206 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_II1795 on replicon NC_007650
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007650  BTH_II1795  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  100 
 
 
181 aa  373  1e-102  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3556  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  71.43 
 
 
557 aa  100  9e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.207193  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3537  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  71.43 
 
 
557 aa  100  9e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1106  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  69.84 
 
 
557 aa  98.6  4e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.422125  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0594  Protein of unknown function DUF2236  59.26 
 
 
325 aa  98.2  5e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0775081  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3563  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  69.84 
 
 
557 aa  98.2  6e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0474  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  65.08 
 
 
557 aa  96.7  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3482  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  65.08 
 
 
557 aa  96.3  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0194948  hitchhiker  0.00229302 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7872  hypothetical protein  59.26 
 
 
347 aa  96.7  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.831106  normal  0.186393 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0451  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  66.67 
 
 
557 aa  95.5  4e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.321292  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3734  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  68.25 
 
 
560 aa  95.1  5e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.862355  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0476  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  66.67 
 
 
557 aa  94.4  7e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0518  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  65.08 
 
 
557 aa  93.6  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3633  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  65.08 
 
 
557 aa  92.8  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.956552  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0064  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  65.08 
 
 
557 aa  93.6  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2848  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  65.08 
 
 
557 aa  92.8  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0546  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  65.08 
 
 
557 aa  93.6  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1344  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  63.64 
 
 
572 aa  92.4  3e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.77905 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4074  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  63.49 
 
 
561 aa  92.4  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2685  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  60.32 
 
 
557 aa  90.9  9e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0867888  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4746  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  65.08 
 
 
563 aa  88.2  6e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3797  AMP-dependent synthetase and ligase  66.13 
 
 
566 aa  88.2  6e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.589487 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1323  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  63.49 
 
 
561 aa  87.4  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3104  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  61.9 
 
 
569 aa  86.3  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.219632  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2739  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  61.9 
 
 
569 aa  86.7  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6801  AMP-dependent synthetase and ligase  61.9 
 
 
540 aa  85.9  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.867252  normal  0.1235 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4543  AMP-dependent synthetase and ligase  62.71 
 
 
562 aa  84.7  6e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0952  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  60.32 
 
 
563 aa  83.6  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.412461  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2684  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  60.32 
 
 
567 aa  83.6  0.000000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.503393 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0394  AMP-dependent synthetase and ligase  58.06 
 
 
559 aa  82.8  0.000000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2857  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  57.14 
 
 
569 aa  80.5  0.00000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3077  AMP-dependent synthetase and ligase  53.97 
 
 
553 aa  78.2  0.00000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2994  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  55.56 
 
 
560 aa  78.2  0.00000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.562113  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0946  AMP-dependent synthetase and ligase  59.68 
 
 
559 aa  77.4  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3752  AMP-dependent synthetase and ligase  52.46 
 
 
557 aa  77  0.0000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.419437  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3950  AMP-dependent synthetase and ligase  56.45 
 
 
559 aa  77  0.0000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0302713  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3148  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  55.56 
 
 
560 aa  76.6  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3299  AMP-dependent synthetase and ligase  54.84 
 
 
559 aa  75.9  0.0000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2551  AMP-dependent synthetase and ligase  53.23 
 
 
559 aa  75.1  0.0000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.083055  normal  0.0774583 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4574  AMP-dependent synthetase and ligase  53.23 
 
 
561 aa  70.1  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0545  AMP-dependent synthetase and ligase  49.21 
 
 
561 aa  68.6  0.00000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1511  hypothetical protein  46.03 
 
 
569 aa  67.8  0.00000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1472  hypothetical protein  46.03 
 
 
569 aa  67.8  0.00000000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6185  AMP-dependent synthetase and ligase  50 
 
 
574 aa  67.4  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1831  putative long-chain fatty acyl CoA ligase  42.19 
 
 
558 aa  65.5  0.0000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.149833  normal  0.317759 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3572  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase protein  42.86 
 
 
557 aa  65.1  0.0000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0424  AMP-dependent synthetase and ligase  47.46 
 
 
561 aa  64.3  0.0000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0428  AMP-dependent synthetase and ligase  45.16 
 
 
579 aa  64.3  0.0000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0627658  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5859  AMP-dependent synthetase and ligase  44.78 
 
 
567 aa  63.9  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01137  acyl-CoA synthetase (long-chain-fatty-acid-CoA ligase), acyl-adenylate activating enzyme  46.03 
 
 
550 aa  63.9  0.000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00114592  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1704  AMP-dependent synthetase and ligase  52.94 
 
 
599 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.180137  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1936  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  41.79 
 
 
572 aa  62.8  0.000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.451048  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4225  AMP-dependent synthetase and ligase  46.03 
 
 
561 aa  62.4  0.000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.689308 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4195  AMP-dependent synthetase and ligase  46.03 
 
 
561 aa  62.8  0.000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0110  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  42.62 
 
 
566 aa  62  0.000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.963067 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0559  AMP-dependent synthetase and ligase  43.28 
 
 
584 aa  62  0.000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.128568  normal  0.0101093 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2760  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  42.19 
 
 
573 aa  62  0.000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000411499  hitchhiker  0.00194378 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0532  AMP-dependent synthetase and ligase  46.03 
 
 
561 aa  61.6  0.000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0516  AMP-dependent synthetase and ligase  46.03 
 
 
561 aa  61.6  0.000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0152867 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0413  AMP-dependent synthetase and ligase  40.91 
 
 
579 aa  61.6  0.000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00496898 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0124  AMP-dependent synthetase and ligase  42.86 
 
 
566 aa  60.8  0.000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3249  AMP-dependent synthetase and ligase  44.07 
 
 
572 aa  60.5  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0843615 
 
 
-
 
NC_004310  BR0289  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  46.03 
 
 
554 aa  60.8  0.00000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.883702  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1672  AMP-dependent synthetase and ligase  37.65 
 
 
601 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.455088 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1993  AMP-dependent synthetase and ligase  41.79 
 
 
567 aa  60.5  0.00000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.196682  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1553  AMP-dependent synthetase and ligase  47.27 
 
 
553 aa  59.3  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0143852  hitchhiker  0.00793845 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0303  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  44.44 
 
 
581 aa  59.3  0.00000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.993767  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0138  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  42.03 
 
 
566 aa  59.3  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.938727  normal  0.187232 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2409  AMP-dependent synthetase and ligase  39.68 
 
 
554 aa  59.3  0.00000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0704611  hitchhiker  0.000109312 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0144  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  43.48 
 
 
566 aa  58.9  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2231  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  40.3 
 
 
572 aa  58.5  0.00000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00224599  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2375  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  41.79 
 
 
572 aa  58.2  0.00000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1961  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  41.27 
 
 
561 aa  57.8  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0286809  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3775  AMP-dependent synthetase and ligase  41.27 
 
 
564 aa  57.8  0.00000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1498  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  41.27 
 
 
561 aa  57.8  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0422042  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2448  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  41.27 
 
 
555 aa  57.8  0.00000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000160034  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1314  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  41.27 
 
 
561 aa  57.8  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000394382  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2018  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  41.27 
 
 
561 aa  57.8  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.456222  normal  0.253755 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1958  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  41.27 
 
 
561 aa  57.8  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0509331  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0373  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.63 
 
 
581 aa  57.8  0.00000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.826783  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01775  acyl-CoA synthase  39.68 
 
 
561 aa  57.4  0.0000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2031  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.68 
 
 
561 aa  57.4  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2532  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.68 
 
 
561 aa  57.4  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0895322  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2778  putative long chain fatty-acid CoA ligase(long- chain acyl-CoA synthetase)  39.47 
 
 
604 aa  57  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.422591  normal  0.203216 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1190  AMP-dependent synthetase and ligase  40.62 
 
 
565 aa  57  0.0000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0730662  normal  0.324489 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01763  hypothetical protein  39.68 
 
 
561 aa  57.4  0.0000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1893  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.68 
 
 
561 aa  57.4  0.0000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2065  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.68 
 
 
561 aa  57.4  0.0000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4769  AMP-dependent synthetase and ligase  49.09 
 
 
563 aa  57.4  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1383  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.68 
 
 
561 aa  57.4  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0924473  normal  0.838722 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1189  AMP-dependent synthetase and ligase  40.62 
 
 
566 aa  57  0.0000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.503823  normal  0.180474 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1838  AMP-dependent synthetase and ligase  38.1 
 
 
583 aa  56.2  0.0000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0025116  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2523  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.68 
 
 
557 aa  55.8  0.0000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00313327  normal  0.944689 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3834  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.1 
 
 
563 aa  55.8  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2014  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.68 
 
 
562 aa  56.2  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00000000277435  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2125  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.68 
 
 
562 aa  56.2  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0959  AMP-dependent synthetase and ligase  44.07 
 
 
558 aa  56.2  0.0000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.336851  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1828  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.1 
 
 
583 aa  56.2  0.0000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.325094 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2010  AMP-dependent synthetase and ligase  38.81 
 
 
569 aa  55.8  0.0000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.982062  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2403  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.46 
 
 
577 aa  55.1  0.0000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000565226  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>