43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_0562 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008578  Acel_0562  hypothetical protein  100 
 
 
277 aa  549  1e-155  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.1566  normal  0.893078 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0911  hypothetical protein  35.83 
 
 
255 aa  154  1e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.194278  normal  0.704282 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0576  hypothetical protein  39.53 
 
 
282 aa  135  7.000000000000001e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.495615 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2756  hypothetical protein  37.23 
 
 
270 aa  130  3e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0332129  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2514  hypothetical protein  36.55 
 
 
274 aa  130  3e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.581758 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1090  hypothetical protein  32.31 
 
 
247 aa  123  3e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.532111  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2233  hypothetical protein  32.41 
 
 
251 aa  117  3e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0681  hypothetical protein  29.79 
 
 
253 aa  115  5e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1896  hypothetical protein  32.54 
 
 
247 aa  114  2.0000000000000002e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.334422  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0079  SIS (sugar isomerase) phosphosugar binding domain-containing protein  31.65 
 
 
263 aa  112  5e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.460323 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0798  hypothetical protein  33.17 
 
 
246 aa  111  1.0000000000000001e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00623177  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2926  hypothetical protein  28.34 
 
 
247 aa  108  8.000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2645  hypothetical protein  32.8 
 
 
276 aa  106  3e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.741069  normal  0.224489 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1414  hypothetical protein  28.45 
 
 
247 aa  100  3e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000071043  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05060  hypothetical protein  39.62 
 
 
243 aa  96.7  3e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0840  hypothetical protein  34.42 
 
 
241 aa  95.1  1e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.352825 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2486  hypothetical protein  26.34 
 
 
243 aa  93.2  4e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4129  hypothetical protein  35.43 
 
 
242 aa  91.3  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.530241  normal  0.345013 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3800  hypothetical protein  32.86 
 
 
242 aa  88.6  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.310543  normal  0.622106 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0224  hypothetical protein  20.63 
 
 
240 aa  85.1  0.000000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0240  hypothetical protein  27.48 
 
 
247 aa  84.7  0.000000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0910  hypothetical protein  34.58 
 
 
242 aa  83.6  0.000000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0853  hypothetical protein  34.58 
 
 
242 aa  82.4  0.000000000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.904514  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2046  hypothetical protein  32.31 
 
 
252 aa  81.6  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.820956  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5647  hypothetical protein  28.64 
 
 
257 aa  80.1  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.193536  normal  0.200445 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2854  hypothetical protein  30.14 
 
 
250 aa  77.4  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.533045 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3081  hypothetical protein  31.91 
 
 
246 aa  77  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.228654 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3997  hypothetical protein  31.53 
 
 
254 aa  77  0.0000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1457  hypothetical protein  32.06 
 
 
242 aa  76.3  0.0000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5130  hypothetical protein  31.5 
 
 
245 aa  58.2  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34960  hypothetical protein  30.09 
 
 
236 aa  49.7  0.00005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0545229  normal  0.520558 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1406  RpiR family transcriptional regulator  35.06 
 
 
292 aa  47  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2771  RpiR family transcriptional regulator  35.06 
 
 
292 aa  47  0.0004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00114132 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1297  RpiR family transcriptional regulator  35.06 
 
 
292 aa  47  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2173  phosphoheptose isomerase  26.58 
 
 
192 aa  44.3  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3277  phosphoheptose isomerase  26.58 
 
 
192 aa  44.3  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3242  phosphoheptose isomerase  26.58 
 
 
192 aa  44.3  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.544428  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1067  phosphoheptose isomerase  26.58 
 
 
192 aa  44.3  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0533  phosphoheptose isomerase  26.58 
 
 
192 aa  44.3  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.436359  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3291  phosphoheptose isomerase  26.58 
 
 
197 aa  43.9  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2295  phosphoheptose isomerase  26.58 
 
 
197 aa  43.9  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.715757  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0731  RpiR family transcriptional regulator  29.63 
 
 
287 aa  42.7  0.006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01243  DNA-binding transcriptional regulator HexR  27.34 
 
 
283 aa  42.4  0.008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.2954  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>