48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_4174 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_4174  putative VGR-related protein  100 
 
 		 197 aa  402  1e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.970619 
 
 
-
 
NC_003296  RS03738  putative VGR-related protein  52.28 
 
 		 957 aa  181  4.0000000000000006e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.198638 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4974  Rhs element Vgr protein  42.71 
 
 		 958 aa  150  1e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0626  Rhs element Vgr protein  46.19 
 
 		 889 aa  137  1e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.160391 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2559  type VI secretion system Vgr family protein  35.83 
 
 		 895 aa  79  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2668  type VI secretion system Vgr family protein  35.83 
 
 		 895 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2028  Rhs element Vgr protein  35.83 
 
 		 895 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.14177  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2639  Rhs element Vgr protein  35.83 
 
 		 895 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2686  Rhs element Vgr protein  35 
 
 		 891 aa  75.9  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.308688  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2648  Rhs element Vgr protein  36.13 
 
 		 1063 aa  68.6  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0459  Rhs element Vgr protein  36.13 
 
 		 1063 aa  68.6  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.139035  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0434  type VI secretion system Vgr family protein  35.29 
 
 		 1063 aa  68.2  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000011014 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2142  Rhs element Vgr protein  42.11 
 
 		 961 aa  68.2  0.00000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3549  Rhs element Vgr protein  33.33 
 
 		 1074 aa  67.8  0.00000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.321828 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0383  type VI secretion system Vgr family protein  34.45 
 
 		 1057 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0367  Rhs element Vgr protein  34.71 
 
 		 1057 aa  65.1  0.0000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0014  hypothetical protein  40.79 
 
 		 248 aa  65.1  0.0000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.515774  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0352  type VI secretion system Vgr family protein  33.61 
 
 		 1059 aa  65.1  0.0000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0475  Rhs element Vgr protein  34.07 
 
 		 853 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.494661  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2922  type VI secretion system Vgr family protein  38.1 
 
 		 853 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.228171  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0410  type VI secretion system Vgr family protein  35.16 
 
 		 853 aa  62  0.000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6106  type VI secretion system Vgr family protein  33.11 
 
 		 952 aa  61.2  0.000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.894358  normal  0.984753 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3327  type VI secretion system Vgr family protein  40.85 
 
 		 850 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.702291 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4023  Rhs element Vgr protein  41.79 
 
 		 923 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.78403 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0933  Rhs element Vgr protein, putative  42.11 
 
 		 780 aa  58.5  0.00000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.218046  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1932  type VI secretion system Vgr family protein  33.11 
 
 		 918 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2274  Rhs element Vgr protein  32.65 
 
 		 871 aa  56.6  0.0000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5730  type VI secretion system Vgr family protein  47.62 
 
 		 868 aa  57  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0627617  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1531  Rhs element Vgr protein, putative  39.47 
 
 		 780 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.398232  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2999  Rhs element Vgr protein  32.67 
 
 		 910 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.228485 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3567  Rhs element Vgr protein  39.13 
 
 		 892 aa  53.9  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3859  type VI secretion system Vgr family protein  27.22 
 
 		 901 aa  52.4  0.000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0204  Rhs element Vgr protein  28.75 
 
 		 869 aa  52  0.000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2254  Rhs element Vgr protein  33.8 
 
 		 875 aa  50.8  0.00001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2595  Rhs element Vgr protein  27.52 
 
 		 912 aa  50.1  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.43186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6418  Rhs element Vgr protein  31.25 
 
 		 956 aa  50.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.149183 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1411  Rhs element Vgr protein  31.25 
 
 		 956 aa  50.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3777  type VI secretion system Vgr family protein  37.5 
 
 		 850 aa  47.4  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.028091 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6429  type VI secretion system Vgr family protein  36.46 
 
 		 955 aa  47.8  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.727988 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3746  Rhs element Vgr protein  37.5 
 
 		 850 aa  45.8  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0271118 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4617  Rhs element Vgr protein  37.5 
 
 		 850 aa  45.8  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.761294  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3130  type VI secretion system Vgr family protein  25 
 
 		 835 aa  45.4  0.0005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44900  hypothetical protein  23.08 
 
 		 842 aa  45.1  0.0007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0151345  normal  0.422437 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7615  Rhs element Vgr protein  24.27 
 
 		 984 aa  42.7  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.874813 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1248  hypothetical protein  25.83 
 
 		 1019 aa  42  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.60494  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03220  hypothetical protein  25.83 
 
 		 1019 aa  42  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000195826 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5197  type VI secretion system Vgr family protein  37.5 
 
 		 837 aa  42  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0918871 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0394  Rhs element Vgr protein  31.25 
 
 		 811 aa  42  0.006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.787309 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>