34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_1090 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008698  Tpen_1090  hypothetical protein  100 
 
 
247 aa  500  1e-141  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.532111  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1896  hypothetical protein  54.51 
 
 
247 aa  265  4e-70  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.334422  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2233  hypothetical protein  37.34 
 
 
251 aa  182  3e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2926  hypothetical protein  37.97 
 
 
247 aa  182  6e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1414  hypothetical protein  37.07 
 
 
247 aa  170  2e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000071043  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0240  hypothetical protein  37.85 
 
 
247 aa  168  8e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0798  hypothetical protein  39.13 
 
 
246 aa  167  1e-40  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00623177  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2486  hypothetical protein  39.22 
 
 
243 aa  165  5e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4129  hypothetical protein  37.55 
 
 
242 aa  160  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.530241  normal  0.345013 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1457  hypothetical protein  41.31 
 
 
242 aa  159  3e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0910  hypothetical protein  39.91 
 
 
242 aa  158  6e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3800  hypothetical protein  40.53 
 
 
242 aa  158  8e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.310543  normal  0.622106 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0853  hypothetical protein  39.82 
 
 
242 aa  155  6e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.904514  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3997  hypothetical protein  39.18 
 
 
254 aa  152  5.9999999999999996e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3081  hypothetical protein  39.66 
 
 
246 aa  147  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.228654 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2854  hypothetical protein  38.26 
 
 
250 aa  145  7.0000000000000006e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.533045 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2756  hypothetical protein  34.19 
 
 
270 aa  144  1e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0332129  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2046  hypothetical protein  33.47 
 
 
252 aa  144  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.820956  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0911  hypothetical protein  31.6 
 
 
255 aa  141  9.999999999999999e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.194278  normal  0.704282 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34960  hypothetical protein  38.39 
 
 
236 aa  137  1e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0545229  normal  0.520558 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05060  hypothetical protein  37.29 
 
 
243 aa  137  1e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2514  hypothetical protein  31.62 
 
 
274 aa  136  3.0000000000000003e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.581758 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0079  SIS (sugar isomerase) phosphosugar binding domain-containing protein  32.74 
 
 
263 aa  134  1.9999999999999998e-30  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.460323 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5647  hypothetical protein  35.65 
 
 
257 aa  131  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.193536  normal  0.200445 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0681  hypothetical protein  29.41 
 
 
253 aa  126  3e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2645  hypothetical protein  32.71 
 
 
276 aa  126  4.0000000000000003e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.741069  normal  0.224489 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5130  hypothetical protein  35.11 
 
 
245 aa  125  7e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0562  hypothetical protein  32.31 
 
 
277 aa  123  2e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.1566  normal  0.893078 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0840  hypothetical protein  33.03 
 
 
241 aa  123  3e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.352825 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0576  hypothetical protein  30.67 
 
 
282 aa  123  3e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.495615 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0224  hypothetical protein  23.74 
 
 
240 aa  85.9  6e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0672  transcriptional regulator, RpiR family  27.73 
 
 
281 aa  44.3  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.654483  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0694  RpiR family transcriptional regulator  27.73 
 
 
281 aa  44.3  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00592918 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1468  transcriptional regulator, RpiR family  29.37 
 
 
286 aa  43.1  0.005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000610661  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>