64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_4129 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_4129  hypothetical protein  100 
 
 		 242 aa  484  1e-136  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.530241  normal  0.345013 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3800  hypothetical protein  97.11 
 
 		 242 aa  472  1e-132  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.310543  normal  0.622106 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1457  hypothetical protein  66.12 
 
 		 242 aa  330  9e-90  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0910  hypothetical protein  64.46 
 
 		 242 aa  307  8e-83  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0853  hypothetical protein  64.05 
 
 		 242 aa  303  2.0000000000000002e-81  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.904514  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0240  hypothetical protein  40.74 
 
 		 247 aa  178  7e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2233  hypothetical protein  39.42 
 
 		 251 aa  166  2e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2926  hypothetical protein  38.27 
 
 		 247 aa  163  2.0000000000000002e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1090  hypothetical protein  37.55 
 
 		 247 aa  160  1e-38  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.532111  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1414  hypothetical protein  38.27 
 
 		 247 aa  160  1e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000071043  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1896  hypothetical protein  37.39 
 
 		 247 aa  154  1e-36  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.334422  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2486  hypothetical protein  34.19 
 
 		 243 aa  149  5e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0798  hypothetical protein  37.1 
 
 		 246 aa  139  6e-32  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00623177  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0840  hypothetical protein  32.92 
 
 		 241 aa  121  9e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.352825 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0911  hypothetical protein  34.29 
 
 		 255 aa  119  3e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.194278  normal  0.704282 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3081  hypothetical protein  40.09 
 
 		 246 aa  117  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.228654 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5647  hypothetical protein  34.73 
 
 		 257 aa  116  3e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.193536  normal  0.200445 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3997  hypothetical protein  32.92 
 
 		 254 aa  112  6e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2514  hypothetical protein  33.47 
 
 		 274 aa  112  6e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.581758 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5130  hypothetical protein  35.04 
 
 		 245 aa  112  7.000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2756  hypothetical protein  32.2 
 
 		 270 aa  109  5e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0332129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2046  hypothetical protein  33.2 
 
 		 252 aa  108  6e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.820956  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0576  hypothetical protein  36.49 
 
 		 282 aa  108  7.000000000000001e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.495615 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2645  hypothetical protein  33.69 
 
 		 276 aa  100  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.741069  normal  0.224489 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34960  hypothetical protein  39.91 
 
 		 236 aa  99.4  4e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0545229  normal  0.520558 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2854  hypothetical protein  35.47 
 
 		 250 aa  99  7e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.533045 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0562  hypothetical protein  35.43 
 
 		 277 aa  91.3  1e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.1566  normal  0.893078 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0681  hypothetical protein  27.46 
 
 		 253 aa  89.4  4e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05060  hypothetical protein  33.5 
 
 		 243 aa  87  3e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0079  SIS (sugar isomerase) phosphosugar binding domain-containing protein  27.88 
 
 		 263 aa  84.7  0.000000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.460323 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0224  hypothetical protein  22.38 
 
 		 240 aa  58.9  0.00000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0182  RpiR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 279 aa  49.3  0.00005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0179  RpiR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 279 aa  49.3  0.00005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.912597  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0092  RpiR family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 287 aa  47.4  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0898  HTH-type transcriptional regulator, rpiR family  26.22 
 
 		 292 aa  46.2  0.0004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.679683  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0146  sugar isomerase (SIS)  27.75 
 
 		 216 aa  45.8  0.0006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0486  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  26.95 
 
 		 642 aa  45.8  0.0006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0965  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  26.95 
 
 		 642 aa  45.8  0.0006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0899614  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0926  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  26.95 
 
 		 642 aa  45.8  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.789642  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4068  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  26.95 
 
 		 642 aa  45.8  0.0007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0150237  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1025  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  26.24 
 
 		 638 aa  45.4  0.0008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.745776  normal  0.175715 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2002  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  26.95 
 
 		 620 aa  45.4  0.0009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0778  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  26.95 
 
 		 620 aa  45.4  0.0009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2612  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  26.95 
 
 		 620 aa  45.4  0.0009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.85018  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2132  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  26.95 
 
 		 641 aa  45.1  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3090  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  26.95 
 
 		 641 aa  45.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1550  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  26.95 
 
 		 641 aa  45.1  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3055  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  26.95 
 
 		 641 aa  45.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.570164  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3454  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  26.24 
 
 		 638 aa  45.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0454105  normal  0.179776 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3001  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  26.95 
 
 		 641 aa  45.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1297  RpiR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 292 aa  44.3  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2080  DNA-binding transcriptional regulator HexR  29.17 
 
 		 286 aa  44.3  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00496237  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0625  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  25.53 
 
 		 639 aa  43.9  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2433  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  26.24 
 
 		 642 aa  43.9  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.399098  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2771  RpiR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 292 aa  44.3  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00114132 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0825  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  26.24 
 
 		 642 aa  43.9  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.125163  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1406  RpiR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 292 aa  44.3  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0837  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  26.24 
 
 		 642 aa  43.9  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0706  sugar isomerase (SIS)  26.35 
 
 		 205 aa  43.5  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0564626  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1124  RpiR family transcriptional regulator  26.72 
 
 		 282 aa  43.5  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.673079  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0207  phosphoheptose isomerase  28.08 
 
 		 216 aa  43.5  0.003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3388  RpiR family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 284 aa  42.4  0.007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1547  RpiR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 296 aa  41.6  0.01  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2468  RpiR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 296 aa  41.6  0.01  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.899807  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>