31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_3081 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_3081  hypothetical protein  100 
 
 
246 aa  481  1e-135  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.228654 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5647  hypothetical protein  52.05 
 
 
257 aa  216  2e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.193536  normal  0.200445 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2046  hypothetical protein  46.18 
 
 
252 aa  209  2e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.820956  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2854  hypothetical protein  45.73 
 
 
250 aa  206  3e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.533045 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3997  hypothetical protein  47.25 
 
 
254 aa  184  1.0000000000000001e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1090  hypothetical protein  39.27 
 
 
247 aa  152  7e-36  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.532111  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05060  hypothetical protein  40.16 
 
 
243 aa  124  1e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2926  hypothetical protein  30.74 
 
 
247 aa  120  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2233  hypothetical protein  31.71 
 
 
251 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1896  hypothetical protein  34.87 
 
 
247 aa  119  3e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.334422  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1457  hypothetical protein  40.09 
 
 
242 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4129  hypothetical protein  40.09 
 
 
242 aa  116  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.530241  normal  0.345013 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3800  hypothetical protein  40.09 
 
 
242 aa  115  6.9999999999999995e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.310543  normal  0.622106 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0240  hypothetical protein  29.39 
 
 
247 aa  113  4.0000000000000004e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1414  hypothetical protein  30.33 
 
 
247 aa  112  4.0000000000000004e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000071043  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0910  hypothetical protein  40.61 
 
 
242 aa  109  3e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0853  hypothetical protein  40.61 
 
 
242 aa  108  8.000000000000001e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.904514  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0798  hypothetical protein  32.88 
 
 
246 aa  108  1e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00623177  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0840  hypothetical protein  33.2 
 
 
241 aa  103  2e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.352825 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2486  hypothetical protein  28.51 
 
 
243 aa  101  1e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5130  hypothetical protein  34.44 
 
 
245 aa  95.1  9e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2645  hypothetical protein  30.99 
 
 
276 aa  93.6  3e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.741069  normal  0.224489 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2756  hypothetical protein  30.86 
 
 
270 aa  86.3  4e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0332129  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0911  hypothetical protein  29.08 
 
 
255 aa  84.3  0.000000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.194278  normal  0.704282 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2514  hypothetical protein  32.37 
 
 
274 aa  83.2  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.581758 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34960  hypothetical protein  35.56 
 
 
236 aa  80.5  0.00000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0545229  normal  0.520558 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0562  hypothetical protein  31.91 
 
 
277 aa  76.6  0.0000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.1566  normal  0.893078 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0681  hypothetical protein  26.14 
 
 
253 aa  72.4  0.000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0079  SIS (sugar isomerase) phosphosugar binding domain-containing protein  26.25 
 
 
263 aa  69.7  0.00000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.460323 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0576  hypothetical protein  28.84 
 
 
282 aa  69.7  0.00000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.495615 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0224  hypothetical protein  23.83 
 
 
240 aa  57.4  0.0000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>