More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_1807 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010816  BLD_1807  transposase  100 
 
 
427 aa  872    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.411969  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0997  transposase  100 
 
 
522 aa  870    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0170218  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1303  integrase catalytic subunit  43.72 
 
 
510 aa  337  2.9999999999999997e-91  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1529  integrase catalytic subunit  42.66 
 
 
505 aa  331  1e-89  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.544255  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1532  integrase catalytic subunit  42.66 
 
 
505 aa  331  1e-89  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0156  transposase InsG for insertion sequence IS1353  41.4 
 
 
514 aa  310  2e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.298801  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0806  putative transposase IS3/IS911  40.28 
 
 
548 aa  306  3e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.665244  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5652  integrase catalytic region  40.47 
 
 
512 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5758  integrase catalytic region  40.47 
 
 
512 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0339  integrase catalytic subunit  39.68 
 
 
515 aa  305  1.0000000000000001e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.389244 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1110  integrase catalytic region  41.3 
 
 
512 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3050  integrase catalytic subunit  40.37 
 
 
512 aa  302  7.000000000000001e-81  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.985644 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4442  integrase catalytic region  40 
 
 
512 aa  301  2e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3440  integrase catalytic region  39.44 
 
 
533 aa  294  2e-78  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.623196  normal  0.257291 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5143  integrase catalytic subunit  39.03 
 
 
512 aa  293  3e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.1652 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4798  integrase catalytic region  40 
 
 
512 aa  293  3e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.285753  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2991  integrase catalytic subunit  38.14 
 
 
512 aa  283  3.0000000000000004e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2672  integrase catalytic region  38.14 
 
 
512 aa  283  3.0000000000000004e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.226674  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1714  putative transposase  39.68 
 
 
513 aa  280  4e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1750  integrase catalytic subunit  38.81 
 
 
462 aa  261  2e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1332  transposase  42.68 
 
 
349 aa  213  4.9999999999999996e-54  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00448143  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0181  Integrase catalytic region  38.41 
 
 
385 aa  202  8e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0029  transposase  46.12 
 
 
258 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.204737  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2708  transposase IS3/IS911  35.35 
 
 
288 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.710793  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5561  integrase catalytic region  42.29 
 
 
278 aa  155  1e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.966664  normal  0.319693 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1339  integrase catalytic region  42.29 
 
 
278 aa  155  2e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00327623 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3939  integrase catalytic region  42.29 
 
 
278 aa  155  2e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.997818  normal  0.816377 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0288  integrase catalytic region  42.29 
 
 
278 aa  155  2e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.010827  normal  0.364185 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00620  IS150 putative transposase  40.91 
 
 
283 aa  150  3e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03409  IS150 putative transposase  40.91 
 
 
283 aa  150  3e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04283  IS150 putative transposase  40.91 
 
 
283 aa  150  3e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04284  IS150 putative transposase  40.91 
 
 
283 aa  150  3e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0153  Integrase catalytic region  40.91 
 
 
283 aa  150  3e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3760  IS150, transposase orfB  40.91 
 
 
283 aa  150  3e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03577  hypothetical protein  40.91 
 
 
283 aa  150  3e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03360  hypothetical protein  40.91 
 
 
283 aa  150  3e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02652  hypothetical protein  40.91 
 
 
283 aa  150  3e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00609  hypothetical protein  40.91 
 
 
283 aa  150  3e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1074  IS150 transposase orfB  40.91 
 
 
283 aa  149  6e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.274968 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1436  isrso11-transposase orfb protein  41.14 
 
 
278 aa  149  9e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3089  isrso11-transposase orfb protein  41.14 
 
 
278 aa  149  9e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2265  isrso11-transposase orfb protein  41.14 
 
 
269 aa  149  1.0000000000000001e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.654109  normal  0.311626 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1068  IS861, transposase OrfB  39.56 
 
 
277 aa  149  1.0000000000000001e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000365841  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3880  IS150 transposase orfB  40.91 
 
 
283 aa  148  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.636384  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5018  ISPsy9, transposase OrfB  42.05 
 
 
278 aa  147  3e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0273  integrase catalytic subunit  42.05 
 
 
278 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0592  integrase catalytic subunit  42.05 
 
 
278 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.398355  normal  0.203644 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1176  integrase catalytic subunit  42.05 
 
 
278 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.155999  normal  0.139612 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4616  integrase catalytic subunit  42.05 
 
 
278 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.698457  normal  0.616074 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4680  integrase catalytic subunit  42.05 
 
 
278 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1527  IS861, transposase OrfB  39.01 
 
 
277 aa  147  5e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.019488  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2408  isrso11-transposase orfb protein  40.57 
 
 
278 aa  146  9e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.915903  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02200  YadA protein  39.66 
 
 
279 aa  145  2e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.618356  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04289  transposase  39.66 
 
 
279 aa  145  2e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0026  transposase  39.77 
 
 
269 aa  144  2e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02377  hypothetical protein  39.66 
 
 
279 aa  145  2e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02160  hypothetical protein  39.66 
 
 
279 aa  145  2e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.604012  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1714  transposase  41.95 
 
 
278 aa  144  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.376694  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1128  IS3 family transposase OrfB  39.08 
 
 
267 aa  144  4e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00657543  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0056  IS3 family transposase OrfB  39.08 
 
 
267 aa  144  4e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3662  integrase core domain protein  41.67 
 
 
265 aa  143  7e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0307  transposase orfB, IS150-related  39.77 
 
 
269 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1280  integrase core domain protein  38.64 
 
 
270 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.613069  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4383  integrase core domain protein  38.64 
 
 
270 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.364071  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1018  integrase core domain protein  38.64 
 
 
270 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00171596  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1432  integrase catalytic subunit  39.2 
 
 
270 aa  141  1.9999999999999998e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0298  integrase catalytic subunit  39.2 
 
 
270 aa  141  1.9999999999999998e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6205  integrase catalytic subunit  39.88 
 
 
260 aa  141  3e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.346125  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1359  transposase  39.77 
 
 
278 aa  140  3e-32  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00136296  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3620  transposase  40.48 
 
 
265 aa  139  7.999999999999999e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0498053  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0564  integrase catalytic region  40.23 
 
 
278 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.22633  normal  0.244778 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2352  integrase catalytic region  40.23 
 
 
278 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.311637  normal  0.149217 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0194  transposase  39.77 
 
 
253 aa  138  2e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.501333  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0814  integrase catalytic subunit  39.76 
 
 
278 aa  138  2e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1446  integrase catalytic subunit  39.76 
 
 
278 aa  138  2e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.129999  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2564  integrase catalytic subunit  39.76 
 
 
278 aa  138  2e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.95917  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2714  integrase catalytic subunit  39.76 
 
 
278 aa  138  2e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1071  Integrase catalytic region  35.42 
 
 
544 aa  137  5e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.296403  hitchhiker  0.000000028101 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0729  Integrase catalytic region  35.42 
 
 
544 aa  137  5e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3208  Integrase catalytic region  41.32 
 
 
277 aa  136  8e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.928461 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2945  Integrase catalytic region  41.32 
 
 
277 aa  136  8e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0817746  normal  0.460878 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0974  Integrase catalytic region  41.32 
 
 
277 aa  136  8e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.382547  normal  0.109209 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1564  integrase catalytic subunit  38.86 
 
 
278 aa  135  9.999999999999999e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.403634  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2654  integrase catalytic subunit  39.43 
 
 
268 aa  134  3e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.596052  normal  0.523017 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3317  integrase catalytic subunit  39.43 
 
 
268 aa  134  3e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.817536  normal  0.265115 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1975  integrase catalytic subunit  39.43 
 
 
268 aa  133  5e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.259629 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4860  integrase catalytic subunit  38.86 
 
 
268 aa  133  5e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.434054  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0124  ISPsy8, transposase OrfB  39.88 
 
 
259 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0450  ISPsy8, transposase OrfB  39.88 
 
 
259 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0516  ISPsy8, transposase OrfB  39.88 
 
 
259 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.390784  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5066  ISPsy8, transposase OrfB  39.88 
 
 
259 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.552725  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5509  ISPsy8, transposase OrfB  39.88 
 
 
259 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.359281  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1055  integrase catalytic subunit  38.99 
 
 
252 aa  131  2.0000000000000002e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1091  integrase catalytic subunit  38.99 
 
 
252 aa  131  2.0000000000000002e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1362  integrase catalytic subunit  38.99 
 
 
252 aa  131  2.0000000000000002e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0397787 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1478  integrase catalytic subunit  38.99 
 
 
252 aa  131  2.0000000000000002e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.168577  normal  0.117043 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00533  hypothetical protein  40.65 
 
 
191 aa  130  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.207799  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03230  transposase  55.86 
 
 
209 aa  126  7e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.330594  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1197  IS3-family transposase, OrfB  37.82 
 
 
249 aa  126  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000397952  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0109  IS3-family transposase, OrfB  37.82 
 
 
249 aa  126  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0514465  hitchhiker  0.00000245789 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>