32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_34960 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_34960  hypothetical protein  100 
 
 		 236 aa  461  1e-129  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0545229  normal  0.520558 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5130  hypothetical protein  52.79 
 
 		 245 aa  212  3.9999999999999995e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1896  hypothetical protein  40 
 
 		 247 aa  164  1.0000000000000001e-39  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.334422  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2926  hypothetical protein  37.89 
 
 		 247 aa  156  2e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1414  hypothetical protein  37 
 
 		 247 aa  154  9e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000071043  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2233  hypothetical protein  37.72 
 
 		 251 aa  152  2.9999999999999998e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1090  hypothetical protein  38.39 
 
 		 247 aa  152  4e-36  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.532111  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1457  hypothetical protein  41.28 
 
 		 242 aa  133  3e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0240  hypothetical protein  32.37 
 
 		 247 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3800  hypothetical protein  40.37 
 
 		 242 aa  125  5e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.310543  normal  0.622106 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4129  hypothetical protein  39.91 
 
 		 242 aa  124  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.530241  normal  0.345013 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2486  hypothetical protein  28.81 
 
 		 243 aa  123  3e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0910  hypothetical protein  39.8 
 
 		 242 aa  120  9.999999999999999e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0798  hypothetical protein  32.62 
 
 		 246 aa  118  7e-26  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00623177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0853  hypothetical protein  39.8 
 
 		 242 aa  117  9.999999999999999e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.904514  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05060  hypothetical protein  35.9 
 
 		 243 aa  112  4.0000000000000004e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2046  hypothetical protein  38.4 
 
 		 252 aa  107  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.820956  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3081  hypothetical protein  35.56 
 
 		 246 aa  102  4e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.228654 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5647  hypothetical protein  34.32 
 
 		 257 aa  100  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.193536  normal  0.200445 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0840  hypothetical protein  33.49 
 
 		 241 aa  99.8  3e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.352825 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2854  hypothetical protein  35.24 
 
 		 250 aa  95.1  9e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.533045 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0079  SIS (sugar isomerase) phosphosugar binding domain-containing protein  32.13 
 
 		 263 aa  91.3  1e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.460323 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3997  hypothetical protein  33.47 
 
 		 254 aa  90.5  2e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0681  hypothetical protein  29.55 
 
 		 253 aa  89.7  4e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2514  hypothetical protein  31.28 
 
 		 274 aa  86.7  3e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.581758 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0911  hypothetical protein  33.15 
 
 		 255 aa  84.7  0.000000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.194278  normal  0.704282 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0576  hypothetical protein  31.94 
 
 		 282 aa  84  0.000000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.495615 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2756  hypothetical protein  30.84 
 
 		 270 aa  83.6  0.000000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0332129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2645  hypothetical protein  30.92 
 
 		 276 aa  78.6  0.00000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.741069  normal  0.224489 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0224  hypothetical protein  21.2 
 
 		 240 aa  73.6  0.000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0562  hypothetical protein  31.31 
 
 		 277 aa  70.9  0.00000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.1566  normal  0.893078 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1468  transcriptional regulator, RpiR family  32 
 
 		 286 aa  45.1  0.0009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000610661  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>