31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_0079 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009954  Cmaq_0079  SIS (sugar isomerase) phosphosugar binding domain-containing protein  100 
 
 
263 aa  541  1e-153  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.460323 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0681  hypothetical protein  34.82 
 
 
253 aa  171  1e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0911  hypothetical protein  38.01 
 
 
255 aa  153  2e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.194278  normal  0.704282 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2514  hypothetical protein  35.94 
 
 
274 aa  147  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.581758 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2756  hypothetical protein  36.41 
 
 
270 aa  144  1e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0332129  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0576  hypothetical protein  34.68 
 
 
282 aa  137  2e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.495615 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1090  hypothetical protein  32.74 
 
 
247 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.532111  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2486  hypothetical protein  30.77 
 
 
243 aa  119  6e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2645  hypothetical protein  36.32 
 
 
276 aa  117  3e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.741069  normal  0.224489 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0562  hypothetical protein  31.65 
 
 
277 aa  112  5e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.1566  normal  0.893078 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1896  hypothetical protein  28.19 
 
 
247 aa  107  2e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.334422  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0798  hypothetical protein  28.92 
 
 
246 aa  106  3e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00623177  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2046  hypothetical protein  29.07 
 
 
252 aa  99  7e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.820956  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0240  hypothetical protein  29.46 
 
 
247 aa  98.6  9e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05060  hypothetical protein  29.33 
 
 
243 aa  96.3  5e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2854  hypothetical protein  29.3 
 
 
250 aa  95.9  6e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.533045 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3997  hypothetical protein  30.43 
 
 
254 aa  95.5  7e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1457  hypothetical protein  27.59 
 
 
242 aa  94  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5647  hypothetical protein  28.39 
 
 
257 aa  92.4  6e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.193536  normal  0.200445 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0840  hypothetical protein  29.07 
 
 
241 aa  92  8e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.352825 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1414  hypothetical protein  27.16 
 
 
247 aa  88.6  1e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000071043  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2926  hypothetical protein  25.91 
 
 
247 aa  87.8  2e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4129  hypothetical protein  27.88 
 
 
242 aa  84.7  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.530241  normal  0.345013 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0910  hypothetical protein  25 
 
 
242 aa  81.6  0.00000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2233  hypothetical protein  26.43 
 
 
251 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3800  hypothetical protein  25.64 
 
 
242 aa  80.1  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.310543  normal  0.622106 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0853  hypothetical protein  25.45 
 
 
242 aa  79.3  0.00000000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.904514  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34960  hypothetical protein  32.13 
 
 
236 aa  70.9  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0545229  normal  0.520558 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3081  hypothetical protein  26.25 
 
 
246 aa  69.7  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.228654 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5130  hypothetical protein  22.69 
 
 
245 aa  62.8  0.000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0224  hypothetical protein  24.29 
 
 
240 aa  58.2  0.0000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>