32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2756 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_2756  hypothetical protein  100 
 
 
270 aa  549  1e-155  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0332129  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2514  hypothetical protein  86.99 
 
 
274 aa  482  1e-135  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.581758 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0576  hypothetical protein  51.63 
 
 
282 aa  269  4e-71  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.495615 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2645  hypothetical protein  51.35 
 
 
276 aa  241  1e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.741069  normal  0.224489 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0681  hypothetical protein  42.23 
 
 
253 aa  206  5e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0911  hypothetical protein  44.87 
 
 
255 aa  195  7e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.194278  normal  0.704282 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0798  hypothetical protein  38.49 
 
 
246 aa  147  2.0000000000000003e-34  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00623177  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1090  hypothetical protein  34.19 
 
 
247 aa  144  1e-33  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.532111  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0079  SIS (sugar isomerase) phosphosugar binding domain-containing protein  36.41 
 
 
263 aa  144  1e-33  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.460323 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1896  hypothetical protein  36.63 
 
 
247 aa  144  2e-33  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.334422  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0562  hypothetical protein  37.23 
 
 
277 aa  130  3e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.1566  normal  0.893078 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5647  hypothetical protein  35 
 
 
257 aa  128  8.000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.193536  normal  0.200445 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2926  hypothetical protein  30.28 
 
 
247 aa  128  8.000000000000001e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2233  hypothetical protein  30.89 
 
 
251 aa  125  9e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0240  hypothetical protein  30.2 
 
 
247 aa  123  3e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2486  hypothetical protein  29.34 
 
 
243 aa  123  4e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1414  hypothetical protein  29.72 
 
 
247 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000071043  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3997  hypothetical protein  37.02 
 
 
254 aa  113  3e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2046  hypothetical protein  34.4 
 
 
252 aa  110  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.820956  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4129  hypothetical protein  32.2 
 
 
242 aa  109  6e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.530241  normal  0.345013 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3800  hypothetical protein  32.64 
 
 
242 aa  107  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.310543  normal  0.622106 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2854  hypothetical protein  33.75 
 
 
250 aa  105  7e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.533045 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1457  hypothetical protein  33.18 
 
 
242 aa  105  1e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0840  hypothetical protein  27.67 
 
 
241 aa  102  7e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.352825 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05060  hypothetical protein  30.86 
 
 
243 aa  100  2e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0910  hypothetical protein  32.51 
 
 
242 aa  95.5  9e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0853  hypothetical protein  32.02 
 
 
242 aa  90.5  2e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.904514  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3081  hypothetical protein  30.64 
 
 
246 aa  82.8  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.228654 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0224  hypothetical protein  26.82 
 
 
240 aa  79.7  0.00000000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5130  hypothetical protein  26.77 
 
 
245 aa  74.7  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34960  hypothetical protein  30.84 
 
 
236 aa  72.4  0.000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0545229  normal  0.520558 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3096  phosphoheptose isomerase  26.37 
 
 
214 aa  43.1  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.286369  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>