79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_1457 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009667  Oant_1457  hypothetical protein  100 
 
 		 242 aa  482  1e-135  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0910  hypothetical protein  85.95 
 
 		 242 aa  404  1.0000000000000001e-112  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0853  hypothetical protein  85.54 
 
 		 242 aa  399  9.999999999999999e-111  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.904514  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3800  hypothetical protein  66.53 
 
 		 242 aa  331  5e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.310543  normal  0.622106 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4129  hypothetical protein  66.12 
 
 		 242 aa  330  9e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.530241  normal  0.345013 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0240  hypothetical protein  38.93 
 
 		 247 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2926  hypothetical protein  38.17 
 
 		 247 aa  163  2.0000000000000002e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1414  hypothetical protein  38.27 
 
 		 247 aa  162  4.0000000000000004e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000071043  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2233  hypothetical protein  38.17 
 
 		 251 aa  161  8.000000000000001e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1090  hypothetical protein  41.31 
 
 		 247 aa  159  3e-38  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.532111  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2486  hypothetical protein  34.75 
 
 		 243 aa  152  4e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1896  hypothetical protein  39.07 
 
 		 247 aa  144  2e-33  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.334422  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0798  hypothetical protein  35.89 
 
 		 246 aa  130  3e-29  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00623177  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0840  hypothetical protein  35.22 
 
 		 241 aa  120  3e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.352825 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3081  hypothetical protein  40.09 
 
 		 246 aa  117  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.228654 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2046  hypothetical protein  37.39 
 
 		 252 aa  108  6e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.820956  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0911  hypothetical protein  33.63 
 
 		 255 aa  107  1e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.194278  normal  0.704282 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34960  hypothetical protein  41.28 
 
 		 236 aa  105  7e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0545229  normal  0.520558 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2756  hypothetical protein  33.18 
 
 		 270 aa  105  9e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0332129  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3997  hypothetical protein  33.75 
 
 		 254 aa  103  2e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05060  hypothetical protein  37.05 
 
 		 243 aa  100  2e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2514  hypothetical protein  32.88 
 
 		 274 aa  99.4  5e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.581758 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0576  hypothetical protein  35.35 
 
 		 282 aa  99  6e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.495615 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5130  hypothetical protein  34.86 
 
 		 245 aa  98.2  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2645  hypothetical protein  32.14 
 
 		 276 aa  95.5  7e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.741069  normal  0.224489 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0079  SIS (sugar isomerase) phosphosugar binding domain-containing protein  27.59 
 
 		 263 aa  94  2e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.460323 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2854  hypothetical protein  35 
 
 		 250 aa  94  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.533045 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0681  hypothetical protein  29.87 
 
 		 253 aa  89.7  4e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5647  hypothetical protein  33.18 
 
 		 257 aa  87.8  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.193536  normal  0.200445 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0562  hypothetical protein  32.06 
 
 		 277 aa  76.3  0.0000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.1566  normal  0.893078 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0224  hypothetical protein  22.61 
 
 		 240 aa  66.2  0.0000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0875  putative transcriptional regulator, RpiR family  30 
 
 		 287 aa  49.7  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0731  RpiR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 287 aa  48.9  0.00006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2049  DNA-binding transcriptional regulator HexR  27.86 
 
 		 284 aa  47.8  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000665792  normal  0.388652 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0782  RpiR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 287 aa  47.8  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0731  RpiR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 287 aa  47.4  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0717  RpiR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 287 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0821  RpiR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 287 aa  47.8  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1865  DNA-binding transcriptional regulator HexR  27.86 
 
 		 284 aa  47.4  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0912  RpiR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 287 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0986  putative transcriptional regulator, RpiR family  28.87 
 
 		 287 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0917  putative transcriptional regulator, RpiR family  28.87 
 
 		 287 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.47337e-41 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2152  DNA-binding transcriptional regulator HexR  27.86 
 
 		 284 aa  47  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.284863  normal  0.555524 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2490  DNA-binding transcriptional regulator HexR  27.86 
 
 		 284 aa  46.6  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1355  transcriptional regulator  29.17 
 
 		 273 aa  47  0.0003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.906845  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2255  DNA-binding transcriptional regulator HexR  27.86 
 
 		 284 aa  47  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000281724  hitchhiker  0.00000550313 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1928  DNA-binding transcriptional regulator HexR  27.86 
 
 		 284 aa  47  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0915843  normal  0.285781 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2047  DNA-binding transcriptional regulator HexR  27.86 
 
 		 284 aa  47  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.20632 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2080  DNA-binding transcriptional regulator HexR  27.86 
 
 		 286 aa  47  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00496237  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003760  glucose repressor HexR for Entner-Doudoroff pathway RpiR family  27.86 
 
 		 259 aa  46.6  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.192568  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2129  DNA-binding transcriptional regulator HexR  27.86 
 
 		 284 aa  47  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00123484  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2242  DNA-binding transcriptional regulator HexR  27.86 
 
 		 284 aa  47  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4528  DNA-binding transcriptional regulator HexR  27.86 
 
 		 284 aa  47  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2174  DNA-binding transcriptional regulator HexR  27.86 
 
 		 284 aa  47  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.271639  normal  0.12603 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1813  DNA-binding transcriptional regulator HexR  27.14 
 
 		 284 aa  46.6  0.0003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000867158  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2280  DNA-binding transcriptional regulator HexR  27.54 
 
 		 282 aa  46.2  0.0004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.499915  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02633  DNA-binding transcriptional regulator HexR  26.7 
 
 		 284 aa  46.2  0.0005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3388  RpiR family transcriptional regulator  27.41 
 
 		 284 aa  45.8  0.0006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1891  DNA-binding transcriptional regulator HexR  27.14 
 
 		 284 aa  45.8  0.0006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4460  putative transcriptional regulator, RpiR family  28.17 
 
 		 287 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.857974 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0718  DNA-binding transcriptional regulator HexR  27.14 
 
 		 284 aa  43.9  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2540  DNA-binding transcriptional regulator HexR  26.43 
 
 		 284 aa  44.3  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0495107  normal  0.0835263 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2069  DNA-binding transcriptional regulator HexR  26.43 
 
 		 284 aa  43.9  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000131353  hitchhiker  0.000414379 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0898  HTH-type transcriptional regulator, rpiR family  25.45 
 
 		 292 aa  42.7  0.005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.679683  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2468  RpiR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 296 aa  42.7  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.899807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0750  RpiR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 281 aa  42.7  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.414867  normal  0.513903 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2814  transcriptional regulator, RpiR family  37.1 
 
 		 285 aa  42.4  0.006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0182  RpiR family transcriptional regulator  26.72 
 
 		 279 aa  42.4  0.007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1297  RpiR family transcriptional regulator  26.24 
 
 		 292 aa  42.4  0.007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0179  RpiR family transcriptional regulator  26.72 
 
 		 279 aa  42.4  0.007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.912597  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1406  RpiR family transcriptional regulator  26.24 
 
 		 292 aa  42.4  0.007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2771  RpiR family transcriptional regulator  26.24 
 
 		 292 aa  42.4  0.007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00114132 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0250  DNA-binding transcriptional repressor RpiR  33.04 
 
 		 287 aa  42.4  0.007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0694  RpiR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 281 aa  42  0.008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00592918 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2769  DNA-binding transcriptional regulator HexR  26.62 
 
 		 290 aa  42  0.009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0149863  hitchhiker  0.00789418 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0672  transcriptional regulator, RpiR family  27.59 
 
 		 281 aa  42  0.009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.654483  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2135  DNA-binding transcriptional regulator HexR  27.14 
 
 		 301 aa  41.6  0.01  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2023  DNA-binding transcriptional regulator HexR  27.14 
 
 		 289 aa  41.6  0.01  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.197371  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2413  DNA-binding transcriptional regulator HexR  27.14 
 
 		 301 aa  41.6  0.01  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000012699  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>