33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_2046 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_2046  hypothetical protein  100 
 
 
252 aa  494  1e-139  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.820956  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2854  hypothetical protein  59.92 
 
 
250 aa  292  3e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.533045 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5647  hypothetical protein  56.5 
 
 
257 aa  268  5e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.193536  normal  0.200445 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3997  hypothetical protein  50.81 
 
 
254 aa  241  6e-63  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3081  hypothetical protein  46.61 
 
 
246 aa  202  3e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.228654 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0240  hypothetical protein  34.14 
 
 
247 aa  150  2e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2233  hypothetical protein  33.47 
 
 
251 aa  146  4.0000000000000006e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1090  hypothetical protein  33.47 
 
 
247 aa  144  2e-33  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.532111  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1896  hypothetical protein  35.2 
 
 
247 aa  142  7e-33  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.334422  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2926  hypothetical protein  33.06 
 
 
247 aa  140  3e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0798  hypothetical protein  33.33 
 
 
246 aa  137  2e-31  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00623177  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05060  hypothetical protein  39.56 
 
 
243 aa  134  1.9999999999999998e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0840  hypothetical protein  34.8 
 
 
241 aa  131  7.999999999999999e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.352825 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1414  hypothetical protein  30.58 
 
 
247 aa  129  5.0000000000000004e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000071043  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2486  hypothetical protein  29.92 
 
 
243 aa  111  9e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2756  hypothetical protein  34.4 
 
 
270 aa  110  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0332129  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3800  hypothetical protein  34.02 
 
 
242 aa  108  6e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.310543  normal  0.622106 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4129  hypothetical protein  33.2 
 
 
242 aa  108  6e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.530241  normal  0.345013 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1457  hypothetical protein  37.39 
 
 
242 aa  108  7.000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0910  hypothetical protein  37.38 
 
 
242 aa  102  4e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2514  hypothetical protein  33.6 
 
 
274 aa  102  5e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.581758 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2645  hypothetical protein  32.89 
 
 
276 aa  101  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.741069  normal  0.224489 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0576  hypothetical protein  30.83 
 
 
282 aa  99.8  3e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.495615 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0079  SIS (sugar isomerase) phosphosugar binding domain-containing protein  29.07 
 
 
263 aa  99  6e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.460323 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0911  hypothetical protein  29.6 
 
 
255 aa  97.8  1e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.194278  normal  0.704282 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0853  hypothetical protein  36.89 
 
 
242 aa  98.2  1e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.904514  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5130  hypothetical protein  35.92 
 
 
245 aa  97.1  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34960  hypothetical protein  38.4 
 
 
236 aa  89  6e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0545229  normal  0.520558 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0681  hypothetical protein  27.73 
 
 
253 aa  88.2  1e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0562  hypothetical protein  32.31 
 
 
277 aa  81.6  0.00000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.1566  normal  0.893078 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0224  hypothetical protein  23.22 
 
 
240 aa  61.2  0.00000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1357  N-acetylmuramic acid-6-phosphate etherase  29.2 
 
 
298 aa  43.9  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.545728 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3872  phosphoheptose isomerase  28.1 
 
 
194 aa  43.5  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.254676  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>