49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_0576 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008578  Acel_0576  hypothetical protein  100 
 
 
282 aa  575  1.0000000000000001e-163  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.495615 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2514  hypothetical protein  52.03 
 
 
274 aa  271  7e-72  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.581758 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2756  hypothetical protein  51.63 
 
 
270 aa  269  4e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0332129  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2645  hypothetical protein  45.66 
 
 
276 aa  200  1.9999999999999998e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.741069  normal  0.224489 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0911  hypothetical protein  41.25 
 
 
255 aa  166  2.9999999999999998e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.194278  normal  0.704282 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0681  hypothetical protein  37.33 
 
 
253 aa  166  4e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0079  SIS (sugar isomerase) phosphosugar binding domain-containing protein  34.68 
 
 
263 aa  137  2e-31  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.460323 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0562  hypothetical protein  39.71 
 
 
277 aa  132  7.999999999999999e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.1566  normal  0.893078 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1090  hypothetical protein  30.67 
 
 
247 aa  123  4e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.532111  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1896  hypothetical protein  30.49 
 
 
247 aa  115  8.999999999999998e-25  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.334422  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0240  hypothetical protein  29.6 
 
 
247 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2486  hypothetical protein  29.58 
 
 
243 aa  114  1.0000000000000001e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2233  hypothetical protein  29.71 
 
 
251 aa  109  4.0000000000000004e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0798  hypothetical protein  31.38 
 
 
246 aa  109  6e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00623177  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1414  hypothetical protein  29.41 
 
 
247 aa  108  8.000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000071043  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4129  hypothetical protein  36.49 
 
 
242 aa  108  9.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.530241  normal  0.345013 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3800  hypothetical protein  36.02 
 
 
242 aa  108  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.310543  normal  0.622106 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2926  hypothetical protein  28.57 
 
 
247 aa  107  3e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0840  hypothetical protein  29.65 
 
 
241 aa  101  2e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.352825 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2046  hypothetical protein  30.83 
 
 
252 aa  99.8  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.820956  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1457  hypothetical protein  35.35 
 
 
242 aa  99  8e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0910  hypothetical protein  35.78 
 
 
242 aa  97.4  3e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0853  hypothetical protein  35.85 
 
 
242 aa  95.5  8e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.904514  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5647  hypothetical protein  29.2 
 
 
257 aa  91.3  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.193536  normal  0.200445 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5130  hypothetical protein  32.71 
 
 
245 aa  87  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05060  hypothetical protein  31.22 
 
 
243 aa  86.3  6e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3997  hypothetical protein  27.27 
 
 
254 aa  81.6  0.00000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2854  hypothetical protein  26.34 
 
 
250 aa  77  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.533045 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3081  hypothetical protein  28.91 
 
 
246 aa  68.6  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.228654 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34960  hypothetical protein  31.94 
 
 
236 aa  66.6  0.0000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0545229  normal  0.520558 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0224  hypothetical protein  22.48 
 
 
240 aa  63.9  0.000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1335  phosphoheptose isomerase  27.97 
 
 
191 aa  54.7  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.292937  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00221  hypothetical protein  29.92 
 
 
192 aa  45.8  0.0008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3385  phosphoheptose isomerase  29.92 
 
 
192 aa  45.8  0.0008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0266  phosphoheptose isomerase  29.92 
 
 
192 aa  45.8  0.0008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0218  phosphoheptose isomerase  29.92 
 
 
192 aa  45.8  0.0008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0234  phosphoheptose isomerase  29.92 
 
 
192 aa  45.8  0.0008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.407926  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3398  phosphoheptose isomerase  29.92 
 
 
192 aa  45.8  0.0008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0254  phosphoheptose isomerase  29.92 
 
 
192 aa  45.8  0.0008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0250  phosphoheptose isomerase  29.92 
 
 
192 aa  45.8  0.0008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00217  phosphoheptose isomerase  29.92 
 
 
192 aa  45.8  0.0008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3872  phosphoheptose isomerase  23.84 
 
 
194 aa  45.1  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.254676  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1238  phosphoheptose isomerase  25.69 
 
 
193 aa  43.9  0.003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0759  phosphoheptose isomerase  29.13 
 
 
192 aa  43.5  0.004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.236011 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0340  phosphoheptose isomerase  28.35 
 
 
192 aa  42.4  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.648368 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0344  phosphoheptose isomerase  28.35 
 
 
192 aa  42.4  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.573238  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0359  phosphoheptose isomerase  28.35 
 
 
192 aa  42.4  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0351  phosphoheptose isomerase  28.35 
 
 
192 aa  42.4  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.178027  hitchhiker  0.00118485 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0349  phosphoheptose isomerase  28.35 
 
 
192 aa  42.4  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.477864 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>