93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BOV_A0853 on replicon NC_009504
Organism: Brucella ovis ATCC 25840



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009504  BOV_A0853  hypothetical protein  100 
 
 		 242 aa  477  1e-134  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.904514  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0910  hypothetical protein  99.17 
 
 		 242 aa  471  1e-132  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1457  hypothetical protein  85.54 
 
 		 242 aa  419  1e-116  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3800  hypothetical protein  64.46 
 
 		 242 aa  323  1e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.310543  normal  0.622106 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4129  hypothetical protein  64.05 
 
 		 242 aa  322  3e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.530241  normal  0.345013 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0240  hypothetical protein  38.93 
 
 		 247 aa  171  9e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1090  hypothetical protein  39.47 
 
 		 247 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.532111  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2233  hypothetical protein  38.17 
 
 		 251 aa  160  1e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1414  hypothetical protein  37.86 
 
 		 247 aa  159  5e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000071043  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2926  hypothetical protein  36.51 
 
 		 247 aa  156  2e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2486  hypothetical protein  33.05 
 
 		 243 aa  147  1.0000000000000001e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1896  hypothetical protein  37.67 
 
 		 247 aa  139  3.9999999999999997e-32  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.334422  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0798  hypothetical protein  33.33 
 
 		 246 aa  119  3.9999999999999996e-26  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00623177  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0840  hypothetical protein  34.02 
 
 		 241 aa  118  9.999999999999999e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.352825 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3081  hypothetical protein  39.27 
 
 		 246 aa  115  8.999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.228654 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3997  hypothetical protein  35 
 
 		 254 aa  110  2.0000000000000002e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0911  hypothetical protein  33.18 
 
 		 255 aa  107  2e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.194278  normal  0.704282 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2046  hypothetical protein  34.71 
 
 		 252 aa  105  6e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.820956  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0576  hypothetical protein  35.85 
 
 		 282 aa  103  2e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.495615 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2854  hypothetical protein  37.73 
 
 		 250 aa  100  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.533045 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05060  hypothetical protein  35.43 
 
 		 243 aa  99  6e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34960  hypothetical protein  37.29 
 
 		 236 aa  99  7e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0545229  normal  0.520558 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5130  hypothetical protein  34.06 
 
 		 245 aa  97.4  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2645  hypothetical protein  33.33 
 
 		 276 aa  95.9  6e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.741069  normal  0.224489 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0681  hypothetical protein  30 
 
 		 253 aa  95.1  8e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2514  hypothetical protein  32.88 
 
 		 274 aa  93.6  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.581758 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2756  hypothetical protein  30.7 
 
 		 270 aa  92.8  4e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0332129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0079  SIS (sugar isomerase) phosphosugar binding domain-containing protein  25.45 
 
 		 263 aa  92.8  5e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.460323 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5647  hypothetical protein  33.94 
 
 		 257 aa  87  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.193536  normal  0.200445 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0562  hypothetical protein  33.47 
 
 		 277 aa  84.7  0.000000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.1566  normal  0.893078 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0224  hypothetical protein  21.66 
 
 		 240 aa  64.7  0.000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1355  transcriptional regulator  29.25 
 
 		 273 aa  50.1  0.00003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.906845  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1044  RpiR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 338 aa  49.7  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.408154  normal  0.734102 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02633  DNA-binding transcriptional regulator HexR  28.78 
 
 		 284 aa  49.7  0.00004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2049  DNA-binding transcriptional regulator HexR  27.86 
 
 		 284 aa  49.3  0.00005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000665792  normal  0.388652 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0750  RpiR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 281 aa  49.3  0.00006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.414867  normal  0.513903 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0179  RpiR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 279 aa  48.9  0.00007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.912597  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0182  RpiR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 279 aa  48.9  0.00007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2080  DNA-binding transcriptional regulator HexR  27.86 
 
 		 286 aa  48.5  0.00008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00496237  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0696  RpiR family transcriptional regulator  25.76 
 
 		 289 aa  48.1  0.0001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000925251  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2490  DNA-binding transcriptional regulator HexR  27.86 
 
 		 284 aa  48.5  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0694  RpiR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 281 aa  47.8  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00592918 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0672  transcriptional regulator, RpiR family  30.17 
 
 		 281 aa  47.8  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.654483  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003760  glucose repressor HexR for Entner-Doudoroff pathway RpiR family  28.06 
 
 		 259 aa  47.4  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.192568  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2069  DNA-binding transcriptional regulator HexR  27.14 
 
 		 284 aa  47.4  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000131353  hitchhiker  0.000414379 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1865  DNA-binding transcriptional regulator HexR  27.14 
 
 		 284 aa  47.4  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0718  DNA-binding transcriptional regulator HexR  28.06 
 
 		 284 aa  47.4  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1813  DNA-binding transcriptional regulator HexR  27.14 
 
 		 284 aa  47.4  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000867158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2174  DNA-binding transcriptional regulator HexR  27.14 
 
 		 284 aa  47  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.271639  normal  0.12603 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2255  DNA-binding transcriptional regulator HexR  27.14 
 
 		 284 aa  47  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000281724  hitchhiker  0.00000550313 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1928  DNA-binding transcriptional regulator HexR  27.14 
 
 		 284 aa  47  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0915843  normal  0.285781 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2129  DNA-binding transcriptional regulator HexR  27.14 
 
 		 284 aa  47  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00123484  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2047  DNA-binding transcriptional regulator HexR  27.14 
 
 		 284 aa  47  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.20632 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4528  DNA-binding transcriptional regulator HexR  27.14 
 
 		 284 aa  47  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2152  DNA-binding transcriptional regulator HexR  27.14 
 
 		 284 aa  47  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.284863  normal  0.555524 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2242  DNA-binding transcriptional regulator HexR  27.14 
 
 		 284 aa  47  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0731  RpiR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 287 aa  46.6  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1891  DNA-binding transcriptional regulator HexR  26.43 
 
 		 284 aa  45.8  0.0005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2540  DNA-binding transcriptional regulator HexR  26.43 
 
 		 284 aa  46.2  0.0005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0495107  normal  0.0835263 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3388  RpiR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 284 aa  45.8  0.0006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0207  phosphoheptose isomerase  27.49 
 
 		 216 aa  45.8  0.0006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0875  putative transcriptional regulator, RpiR family  26.95 
 
 		 287 aa  45.8  0.0007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1778  RpiR family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 281 aa  45.1  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.141472  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0917  putative transcriptional regulator, RpiR family  27.66 
 
 		 287 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.47337e-41 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0912  RpiR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 287 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0782  RpiR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 287 aa  45.1  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0821  RpiR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 287 aa  45.1  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1080  RpiR family transcriptional regulator  28.31 
 
 		 318 aa  45.1  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0801962  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0731  RpiR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 287 aa  45.1  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0717  RpiR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 287 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0986  putative transcriptional regulator, RpiR family  27.66 
 
 		 287 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2468  RpiR family transcriptional regulator  26.62 
 
 		 296 aa  45.1  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.899807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1082  DNA-binding transcriptional regulator HexR  27.86 
 
 		 288 aa  44.3  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000474941  unclonable  0.00000000000467577 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3330  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 616 aa  44.3  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1025  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  28.14 
 
 		 638 aa  44.3  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.745776  normal  0.175715 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0652  RpiR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 281 aa  43.5  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.334737  normal  0.0629992 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2023  DNA-binding transcriptional regulator HexR  27.14 
 
 		 289 aa  43.5  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.197371  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2413  DNA-binding transcriptional regulator HexR  27.44 
 
 		 301 aa  43.5  0.003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000012699  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2135  DNA-binding transcriptional regulator HexR  27.44 
 
 		 301 aa  43.5  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1547  RpiR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 296 aa  43.1  0.004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3371  transcriptional regulator, RpiR family  29.47 
 
 		 281 aa  43.1  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0964604  hitchhiker  0.00000000707391 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2769  DNA-binding transcriptional regulator HexR  27.34 
 
 		 290 aa  42.7  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0149863  hitchhiker  0.00789418 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5603  sugar isomerase (SIS)  27.39 
 
 		 208 aa  43.1  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.23973  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27270  DNA-binding transcriptional regulator HexR  25.9 
 
 		 289 aa  43.1  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4460  putative transcriptional regulator, RpiR family  26.24 
 
 		 287 aa  42.7  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.857974 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35980  transcriptional regulator, RpiR family  25.53 
 
 		 333 aa  42.7  0.006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.309329  normal  0.261129 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2137  DNA-binding transcriptional regulator HexR  27.34 
 
 		 289 aa  42.7  0.006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00439922  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0898  HTH-type transcriptional regulator, rpiR family  23.78 
 
 		 292 aa  42.4  0.006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.679683  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3454  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 638 aa  42.4  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0454105  normal  0.179776 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0625  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 639 aa  42.4  0.007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2245  DNA-binding transcriptional regulator HexR  26.62 
 
 		 289 aa  42  0.009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2115  DNA-binding transcriptional regulator HexR  26.62 
 
 		 308 aa  42  0.009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0588  RpiR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 273 aa  42  0.01  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.189062  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>