43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_0798 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010644  Emin_0798  hypothetical protein  100 
 
 
246 aa  502  1e-141  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00623177  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1090  hypothetical protein  39.13 
 
 
247 aa  167  1e-40  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.532111  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0240  hypothetical protein  38.68 
 
 
247 aa  166  4e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2233  hypothetical protein  36.89 
 
 
251 aa  165  6.9999999999999995e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2926  hypothetical protein  37.45 
 
 
247 aa  165  8e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1414  hypothetical protein  37.92 
 
 
247 aa  161  7e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000071043  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1896  hypothetical protein  37.66 
 
 
247 aa  161  8.000000000000001e-39  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.334422  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2756  hypothetical protein  38.49 
 
 
270 aa  147  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0332129  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0681  hypothetical protein  37.72 
 
 
253 aa  145  5e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2486  hypothetical protein  35.54 
 
 
243 aa  142  7e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2514  hypothetical protein  36.4 
 
 
274 aa  140  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.581758 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4129  hypothetical protein  37.1 
 
 
242 aa  139  6e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.530241  normal  0.345013 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3800  hypothetical protein  37.1 
 
 
242 aa  138  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.310543  normal  0.622106 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3997  hypothetical protein  35.55 
 
 
254 aa  137  2e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2046  hypothetical protein  33.33 
 
 
252 aa  137  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.820956  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0840  hypothetical protein  32.33 
 
 
241 aa  132  3.9999999999999996e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.352825 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5647  hypothetical protein  34.44 
 
 
257 aa  130  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.193536  normal  0.200445 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1457  hypothetical protein  35.89 
 
 
242 aa  130  3e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2854  hypothetical protein  33.19 
 
 
250 aa  123  3e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.533045 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05060  hypothetical protein  29.46 
 
 
243 aa  121  9e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0911  hypothetical protein  31.64 
 
 
255 aa  119  3.9999999999999996e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.194278  normal  0.704282 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0910  hypothetical protein  33.74 
 
 
242 aa  118  7e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0853  hypothetical protein  33.33 
 
 
242 aa  114  2.0000000000000002e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.904514  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0562  hypothetical protein  34.2 
 
 
277 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.1566  normal  0.893078 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0576  hypothetical protein  31.38 
 
 
282 aa  109  5e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.495615 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3081  hypothetical protein  32.88 
 
 
246 aa  108  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.228654 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0079  SIS (sugar isomerase) phosphosugar binding domain-containing protein  28.92 
 
 
263 aa  106  3e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.460323 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34960  hypothetical protein  32.62 
 
 
236 aa  104  1e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0545229  normal  0.520558 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5130  hypothetical protein  26.84 
 
 
245 aa  102  5e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2645  hypothetical protein  29.86 
 
 
276 aa  99.8  3e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.741069  normal  0.224489 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0224  hypothetical protein  28.77 
 
 
240 aa  90.1  3e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0672  transcriptional regulator, RpiR family  31.9 
 
 
281 aa  51.6  0.00001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.654483  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0694  RpiR family transcriptional regulator  31.9 
 
 
281 aa  51.6  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00592918 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1124  RpiR family transcriptional regulator  31.03 
 
 
282 aa  48.9  0.00007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.673079  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0750  RpiR family transcriptional regulator  31.78 
 
 
281 aa  48.1  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.414867  normal  0.513903 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1778  RpiR family transcriptional regulator  30.17 
 
 
281 aa  47.4  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.141472  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0941  RpiR family transcriptional regulator  32.08 
 
 
281 aa  46.2  0.0005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0472093  normal  0.387072 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5676  RpiR family transcriptional regulator  32.08 
 
 
323 aa  46.2  0.0005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.321786 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0652  RpiR family transcriptional regulator  29.31 
 
 
281 aa  45.1  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.334737  normal  0.0629992 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1835  DNA-binding transcriptional regulator HexR  31.01 
 
 
290 aa  43.5  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0416  helix-turn-helix protein RpiR:sugar isomerase (SIS)  31.07 
 
 
286 aa  43.1  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5116  transcriptional regulator, RpiR family  31.07 
 
 
286 aa  43.1  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3406  N-acetylmuramic acid-6-phosphate etherase  28.67 
 
 
298 aa  42.4  0.006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>