31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5130 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_5130  hypothetical protein  100 
 
 		 245 aa  482  1e-135  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34960  hypothetical protein  52.79 
 
 		 236 aa  198  7.999999999999999e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0545229  normal  0.520558 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1414  hypothetical protein  31.67 
 
 		 247 aa  132  3.9999999999999996e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000071043  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1090  hypothetical protein  35.56 
 
 		 247 aa  132  6.999999999999999e-30  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.532111  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2233  hypothetical protein  33.05 
 
 		 251 aa  132  6.999999999999999e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1896  hypothetical protein  33.2 
 
 		 247 aa  129  3e-29  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.334422  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2926  hypothetical protein  30.83 
 
 		 247 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0240  hypothetical protein  30.86 
 
 		 247 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3800  hypothetical protein  36.29 
 
 		 242 aa  119  6e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.310543  normal  0.622106 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4129  hypothetical protein  35.86 
 
 		 242 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.530241  normal  0.345013 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0798  hypothetical protein  27.27 
 
 		 246 aa  108  6e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00623177  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2046  hypothetical protein  35.92 
 
 		 252 aa  108  7.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.820956  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2486  hypothetical protein  26.92 
 
 		 243 aa  107  1e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05060  hypothetical protein  34.3 
 
 		 243 aa  105  6e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1457  hypothetical protein  34.86 
 
 		 242 aa  103  2e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5647  hypothetical protein  33.47 
 
 		 257 aa  100  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.193536  normal  0.200445 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3081  hypothetical protein  36.28 
 
 		 246 aa  99.4  5e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.228654 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0910  hypothetical protein  34.83 
 
 		 242 aa  95.9  6e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2854  hypothetical protein  31.49 
 
 		 250 aa  94  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.533045 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0576  hypothetical protein  33.64 
 
 		 282 aa  93.6  3e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.495615 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0853  hypothetical protein  34.33 
 
 		 242 aa  90.5  2e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.904514  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0840  hypothetical protein  29.88 
 
 		 241 aa  89.4  6e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.352825 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3997  hypothetical protein  29.39 
 
 		 254 aa  88.6  9e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2756  hypothetical protein  27.56 
 
 		 270 aa  82.4  0.000000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0332129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2514  hypothetical protein  28.74 
 
 		 274 aa  82  0.000000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.581758 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0681  hypothetical protein  25.73 
 
 		 253 aa  79  0.00000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0911  hypothetical protein  27.62 
 
 		 255 aa  73.9  0.000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.194278  normal  0.704282 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0079  SIS (sugar isomerase) phosphosugar binding domain-containing protein  23.53 
 
 		 263 aa  72.4  0.000000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.460323 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0562  hypothetical protein  32 
 
 		 277 aa  63.5  0.000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.1566  normal  0.893078 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2645  hypothetical protein  30 
 
 		 276 aa  63.2  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.741069  normal  0.224489 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0224  hypothetical protein  20.29 
 
 		 240 aa  54.7  0.000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>