein  43.07 
 
 		 206 aa  137  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0029  LysE family protein  43.07 
 
 		 206 aa  137  2e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3140  lysine exporter protein LysE/YggA  43.43 
 
 		 206 aa  136  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.466671  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5124  lysine exporter protein LysE/YggA  43.43 
 
 		 206 aa  136  2e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5735  lysine exporter protein LysE/YggA  43.43 
 
 		 206 aa  136  2e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.289905 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1182  LysE family protein  43.07 
 
 		 206 aa  137  2e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.899031  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1462  LysE family protein  43.07 
 
 		 206 aa  137  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0049  LysE family protein  43.07 
 
 		 206 aa  137  2e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.751253  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0035  LysE family translocator protein  43.07 
 
 		 206 aa  137  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0035  LysE family protein  43.07 
 
 		 206 aa  137  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.780183  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0033  LysE family protein  42.57 
 
 		 206 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3475  L-lysine exporter, putative  42.03 
 
 		 216 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5006  lysine exporter protein LysE/YggA  41.58 
 
 		 206 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3147  lysine exporter protein LysE/YggA  41.58 
 
 		 206 aa  132  3e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.294591  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1506  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  40.82 
 
 		 205 aa  131  6e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2777  amino acid transporter LysE  39.11 
 
 		 212 aa  129  5.0000000000000004e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2359  lysine exporter protein LysE/YggA  40.61 
 
 		 206 aa  128  6e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.16555  normal  0.148285 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0916  amino acid transporter LysE  38.61 
 
 		 204 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4058  lysine exporter protein LysE/YggA  38.78 
 
 		 200 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0394  lysine exporter protein LysE/YggA  42.56 
 
 		 196 aa  127  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3748  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  40.21 
 
 		 201 aa  126  2.0000000000000002e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0955  lysine exporter protein LysE/YggA  38.61 
 
 		 199 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.599667  normal  0.584278 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4472  lysine exporter protein LysE/YggA  38.24 
 
 		 199 aa  125  3e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.301556 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1830  lysine exporter protein LysE/YggA  40.51 
 
 		 204 aa  125  5e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000951158 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2988  L-lysine exporter, putative  39.29 
 
 		 208 aa  125  5e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4362  transporter, LysE family  38.38 
 
 		 200 aa  124  1e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3446  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  41.18 
 
 		 205 aa  124  1e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2773  lysine exporter protein LysE/YggA  41.03 
 
 		 210 aa  124  1e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0413  CmeB  35.92 
 
 		 207 aa  124  1e-27  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56770  putative transporter  42.21 
 
 		 200 aa  123  2e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0982  lysine exporter protein LysE/YggA  38.19 
 
 		 199 aa  123  2e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000248105 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2963  basic amino acid exporter LysE  39.8 
 
 		 205 aa  122  3e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21230  lysine efflux permease  43.59 
 
 		 205 aa  122  4e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0915178 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4485  lysine exporter protein LysE/YggA  36.18 
 
 		 200 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.105145 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2011  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.97 
 
 		 213 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2865  L-lysine exporter, putative  37 
 
 		 206 aa  119  3e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2415  lysine exporter protein LysE/YggA  37.37 
 
 		 204 aa  119  3e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.33094  hitchhiker  0.00103645 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2593  lysine exporter protein LysE/YggA  37.5 
 
 		 205 aa  119  3e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000430755  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0385  hypothetical protein  40.1 
 
 		 212 aa  119  3.9999999999999996e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.394901 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1960  lysine exporter protein LysE/YggA  35.08 
 
 		 197 aa  119  3.9999999999999996e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1789  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.5 
 
 		 205 aa  118  6e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000102829  hitchhiker  0.000000000101209 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2670  lysine exporter protein LysE/YggA  37.5 
 
 		 205 aa  118  6e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000865788  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2555  lysine exporter protein LysE/YggA  37.5 
 
 		 205 aa  118  7e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000168732  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4936  putative transporter  39.8 
 
 		 200 aa  118  7e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.79735  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2343  lysine exporter protein LysE/YggA  36.87 
 
 		 204 aa  118  7.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.581715  hitchhiker  0.000000535695 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1699  lysine exporter protein LysE/YggA  37.37 
 
 		 213 aa  118  7.999999999999999e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.333091  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5931  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  41.44 
 
 		 227 aa  117  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0411323 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1653  lysine exporter protein LysE/YggA  35.86 
 
 		 204 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.255522  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1703  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  39.49 
 
 		 213 aa  116  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.110191  normal  0.952873 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0604  lysine exporter protein LysE/YggA  36.73 
 
 		 200 aa  115  3e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.622207  normal  0.447657 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1651  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  42.35 
 
 		 219 aa  115  5e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.302942  normal  0.115475 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0310  lysine exporter protein LysE/YggA  39.27 
 
 		 202 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0657  lysine exporter protein LysE/YggA  35.9 
 
 		 203 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.925476  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2975  lysine exporter protein LysE/YggA  35.15 
 
 		 202 aa  113  2.0000000000000002e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.967667  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4248  hypothetical protein  40.8 
 
 		 209 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.142678 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2024  hypothetical protein  34.18 
 
 		 202 aa  112  6e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.806346  normal  0.294176 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2243  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  39.8 
 
 		 208 aa  111  7.000000000000001e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.229976  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3862  putative transporter  37.31 
 
 		 216 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1890  lysine exporter protein LysE/YggA  37.44 
 
 		 209 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.34738  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3408  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  39.06 
 
 		 217 aa  110  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.554507  normal  0.0106718 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2143  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.38 
 
 		 202 aa  109  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.281653  normal  0.178188 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3927  arginine exporter protein  34.5 
 
 		 205 aa  109  3e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.481327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12017  integral membrane protein  36.73 
 
 		 199 aa  109  3e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0855  arginine exporter protein  37.06 
 
 		 205 aa  109  4.0000000000000004e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.984565  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3649  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.84 
 
 		 207 aa  108  4.0000000000000004e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2124  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.27 
 
 		 209 aa  108  6e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3694  lysine exporter protein LysE/YggA  39.47 
 
 		 216 aa  108  6e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.095431  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0270  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.83 
 
 		 196 aa  108  6e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.440552 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0557  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.33 
 
 		 204 aa  107  1e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4177  lysine exporter protein LysE/YggA  37.56 
 
 		 208 aa  107  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00817144  normal  0.249821 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1845  lysine exporter protein LysE/YggA  35.53 
 
 		 214 aa  107  1e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.142006  normal  0.0992171 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0373  lysine exporter protein LysE/YggA  37.89 
 
 		 202 aa  107  1e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0125208 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3686  arginine exporter protein  36.5 
 
 		 204 aa  106  2e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1449  LysE family translocator protein  30.65 
 
 		 215 aa  107  2e-22  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0643265  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002476  lysine efflux permease  34.2 
 
 		 209 aa  106  3e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1975  lysine exporter protein LysE/YggA  32.83 
 
 		 204 aa  106  3e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0270358  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0033  LysE family protein  32.63 
 
 		 211 aa  105  4e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4165  lysine exporter protein LysE/YggA  35.71 
 
 		 203 aa  105  5e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.547007  normal  0.28578 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2174  lysine exporter protein LysE/YggA  34.9 
 
 		 203 aa  105  5e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0221131  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2387  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.85 
 
 		 202 aa  105  6e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00462504  hitchhiker  0.00355468 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2433  lysine exporter protein (LysE/YggA)  35.53 
 
 		 202 aa  104  1e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.274749  hitchhiker  0.000341611 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4529  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38 
 
 		 201 aa  103  1e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4336  lysine exporter protein LysE/YggA  37.24 
 
 		 212 aa  103  2e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.16627  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4370  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.2 
 
 		 211 aa  102  3e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4336  lysine exporter protein LysE/YggA  36.46 
 
 		 219 aa  102  6e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1086  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.38 
 
 		 211 aa  101  7e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.103824  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4432  lysine exporter protein LysE/YggA  33.33 
 
 		 200 aa  100  1e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1574  lysine exporter protein LysE/YggA  34.01 
 
 		 220 aa  100  1e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.411149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3122  lysine exporter protein LysE/YggA  41.15 
 
 		 199 aa  99.8  3e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.77034  hitchhiker  0.00328484 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20760  L-lysine exporter  35.96 
 
 		 204 aa  99.8  3e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3819  arginine exporter protein  37.06 
 
 		 205 aa  99.8  3e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.771227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0852  arginine exporter protein  37.06 
 
 		 205 aa  99.8  3e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0116033  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0674  amino acid transporter LysE  38.24 
 
 		 204 aa  98.6  5e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3883  arginine exporter protein  35.5 
 
 		 204 aa  98.6  5e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>